[發(fā)明專利]新型基因分類器及其在自身免疫性疾病中的用途

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201980046183.1
• 申請(qǐng)日: 2019-05-07
• 公開（公告）號(hào): CN112512440A
• 公開（公告）日: 2021-03-16
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 約翰·丹尼爾·杜巴克三世;布克哈德·詹森;姚祖旭
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 德瑪泰克公司
• 主分類號(hào): A61B10/02
• 分類號(hào): A61B10/02;A61B50/30;A61P17/00
• 代理公司: 北京安信方達(dá)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11262
• 代理人: 韋昌金;武晶晶

本文公開了在疑似患有自身免疫性病癥的受試者中檢測(cè)改變的基因表達(dá)水平的方法。本文進(jìn)一步描述了在具有表現(xiàn)出改變的基因表達(dá)水平的受試者中治療自身免疫性病癥的方法。

交叉引用

本申請(qǐng)要求于2018年5月9日提交的美國(guó)臨時(shí)申請(qǐng)?zhí)?2/669,297的權(quán)益，該申請(qǐng)通過引用以其全文并入于此。

背景技術(shù)

皮膚病是人類最常見的疾病之一，并且對(duì)全球醫(yī)療保健造成重要負(fù)擔(dān)。三種皮膚病是全球十大最流行疾病，并且八種進(jìn)入前50位。如果綜合考慮，皮膚病況是導(dǎo)致多年殘疾的第二至第十一大原因。

發(fā)明內(nèi)容

在某些實(shí)施方案中，本文公開了基于分子風(fēng)險(xiǎn)因素檢測(cè)自身免疫性疾病的存在的方法。在一些情況下，本文描述了基于分子風(fēng)險(xiǎn)因素檢測(cè)銀屑病、狼瘡或特應(yīng)性皮炎的存在的方法。在一些情況下，本文還描述了基于分子風(fēng)險(xiǎn)因素監(jiān)測(cè)自身免疫性疾病(例如，銀屑病、狼瘡或特應(yīng)性皮炎)的進(jìn)展的方法。

在某些實(shí)施方案中，本文公開了在疑似患有銀屑病的受試者中檢測(cè)IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中至少兩個(gè)的基因表達(dá)水平的方法，包括：(a)從獲自所述受試者的皮膚樣品中分離核酸，其中所述皮膚樣品包括來自角質(zhì)層的細(xì)胞；以及(b)通過使所述分離的核酸與一組探針接觸，檢測(cè)IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中至少兩個(gè)的表達(dá)水平，所述一組探針識(shí)別IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個(gè)，并檢測(cè)IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個(gè)與所述一組探針之間的結(jié)合。

在某些實(shí)施方案中，本文公開了在疑似患有銀屑病的受試者中檢測(cè)來自第一基因分類器和第二基因分類器的基因表達(dá)水平的方法，包括：(a)從獲自所述受試者的皮膚樣品中分離核酸，其中所述皮膚樣品包括來自角質(zhì)層的細(xì)胞；(b)通過使所述分離的核酸與一組探針接觸，檢測(cè)來自所述第一基因分類器：IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A的一個(gè)或多個(gè)基因的表達(dá)水平，所述一組探針識(shí)別來自所述第一基因分類器的一個(gè)或多個(gè)基因，并檢測(cè)來自所述第一基因分類器的一個(gè)或多個(gè)基因與所述一組探針之間的結(jié)合；以及(c)通過使所述分離的核酸與額外的一組探針接觸，檢測(cè)來自所述第二基因分類器：IL-17C、S100A7、IL-17RA、IL-17RC、IL-23A、IL-22、IL-26、IL-24、IL-6、CXCL1、IFN-γ、IL-31、IL-33、TNFα、LCN2、CCL20和TNFRSF1A的一個(gè)或多個(gè)基因的表達(dá)水平，所述額外的一組探針識(shí)別來自所述第二基因分類器的一個(gè)或多個(gè)基因，并檢測(cè)來自所述第二基因分類器的一個(gè)或多個(gè)基因與所述額外的一組探針之間的結(jié)合。

在某些實(shí)施方案中，本文公開了用TNFα、IL-17A或IL-23的抑制劑治療受試者的方法，其中所述受試者患有銀屑病，所述方法包括以下步驟：通過從包括來自角質(zhì)層的細(xì)胞的皮膚樣品中分離核酸，并通過使所述分離的核酸與一組探針接觸，對(duì)所述皮膚樣品進(jìn)行或已進(jìn)行了表達(dá)分析，所述一組探針識(shí)別IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個(gè)，并檢測(cè)IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個(gè)與所述一組探針之間的結(jié)合，從而確定所述受試者的基因表達(dá)水平是否改變；以及如果所述受試者的IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個(gè)的基因表達(dá)水平改變，則向所述受試者施用TNFα、IL-17A或IL-23的抑制劑或提高采用所述抑制劑的治療的水平；以及如果所述受試者的IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個(gè)的基因表達(dá)水平?jīng)]有改變，則不施用所述抑制劑或終止所述抑制劑的治療。