[發明專利]rRNA捕獲探針及其應用有效
| 申請號： | 201911152414.5 | 申請日： | 2019-11-22 |
| 公開（公告）號： | CN110878298B | 公開（公告）日： | 2023-09-15 |
| 發明（設計）人： | 王君文;胡琪;蘇錦玲;高飛 | 申請（專利權）人： | 深圳市易基因科技有限公司 |
| 主分類號： | C12N15/11 | 分類號： | C12N15/11;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 深圳市徽正知識產權代理有限公司 44405 | 代理人： | 盧杏艷 |
| 地址： | 518000 廣東省深圳市坪山區坑梓街道秀*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | rrna 捕獲 探針 及其 應用 | ||
1.一種藍細菌的rRNA捕獲探針，其特征在于，其由如下三組rRNA捕獲探針混合后制成；其中，
5SrRNA探針序列組由SEQ?ID?No.1和SEQ?ID?No.2組成；
16SrRNA探針序列組由SEQ?ID?No.3至SEQ?ID?No.24組成；
23SrRNA探針序列組由SEQ?ID?No.25至SEQ?ID?No.76組成；
每條rRNA捕獲探針的長度范圍為30bp-120bp；相鄰的rRNA捕獲探針之間的長度間距小于30bp。
2.根據權利要求1所述的rRNA捕獲探針，其特征在于，所述rRNA捕獲探針還包括生物素標記。
3.一種全轉錄組測序檢測方法，其特征在于，應用如權利要求1所述的rRNA捕獲探針捕獲并去除樣本總RNA中的rRNA。
4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，每種rRNA捕獲探針的摩爾濃度為0.1uM-1uM；所述樣本總RNA的投入量為50ug-10ng，濃度大于等于5ng/uL。
5.根據權利要求4所述的方法，其特征在于，每種所述rRNA捕獲探針的摩爾濃度為0.5uM。
6.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，應用所述的rRNA捕獲探針捕獲并去除樣本總RNA中的rRNA，具體包括：
在雜交緩沖體系中，將所述rRNA捕獲探針與所述樣本總RNA進行雜交，形成DNA-RNA雜合鏈；
在雜交完成后，在核糖核酸酶H的作用下，特異性的消化DNA-RNA雜合鏈中的rRNA；
在脫氧核糖核酸酶I的作用下，特異性的消化所述rRNA捕獲探針。
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