[發明專利]新型基因分類器及其在自身免疫性疾病中的用途

在審

• 申請號: 201980046183.1
• 申請日: 2019-05-07
• 公開（公告）號: CN112512440A
• 公開（公告）日: 2021-03-16
• 發明（設計）人: 約翰·丹尼爾·杜巴克三世;布克哈德·詹森;姚祖旭
• 申請（專利權）人: 德瑪泰克公司
• 主分類號: A61B10/02
• 分類號: A61B10/02;A61B50/30;A61P17/00
• 代理公司: 北京安信方達知識產權代理有限公司 11262
• 代理人: 韋昌金;武晶晶

1.一種在疑似患有銀屑病的受試者中檢測IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中至少兩個的基因表達水平的方法，包括：

a)從獲自所述受試者的皮膚樣品中分離核酸，其中所述皮膚樣品包括來自角質層的細胞；以及

b)通過使所述分離的核酸與一組探針接觸，檢測IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中至少兩個的表達水平，所述一組探針識別IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個，并檢測IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少兩個與所述一組探針之間的結合。

2.根據權利要求1所述的方法，其中所述方法包括檢測IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A中的至少三個、至少四個或至少五個的表達水平。

3.根據權利要求1所述的方法，其中所述方法包括：

檢測IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A的表達水平；

檢測IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5和S100A9的表達水平；

檢測IL-17A、IL-17F、IL-8和CXCL5的表達水平；

檢測IL-17A、IL-17F和IL-8的表達水平；或者

檢測IL-17A和IL-17F的表達水平。

4.根據權利要求1所述的方法，其中與來自對照樣品的等同基因的基因表達水平相比，所述表達水平是上調的基因表達水平。

5.根據權利要求4所述的方法，其中IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A的基因表達水平上調。

6.根據權利要求1所述的方法，其中所述一組探針識別至少兩個但不超過六個基因。

7.根據權利要求1所述的方法，其中所述檢測包括使所述分離的核酸與額外的一組探針接觸，所述額外的一組探針識別IL-17C、S100A7、IL-17RA、IL-17RC、IL-23A、IL-22、IL-26、IL-24、IL-6、CXCL1、TNFα、LCN2、CCL20、TNFRSF1A或其組合。

8.根據權利要求7所述的方法，其中所述額外的一組探針識別一個但不超過十四個基因。

9.一種在疑似患有銀屑病的受試者中檢測來自第一基因分類器和第二基因分類器的基因表達水平的方法，包括：

a)從獲自所述受試者的皮膚樣品中分離核酸，其中所述皮膚樣品包括來自角質層的細胞；

b)通過使所述分離的核酸與一組探針接觸，檢測來自所述第一基因分類器：IL-17A、IL-17F、IL-8、CXCL5、S100A9和DEFB4A的一個或多個基因的表達水平，所述一組探針識別來自所述第一基因分類器的一個或多個基因，并檢測來自所述第一基因分類器的一個或多個基因與所述一組探針之間的結合；以及

c)通過使所述分離的核酸與額外的一組探針接觸，檢測來自所述第二基因分類器：IL-17C、S100A7、IL-17RA、IL-17RC、IL-23A、IL-22、IL-26、IL-24、IL-6、CXCL1、IFN-γ、IL-31、IL-33、TNFα、LCN2、CCL20和TNFRSF1A的一個或多個基因的表達水平，所述額外的一組探針識別來自所述第二基因分類器的一個或多個基因，并檢測來自所述第二基因分類器的一個或多個基因與所述額外的一組探針之間的結合。