[發明專利]同時檢測甘蔗花葉病3種病原的一步法多重RT-PCR檢測方法在審
| 申請號: | 202010007660.8 | 申請日: | 2020-01-05 |
| 公開(公告)號: | CN110951924A | 公開(公告)日: | 2020-04-03 |
| 發明(設計)人: | 單紅麗;黃應昆;王曉燕;李婕;張榮躍;倉曉燕;尹炯;羅志明 | 申請(專利權)人: | 云南省農業科學院甘蔗研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 云南凌云律師事務所 53207 | 代理人: | 康珉 |
| 地址: | 661699 云南省紅河*** | 國省代碼: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 同時 檢測 甘蔗 花葉病 病原 一步法 多重 rt pcr 方法 | ||
1.同時檢測甘蔗花葉病3種病原的一步法多重RT-PCR檢測方法,3種甘蔗花葉病病原為甘蔗線條花葉病毒、高粱花葉病毒、甘蔗花葉病毒,其特征在于:
所述一步法多重RT-PCR檢測方法中采用甘蔗線條花葉病毒引物檢測甘蔗線條花葉病毒,所述甘蔗線條花葉病毒引物由SCSMV上游引物和SCSMV下游引物組成,目的片段長度為800bp,SCSMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,SCSMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;高粱花葉病毒引物檢測高粱花葉病毒,所述高粱花葉病毒引物由SrMV上游引物和SrMV下游引物組成,目的片段長度為450bp,SrMV上游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:3所示,SrMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;甘蔗花葉病毒引物檢測甘蔗花葉病毒,所述甘蔗花葉病毒引物由SCMV上游引物和SCMV下游引物組成,目的片段長度為200bp,SCMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,SCMV下游引物的核苷酸序列如SEQID NO:6所示;
檢測結果判定為:
當檢測樣品擴增到800bp大小的單一條帶時,該樣品為甘蔗線條花葉病毒陽性;若無800bp條帶,則為甘蔗線條花葉病毒陰性;
當檢測樣品擴增到450bp大小的單一條帶時,該樣品為高粱花葉病毒陽性;若無450bp條帶,則為高粱花葉病毒陰性;
當檢測樣品擴增到200bp大小的單一條帶時,該樣品為甘蔗花葉病毒陽性;若無200bp條帶,則為甘蔗花葉病毒陰性;
當檢測樣品同時擴增到上述三條條帶、或同時擴增到上述任意兩條條帶,則該樣品感染了對應的病毒。
2.根據權利要求1所述的一步法多重RT-PCR檢測方法,其特征在于:20μL一步法多重RT-PCR反應體系中有滅菌ddH2O 8.4μL,2×1Step Buffer 8.0μL,5U/μL PrimeScript 1Step Enzyme Mix 0.8μL,20μmoL/L SCSMV上、下游引物各0.25μL,20μmol/L SrMV上、下游引物各0.4μL,20μmol/L SCMV上、下游引物各0.25μL,RNA模板1.0μL;一步法多重RT-PCR反應條件為:50℃反轉錄30min,94℃預變性5min;然后94℃變性30s,62℃退火30s,72℃延伸1min,共35個循環;最后72℃延伸10min,降溫至12℃結束反應。
3.采用一步法多重RT-PCR檢測方法同時檢測甘蔗花葉病3種病原的特異性引物組,其特征在于:由甘蔗線條花葉病毒引物、高粱花葉病毒引物和甘蔗花葉病毒引物組成,甘蔗線條花葉病毒引物用于檢測甘蔗線條花葉病毒,所述甘蔗線條花葉病毒引物由SCSMV上游引物和SCSMV下游引物組成,目的片段長度為800bp,SCSMV上游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:1所示,SCSMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;高粱花葉病毒引物用于檢測高粱花葉病毒,所述高粱花葉病毒引物由SrMV上游引物和SrMV下游引物組成,目的片段長度為450bp,SrMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,SrMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;甘蔗花葉病毒引物用于檢測甘蔗花葉病毒,所述甘蔗花葉病毒引物由SCMV上游引物和SCMV下游引物組成,目的片段長度為200bp,SCMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,SCMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。
4.一種同時檢測甘蔗花葉病3種病原的一步法多重RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求3所述的采用一步法多重RT-PCR檢測方法同時檢測甘蔗花葉病3種病原的特異性引物組,所述甘蔗花葉病3種病原為甘蔗線條花葉病毒、高粱花葉病毒、甘蔗花葉病毒。
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