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[發(fā)明專利]紅耳龜檢測方法及用于檢測紅耳龜?shù)腜CR引物有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201911003998.X 申請日: 2019-10-22
公開(公告)號: CN110564868B 公開(公告)日: 2022-11-29
發(fā)明(設(shè)計)人: 董姍姍;章嫡妮;劉燕;張振華;盧曉強(qiáng);于賜剛 申請(專利權(quán))人: 生態(tài)環(huán)境部南京環(huán)境科學(xué)研究所
主分類號: C12Q1/6888 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 重慶百潤洪知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 50219 代理人: 郝艷平
地址: 210018 江*** 國省代碼: 江蘇;32
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 紅耳龜 檢測 方法 用于 pcr 引物
【說明書】:

發(fā)明提供一種紅耳龜檢測方法及用于檢測紅耳龜?shù)腜CR引物,涉及紅耳龜檢測技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明可以通過獲取多種不同龜類對應(yīng)的多組DNA,采用正向引物KM216748F和反向引物KM216748R,其中,正向引物KM216748F的引物序列為:5′?TCTCAATTTTCTTCTAGGGT?3′、反向引物KM216748R的引物序列為:5′?GTTAGATGTTGTGGGTTA?3′,分別對多組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),得到對應(yīng)的多組PCR產(chǎn)物,分別對多組PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測,確定電泳檢測結(jié)果中存在電泳條帶的PCR產(chǎn)物對應(yīng)的DNA為紅耳龜?shù)腄NA,實現(xiàn)了對紅耳龜?shù)奶禺愋詸z測,可以為外來入侵物種紅耳龜?shù)囊巴夥植伎焖僮R別提供有效手段,能夠減少針對紅耳龜進(jìn)行防控時的耗時和成本,識別和監(jiān)測紅耳龜?shù)男矢摺?/p>

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及紅耳龜檢測技術(shù)領(lǐng)域,具體而言,涉及一種紅耳龜檢測方法及用于檢測紅耳龜?shù)腜CR引物。

背景技術(shù)

紅耳龜(Trachemys scripta elegans)因人工放生等原因進(jìn)入野外自然環(huán)境,呈蔓延態(tài)勢,已嚴(yán)重威脅棲息環(huán)境的本土龜類及生物多樣性。因此,快速掌握紅耳龜野外分布狀況,開展早期的預(yù)警監(jiān)測,是對其進(jìn)行有效防控的關(guān)鍵。

目前,針對紅耳龜進(jìn)行防控所采取的方式通常為:通過野外調(diào)查、標(biāo)本采集或拍照取證等方式,對野外的紅耳龜進(jìn)行識別和監(jiān)測,從而掌握紅耳龜?shù)囊巴夥植紶顩r,進(jìn)而實現(xiàn)預(yù)警監(jiān)測。

但是,上述現(xiàn)有針對紅耳龜進(jìn)行防控所采取的方式較為耗時費力、識別和監(jiān)測紅耳龜?shù)男瘦^為低下。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明提供一種紅耳龜檢測方法及用于檢測紅耳龜?shù)腜CR引物,可以實現(xiàn)對紅耳龜?shù)目焖贆z測。

第一方面,本發(fā)明實施例提供一種紅耳龜檢測方法,包括:

獲取多種不同龜類對應(yīng)的多組脫氧核糖核酸DNA;

采用正向引物KM216748F和反向引物KM216748R,分別對多組DNA進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)絇CR擴(kuò)增反應(yīng),得到對應(yīng)的多組PCR產(chǎn)物;正向引物KM216748F的引物序列為:5‘-TCTCAATTTTCTTCTAGGGT-3’;反向引物KM216748R的引物序列為:5‘-GTTAGATGTTGTGGGTTA-3’;

分別對多組PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測,確定電泳檢測結(jié)果中存在電泳條帶的PCR產(chǎn)物對應(yīng)的DNA為紅耳龜?shù)腄NA。

可選地,上述分別對多組PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測,包括:

采用瓊脂糖凝膠對每組PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測。

可選地,上述確定電泳檢測結(jié)果中存在電泳條帶的PCR產(chǎn)物對應(yīng)的DNA為紅耳龜?shù)腄NA,包括:

對于每組PCR產(chǎn)物對應(yīng)的電泳檢測結(jié)果:

判斷PCR產(chǎn)物對應(yīng)的電泳檢測結(jié)果中是否出現(xiàn)148堿基對bp大小的特征條帶;

若PCR產(chǎn)物對應(yīng)的電泳檢測結(jié)果中出現(xiàn)148bp大小的特征條帶,則確定PCR產(chǎn)物對應(yīng)的DNA為紅耳龜?shù)腄NA。

可選地,瓊脂糖凝膠的濃度為1.5%。

可選地,上述獲取多種不同龜類對應(yīng)的多組DNA,包括:

獲取多種不同龜類對應(yīng)的多組樣本組織;

采用丹尼斯血液和組織試劑盒DNeasy Blood Tissue Kit提取每組樣本組織的DNA,得到多組DNA。

可選地,上述采用正向引物KM216748F和反向引物KM216748R,分別對多組DNA進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)絇CR擴(kuò)增反應(yīng),包括:

對于每組DNA:

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