[發明專利]煙曲霉的實時熒光RPA檢測試劑盒及其專用引物和探針有效
| 申請號: | 201911055768.8 | 申請日: | 2019-10-31 |
| 公開(公告)號: | CN110760605B | 公開(公告)日: | 2022-12-09 |
| 發明(設計)人: | 田曙光;韓黎;陳芳艷;蘇雪婷;胡穎嵩;陳勇;趙靜雅 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍疾病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/68 |
| 代理公司: | 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 劉娜 |
| 地址: | 100071*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 曲霉 實時 熒光 rpa 檢測 試劑盒 及其 專用 引物 探針 | ||
1.一種用于RPA檢測的引物組合物,其特征在于,包括:
正向引物,所述正向引物為SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,
反向引物,所述反向引物為SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列。
2.一種試劑盒,其特征在于,包括:權利要求1所述的引物組合物。
3.根據權利要求2所述的試劑盒,其特征在于,進一步包括:探針,所述探針為SEQ IDNO:3所示的核苷酸序列。
4.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述探針的3’端標記有阻抑聚合酶延伸或擴增的基團,所述探針自5’端起第31位堿基標記有熒光基團,所述探針自5’端起第35位堿基標記有淬滅基團,所述探針自5’端起第32位堿基被THF替代。
5.根據權利要求4所述的試劑盒,其特征在于,所述阻抑聚合酶延伸或擴增的基團為磷酸基團。
6.根據權利要求4所述的試劑盒,其特征在于,所述熒光基團為FAM。
7.根據權利要求4所述的試劑盒,其特征在于,所述淬滅基團為BHQ。
8.根據權利要求2~7任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述正向引物與所述反向引物的摩爾濃度比為1:1。
9.根據權利要求8所述的試劑盒,其特征在于,所述探針與所述正向引物的摩爾濃度比為1:1。
10.權利要求1所述的引物組合物在制備試劑盒中的用途,所述試劑盒用于檢測煙曲霉其特征在于,所述檢測包括:
1)以待測樣品DNA為模板,利用權利要求1所述的引物組合物或權利要求2~9任一項所述的試劑盒對所述待測樣品DNA進行RPA檢測;
2)基于檢測結果,確定待測樣品中是否含有煙曲霉。
11.根據權利要求10所述的用途,其特征在于,進一步包括:
步驟1)之前,預先將攜帶煙曲霉anxC4基因的質粒作為標準品,以不同濃度的標準品作為模板,并利用權利要求1所述的引物組合物或權利要求2~9任一項所述的試劑盒對所述標準品進行RPA檢測,
步驟2)是通過如下方式進行的:
基于待測樣品與所述標準品的檢測結果,確定待測樣品中煙曲霉的濃度。
12.根據權利要求11所述的用途,其特征在于,所述攜帶煙曲霉anxC4基因的質粒為pMD19-T-anxC4。
13.根據權利要求12所述的用途,其特征在于,所述pMD19-T-anxC4質粒中,anxC4基因位于pMD19-T質粒的431bp位點和432bp位點之間。
14.根據權利要求12所述的用途,其特征在于,所述pMD19-T-anxC4質粒具有如圖2所示的物理圖譜。
15.根據權利要求10~14中任一項所述的用途,其特征在于,所述待測樣品DNA來源于包括選自分離的菌體,痰、肺泡灌洗液,血液和咽拭子的至少之一。
16.根據權利要求10~14中任一項所述的用途,其特征在于,所述RPA檢測是在溫度為37~42℃的條件下進行15~25分鐘。
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