[發(fā)明專(zhuān)利]針對(duì)NOTCH通路蛋白的SRM/MRM分析在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201911032319.1 | 申請(qǐng)日： | 2019-10-28 |
| 公開(kāi)（公告）號(hào)： | CN111122686A | 公開(kāi)（公告）日： | 2020-05-08 |
| 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人： | 托德·哈姆布拉夫;法比奧拉·切基;S·施瓦茲;K·斯科特 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人： | 愛(ài)科譜迅病理研究公司 |
| 主分類(lèi)號(hào)： | G01N27/62 | 分類(lèi)號(hào)： | G01N27/62;G01N33/574 |
| 代理公司： | 北京潤(rùn)平知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11283 | 代理人： | 劉依云;喬雪微 |
| 地址： | 美國(guó)馬*** | 國(guó)省代碼： | 暫無(wú)信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 針對(duì) notch 通路 蛋白 srm mrm 分析 | ||
1.一種測(cè)定福爾馬林固定組織的生物樣品中蛋白質(zhì)水平的方法，該方法包括：
通過(guò)質(zhì)譜檢測(cè)和/或定量來(lái)自所述生物樣品的蛋白質(zhì)消化物中的一種或多種修飾或未修飾片段肽的量；以及計(jì)算所述樣品中所述蛋白質(zhì)的水平；
其中所述蛋白質(zhì)選自由以下各項(xiàng)組成的組中：DLL1蛋白、DLL3蛋白、JAG1蛋白、JAG2蛋白、Notch1蛋白、Notch2蛋白、Notch3蛋白、Notch4蛋白和DLL4蛋白。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，進(jìn)一步包括在檢測(cè)和/或定量所述一種或多種修飾或未修飾片段肽的量之前分離所述蛋白質(zhì)消化物的步驟。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其中，所述分離步驟選自由以下各項(xiàng)組成的組中：液相色譜、納米反相液相色譜、高效液相色譜和反相高效液相色譜。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)消化物包括蛋白酶消化物。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)消化物包括胰蛋白酶消化物。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述質(zhì)譜包括串聯(lián)質(zhì)譜、離子阱質(zhì)譜、三重四級(jí)桿質(zhì)譜、離子阱/四級(jí)桿混合質(zhì)譜、MALDI-TOF質(zhì)譜、MALDI質(zhì)譜和/或飛行時(shí)間質(zhì)譜。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法，其中，所用的質(zhì)譜的模式是選擇反應(yīng)監(jiān)測(cè)(SRM)、多反應(yīng)監(jiān)測(cè)(MRM)、多選擇反應(yīng)監(jiān)測(cè)(mSRM)和/或智能選擇反應(yīng)監(jiān)測(cè)(iSRM)。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是DLL1，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：1和/或SEQ ID NO：2所示的肽。
9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是DLL3，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：3和/或SEQ ID NO：4所示的肽。
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是JAG1，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：5和/或SEQ ID NO：6所示的肽。
11.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是JAG2，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：7和/或SEQ ID NO：8所示的肽。
12.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是Notch1，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：9和/或SEQ ID NO：10所示的肽。
13.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是Notch2，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：11和/或SEQ ID NO：12所示的肽。
14.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是Notch3，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：13和/或SEQ ID NO：14所示的肽。
15.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是Notch4，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：15和/或SEQ ID NO：16所示的肽。
16.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述蛋白質(zhì)是DLL4，且所述一種或多種片段肽是SEQ ID NO：17和/或SEQ ID NO：18所示的肽。
17.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述組織是石蠟包埋的組織。
18.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述組織獲自腫瘤。
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