[發明專利]工程化長散在元件(LINE)轉座子及其使用方法在審
| 申請號: | 201980069027.7 | 申請日: | 2019-10-21 |
| 公開(公告)號: | CN112912497A | 公開(公告)日: | 2021-06-04 |
| 發明(設計)人: | 肖恩·克里斯滕森 | 申請(專利權)人: | 德克薩斯州大學系統董事會 |
| 主分類號: | C12N9/22 | 分類號: | C12N9/22;C12N15/90 |
| 代理公司: | 中科專利商標代理有限責任公司 11021 | 代理人: | 柴云峰;張瑩 |
| 地址: | 美國德*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 工程 化長散 元件 line 座子 及其 使用方法 | ||
1.RNA成分,其包含DNA靶向序列,一個或多個蛋白質結合基序(PBM)以及待整合到DNA靶位點中的目標核酸序列,其中所述DNA靶向序列,蛋白質結合基序和目標序列可操作地連接,使得它們能夠與源自親本長散在(LINE)元件蛋白質的蛋白質成分結合并逆轉錄成cDNA,所述cDNA能夠在DNA靶位點整合到DNA中。
2.根據權利要求1所述的RNA成分,其中所述蛋白質成分包含RNA結合結構域、接頭結構域、逆轉錄酶、DNA內切核酸酶中的一個或多個,其中所述一個或多個蛋白質結合基序將所述RNA成分結合至所述蛋白質成分的所述RNA結合結構域、接頭結構域、逆轉錄酶、DNA內切核酸酶或其組合。
3.根據權利要求1或2所述的RNA成分,
其中所述RNA成分包含來自或衍生自親本LINE或SINE骨架的元件,并且所述RNA成分的目標核酸序列與LINE或SINE異源;
其中所述蛋白質成分包含來自或衍生自親本LINE的元件;或
其組合。
4.根據權利要求1-3中任一項所述的RNA成分,其中所述DNA靶向序列與所述親本LINE或SINE是異源的。
5.根據權利要求1-4中任一項所述的RNA成分,其中所述目標序列編碼基因、基因的片段或功能性核酸。
6.根據權利要求1-5中任一項所述的RNA成分,其包含來自或衍生自親本LINE或SINE元件的3'PBM序列。
7.根據權利要求1-6中任一項所述的RNA成分,其包含CRISPR/Cas示蹤序列、CRISPR/Cas引導序列或其組合。
8.根據權利要求1-7中任一項所述的RNA成分,其包含來自或衍生自親本LINE或SINE元件的5'PBM序列。
9.根據權利要求8所述的RNA成分,其中所述5′PBM包含非功能性IRES序列。
10.根據權利要求1-9中任一項所述的RNA成分,其進一步包含核酶。
11.根據權利要求10所述的RNA成分,其中所述核酶是丁型肝炎病毒樣核酶。
12.根據權利要求2-10中任一項所述的RNA成分,其中所述親本LINE或SINE是限制樣內切核酸酶(RLE)LINE。
13.根據權利要求10所述的RNA成分,其中RLE LINE是R2 LINE。
14.根據權利要求3-13中任一項所述的RNA成分,其中所述RNA成分的親本LINE或SINE骨架與所述蛋白成分的親本LINE骨架是相同的LINE和/或所述SINE源自LINE的祖先或是LINE的祖先。
15.蛋白質成分,其包含DNA結合結構域、RNA結合結構域、逆轉錄酶、接頭結構域和內切核酸酶,其中所述DNA結合結構域、RNA結合結構域、逆轉錄酶、接頭結構域和內切核酸酶可操作地連接,使得它們可以在DNA靶位點與RNA成分和DNA結合,并促進RNA成分逆轉錄成cDNA,和cDNA在DNA靶位點整合到DNA中。
16.根據權利要求15所述的蛋白質成分,其中所述RNA成分包含DNA靶向序列,一個或多個蛋白質結合基序以及待整合到所述DNA靶位點的目標核酸序列。
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