[發明專利]微陣列變換器

有效

• 申請號: 201980033002.1
• 申請日: 2019-05-15
• 公開（公告）號: CN112218708B
• 公開（公告）日: 2023-06-16
• 發明（設計）人: 金特·羅特;斯特凡·丹尼爾·克拉默;約翰內斯·沃爾勒
• 申請（專利權）人: 生物復制有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 北京銀龍知識產權代理有限公司 11243
• 代理人: 鐘海勝;宋琴芝

1.一種用于微陣列變換的方法，包括以下步驟：

a)提供模板陣列，其中，所述模板陣列包括具有模板分子的多個點樣，并且其中，所述模板分子為寡核苷酸，

b)提供包括轉移矩陣的腔芯片，

c)在所述腔芯片中提供反應混合物，

d)將所述模板陣列放置在所述腔芯片上，

e)拷貝過程，其中，將所述模板陣列的點樣的寡核苷酸拷貝到所述腔芯片上，

f)提供陣列表面，

g)在所述腔芯片中提供反應混合物，

h)將所述陣列表面放置在所述腔芯片上，

i)拷貝過程，其中，所述腔芯片的點樣的寡核苷酸以DNA、RNA或蛋白質的形式拷貝到所述陣列表面上，并且其中，新形成的額外陣列在點樣形狀、點樣尺寸、和/或點樣位置方面與所述模板陣列不同，

其中，通過腔芯片的腔的形狀給出所得變換點樣的產生的形狀，

并且其中，當新形成的額外陣列在點樣位置方面不同，并且當相同的模板陣列被多次拷貝到相同的腔芯片中時，特別有利的是，在重復期間，模板陣列和腔芯片相對于彼此以改變的取向進行布置，

并且其中，當新形成的額外陣列在點樣尺寸方面不同時，所述模板陣列的多個點樣在所述腔芯片和/或額外陣列中合并，從而產生模板分子或由其衍生的分子的混合物，和/或產生DNA或RNA，所述DNA或RNA包含來自各自點樣的模板分子的多個部分序列或這些部分序列的衍生物，并且在變換為較小尺寸的情況下，所述模板陣列的至少一個點樣在所述額外陣列中被細分為多個點樣。

2.根據權利要求1所述的方法，其中，新形成的額外陣列進一步在點樣信息方面與所述模板陣列不同，并且其中所述分子的修飾、延伸、縮短、衍生和/或倒位發生在所述腔芯片的腔中和/或在所述拷貝過程中。

3.根據權利要求1或2所述的方法，其中，步驟a)至步驟e)至少重復一次，其中，使用相同的腔芯片但使用不同的模板陣列，或者以不同或相同的取向使用相同的模板陣列。

4.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述拷貝步驟包括擴增步驟。

5.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述反應混合物是PCR混合物、等溫擴增混合物、逆轉錄混合物、轉錄混合物或無細胞表達混合物。

6.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述模板分子為DNA分子或RNA分子。

7.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述腔芯片的腔涂覆有引物。

8.根據權利要求7所述的方法，其中，在引物的3'末端或5'末端上攜帶額外DNA序列。

9.根據權利要求1或2所述的方法，其中，至少兩個模板陣列的點樣合并到所述額外陣列中，從而產生拷貝的混合物，和/或產生拷貝，其包含來自各自點樣的模板分子的多個部分序列或這些部分序列的衍生物。

10.根據權利要求1或2所述的方法，其中，在溶液中添加額外DNA分子，使得該分子通過這種DNA序列而被延伸或改變。

11.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述模板分子為DNA分子，其全部或部分具有為10～30個堿基對的短的相同DNA序列。

12.根據權利要求8所述的方法，其中，所述額外DNA序列能被用作位置信息的條形碼，和/或所述引物能含有用于轉錄和/或無細胞合成的序列。

13.根據權利要求1或2所述的方法，其中，所述變換在空間和/或時間上受到限制。