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[發明專利]具有去除宿主基因組DNA功能的微生物核酸提取方法以及試劑盒在審

專利信息
申請號: 201911352458.2 申請日: 2019-12-25
公開(公告)號: CN111057747A 公開(公告)日: 2020-04-24
發明(設計)人: 黃超杰;魯津津;崔望 申請(專利權)人: 深圳華大智造科技有限公司
主分類號: C12Q1/6806 分類號: C12Q1/6806;C12N15/11
代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 代理人: 白艷
地址: 518000 廣東省深圳*** 國省代碼: 廣東;44
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 具有 去除 宿主 基因組 dna 功能 微生物 核酸 提取 方法 以及 試劑盒
【權利要求書】:

1.一種成套引物對,包括1個或多個引物對,每個所述引物對對應擴增宿主基因組DNA中的1個或多個高度重復序列;

所述高度重復序列任選自以下基因家族和/或其他基因;

所述基因家族包括MIR家族基因和/或ALu家族基因。

2.根據權利要求1所述的成套引物對,其特征在于:所述成套引物對由如下1)-5)所示的引物組成:

1)所示的引物為MIRB引物對1和/或MIRB引物對2;

2)所示的引物為MIRAC引物對1和/或MIRAC引物對2;

3)所示的引物為MIRc引物對1和/或MIRc引物對2;

4)所示的引物為MIR3引物對1和/或MIR3引物對2;

5)所示的引物為Alu引物對1和/或Alu引物對2;

所述MIRB引物對1由序列1所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列2所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述MIRB引物對2由序列3所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列4所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述MIRAC引物對1由序列5所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列6所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述MIRAC引物對2由序列7所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列8所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述MIRc引物對1由序列9所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列10所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述MIRc引物對2由序列11所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列12所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述MIR3引物對1由序列13所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列14所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述MIR3引物對2由序列15所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列16所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述Alu引物對1由序列17所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列18所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成;

所述Alu引物對2由序列19所示的單鏈DNA分子或其衍生物和序列20所示的單鏈DNA分子或其衍生物組成。

3.根據權利要求2所述的成套引物對,其特征在于:

每條所述單鏈DNA分子的衍生物為將該條單鏈DNA分子的核苷酸序列經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與該條單鏈DNA分子具有相同功能的DNA分子;

或,所述各個引物對中每條引物的5'末端均標記用于連接介質的基團;

或,所述宿主為人。

4.權利要求1-3任一所述的成套引物對在制備捕獲探針中的應用。

5.捕獲探針組,由多個捕獲探針組成;所述每一個捕獲探針按照如下方法制備:權利要求1-3任一所述的成套引物對中的一個引物對擴增所述宿主的基因組DNA,得到兩端標記所述基團的擴增產物,即為捕獲探針。

6.一種捕獲宿主基因組DNA的試劑盒,包括1)-5)中任一種:

1)權利要求1-3任一所述的成套引物對;

2)權利要求5所述的捕獲探針組;

3)捕獲介質;所述捕獲介質為將權利要求5所述的捕獲探針組固定到介質上得到;

4)權利要求1-3任一所述的成套引物對和所述介質;

5)權利要求5所述的捕獲探針組和所述介質。

7.權利要求1-3任一所述的成套引物對、權利要求5所述的捕獲探針或權利要求6所述的試劑盒在如下a和/或b中的應用或者在制備具有如下a和/或b功能的產品中的應用:

1)捕獲宿主基因組DNA;

2)去除宿主基因組DNA提取微生物核酸。

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