[發明專利]具有去除宿主基因組DNA功能的微生物核酸提取方法以及試劑盒在審
| 申請號: | 201911352458.2 | 申請日: | 2019-12-25 |
| 公開(公告)號: | CN111057747A | 公開(公告)日: | 2020-04-24 |
| 發明(設計)人: | 黃超杰;魯津津;崔望 | 申請(專利權)人: | 深圳華大智造科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6806 | 分類號: | C12Q1/6806;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人: | 白艷 |
| 地址: | 518000 廣東省深圳*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 具有 去除 宿主 基因組 dna 功能 微生物 核酸 提取 方法 以及 試劑盒 | ||
1.一種成套引物對,包括1個或多個引物對,每個所述引物對對應擴增宿主基因組DNA中的1個或多個高度重復序列;
所述高度重復序列任選自以下基因家族和/或其他基因;
所述基因家族包括MIR家族基因和/或ALu家族基因。
2.根據權利要求1所述的成套引物對,其特征在于:所述成套引物對由如下1)-5)所示的引物組成:
1)所示的引物為MIRB引物對1和/或MIRB引物對2;
2)所示的引物為MIRAC引物對1和/或MIRAC引物對2;
3)所示的引物為MIRc引物對1和/或MIRc引物對2;
4)所示的引物為MIR3引物對1和/或MIR3引物對2;
5)所示的引物為Alu引物對1和/或Alu引物對2;
所述MIRB引物對1由序列1所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列2所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述MIRB引物對2由序列3所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列4所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述MIRAC引物對1由序列5所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列6所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述MIRAC引物對2由序列7所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列8所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述MIRc引物對1由序列9所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列10所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述MIRc引物對2由序列11所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列12所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述MIR3引物對1由序列13所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列14所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述MIR3引物對2由序列15所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列16所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述Alu引物對1由序列17所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列18所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;
所述Alu引物對2由序列19所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列20所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成。
3.根據權利要求2所述的成套引物對,其特征在于:
每條所述單鏈DNA分子的衍生物為將該條單鏈DNA分子的核苷酸序列經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與該條單鏈DNA分子具有相同功能的DNA分子;
或,所述各個引物對中每條引物的5'末端均標記用于連接介質的基團;
或,所述宿主為人。
4.權利要求1-3任一所述的成套引物對在制備捕獲探針中的應用。
5.捕獲探針組,由多個捕獲探針組成;所述每一個捕獲探針按照如下方法制備:權利要求1-3任一所述的成套引物對中的一個引物對擴增所述宿主的基因組DNA,得到兩端標記所述基團的擴增產物,即為捕獲探針。
6.一種捕獲宿主基因組DNA的試劑盒,包括1)-5)中任一種:
1)權利要求1-3任一所述的成套引物對;
2)權利要求5所述的捕獲探針組;
3)捕獲介質;所述捕獲介質為將權利要求5所述的捕獲探針組固定到介質上得到;
4)權利要求1-3任一所述的成套引物對和所述介質;
5)權利要求5所述的捕獲探針組和所述介質。
7.權利要求1-3任一所述的成套引物對、權利要求5所述的捕獲探針或權利要求6所述的試劑盒在如下a和/或b中的應用或者在制備具有如下a和/或b功能的產品中的應用:
1)捕獲宿主基因組DNA;
2)去除宿主基因組DNA提取微生物核酸。
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