[發明專利]蛋白質數據獲取方法、裝置、計算機設備及存儲介質

有效

• 申請號: 201911097122.6
• 申請日: 2019-11-11
• 公開（公告）號: CN110853704B
• 公開（公告）日: 2020-11-06
• 發明（設計）人: 吳家祥;黃俊洲
• 申請（專利權）人: 騰訊科技（深圳）有限公司
• 主分類號: G16B15/20
• 分類號: G16B15/20;G16B30/00
• 代理公司: 北京三高永信知識產權代理有限責任公司 11138
• 代理人: 邢惠童

本申請實施例公開了一種蛋白質數據獲取方法、裝置、計算機設備及存儲介質，屬于計算機技術領域。該方法包括：根據蛋白質的氨基酸序列信息，獲取氨基酸序列信息的序列特征，基于數據獲取模型，獲取蛋白質的第一主鏈二面角和第一二級結構，基于第一轉換模型，獲取與第一二級結構對應的第二主鏈二面角，基于第二轉換模型，獲取與第一主鏈二面角對應的第二二級結構。該方法由于第一轉換模型的輸入為第一二級結構，第二轉換模型的輸入為第一主鏈二面角，考慮了二級結構和主鏈二面角之間的關聯關系，保證了獲取的第二主鏈二面角和第二二級結構的一致性，提高了獲取的二級結構和主鏈二面角的精確度。

技術領域

本申請實施例涉及計算機技術領域，特別涉及一種蛋白質數據獲取方法、裝置、計算機設備及存儲介質。

背景技術

蛋白質在生物體中具有極其重要的作用，其作用主要由蛋白質的結構決定，而蛋白質的二級結構和主鏈二面角是預測蛋白質結構的基礎，如何獲取準確的蛋白質二級結構和主鏈二面角具有重要的研究意義。

相關技術中，將獲取蛋白質的二級結構和獲取蛋白質的主鏈二面角作為兩個獨立的問題，分別提出了獲取二級結構和獲取主鏈二面角的方法。但是并未考慮二級結構和主鏈二面角之間的關聯關系，因此無法保證所獲取的二級結構和主鏈二面角的一致性，且所獲取的二級結構和主鏈二面角的精確度低。

發明內容

本申請實施例提供了一種蛋白質數據獲取方法、裝置、計算機設備及存儲介質，可以解決相關技術存在的獲取的二級結構和主鏈二面角精確度低的問題。所述技術方案如下：

一方面，提供了一種蛋白質數據獲取方法，所述方法包括：

根據蛋白質的氨基酸序列信息，獲取所述氨基酸序列信息的序列特征；

將所述序列特征輸入至數據獲取模型，基于所述數據獲取模型，獲取所述蛋白質的第一主鏈二面角和第一二級結構；

將所述序列特征和所述第一二級結構輸入至第一轉換模型，基于所述第一轉換模型，獲取與所述第一二級結構對應的第二主鏈二面角；

將所述序列特征和所述第一主鏈二面角輸入至第二轉換模型，基于所述第二轉換模型，獲取與所述第一主鏈二面角對應的第二二級結構。

另一方面，提供了一種模型訓練方法，所述方法包括：

根據多個樣本蛋白質的三級結構和氨基酸序列信息，獲取第一樣本數據、第二樣本數據和第三樣本數據，每條樣本數據包括一個樣本蛋白質的序列特征、樣本主鏈二面角和樣本二級結構；

根據所述第一樣本數據，訓練第一轉換模型；

根據所述第二樣本數據，訓練第二轉換模型；

根據所述第三樣本數據及已訓練的第一轉換模型和第二轉換模型，訓練數據獲取模型。

另一方面，提供了一種蛋白質數據獲取裝置，所述裝置包括：

特征獲取模塊，用于根據蛋白質的氨基酸序列信息，獲取所述氨基酸序列信息的序列特征；

第一數據獲取模塊，用于將所述序列特征輸入至數據獲取模型，基于所述數據獲取模型，獲取所述蛋白質的第一主鏈二面角和第一二級結構；

主鏈二面角獲取模塊，用于將所述序列特征和所述第一二級結構輸入至第一轉換模型，基于所述第一轉換模型，獲取與所述第一二級結構對應的第二主鏈二面角；

二級結構獲取模塊，用于將所述序列特征和所述第一主鏈二面角輸入至第二轉換模型，基于所述第二轉換模型，獲取與所述第一主鏈二面角對應的第二二級結構。

可選地，所述裝置還包括：

三級結構獲取模塊，用于根據所述第二主鏈二面角和所述第二二級結構，確定所述蛋白質的三級結構。