[發明專利]微陣列變換器

有效

• 申請號: 201980033002.1
• 申請日: 2019-05-15
• 公開（公告）號: CN112218708B
• 公開（公告）日: 2023-06-16
• 發明（設計）人: 金特·羅特;斯特凡·丹尼爾·克拉默;約翰內斯·沃爾勒
• 申請（專利權）人: 生物復制有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 北京銀龍知識產權代理有限公司 11243
• 代理人: 鐘海勝;宋琴芝

本發明涉及一種用于微陣列變換的方法，其中，通過使用具有變換矩陣的腔芯片能夠將原始陣列拷貝到平面載體上，并且信息或空間排列改變，從而產生變換的第二陣列。本發明還涉及一種用于執行這種方法的裝置。

技術領域

本發明涉及一種用于微陣列變換的方法，其中，通過使用具有變換矩陣的腔芯片，能夠將原始陣列拷貝到平面載體上，并且信息或空間排列改變，從而產生變換的第二陣列。本發明還涉及一種用于執行這種方法的裝置。

背景技術

DNA微陣列被理解為表示在固體基質上具有DNA的多個不同點樣的集合。在DNA微陣列的生產中，原則上在三種不同的生產類型之間有所區分：

1.點樣的DNA微陣列

a.微陣列點樣儀[8]

2.原位合成的DNA微陣列

a.點樣合成：噴墨印刷[2]、[3]

b.通過光掩模進行的光刻[10]

c.通過微鏡進行的光刻[9]

3.通過DNA聚合酶進行的合成

一種用于生產DNA微陣列的相對較新的方法在于使用DNA模板通過聚合酶在表面上合成DNA(WO2009034181A2，WO2010100265A1)。在此，在固體表面上設置有所謂的引物(DNA聚合酶的合成起始點)。隨后，將由各個合成組分、DNA聚合酶和模板所組成的混合物涂覆到相同表面上。此處的合成在多達數千個點樣上高度并行。為了確保獨立的合成反應，這些點樣中每一個的反應空間已經在物理上彼此分離。這能夠表示通過微腔進行空間分離，直到限制擴散為止。

生產類型之間的基本區別在于：DNA分子在(1)中是預先生產的，而在(2和3)中是在DNA微陣列的制備過程中生產的。

在所有上述用于DNA微陣列的生產技術中，在每種情況下都是新制備單個陣列，即，完全從頭開始制備。為此，存在一些方法，其目的是復制已經存在的DNA微陣列：

通過雜交來復制DNA微陣列：

在此，來自DNA庫的互補DNA鏈被雜交到現有的DNA微陣列上。互補DNA分子在每種情況下均具有反應性基團，借助于反應性基團能夠將其連接至第二基質，使兩者相互接觸。然后，該基質含有原始DNA微陣列的互補DNA分子，并且具有相同的空間分辨率。以這種方式產生的拷貝與模擬照片的底片([4]、[5]、[6]、[11]、[12]，US20060141245A1，WO2006112815A2)相當。

通過雜交進行的DNA微陣列的復制和通過DNA聚合酶進行的延伸：

該方法與上述方法非常相似。然而，雜交的DNA分子比待復制的DNA微陣列的DNA分子短得多。在這種情況下，雜交的DNA分子被用作通過DNA聚合酶進行的DNA延伸反應的引物。聚合酶是能夠使用模板來延伸DNA鏈的酶。通過這種方法，原則上能夠復制具有長DNA分子的DNA微陣列。以這種方式產生的拷貝與模擬照片的底片([6]，US20100256017A1，WO2008022332A2)相當。

通過主腔芯片和隨后的PCR進行的復制：

主腔芯片在其表面上具有DNA引物，其與已經存在的DNA微陣列的DNA互補。用PCR混合物填充該芯片，并將其放置到待復制的DNA微陣列上。通過PCR，DNA微陣列的DNA的信息被轉移到主腔芯片中并進行存儲。在第二步驟中，再次用PCR混合物填充腔芯片，并且將空的微陣列板放置到芯片上方以將其封閉。隨后，再次進行PCR，以將DNA分子從主腔芯片轉移到新表面。因此，這代表原始DNA微陣列(WO2010100265A1)的精確拷貝。

在現有技術中，不存在能夠根據需要來復制和修飾(變換)現有DNA微陣列的方法。