[發明專利]不同地區玉米粗縮病病原物的遺傳變異分析方法在審
| 申請號： | 201910936016.6 | 申請日： | 2019-09-29 |
| 公開（公告）號： | CN110747291A | 公開（公告）日： | 2020-02-04 |
| 發明（設計）人： | 鐵雙貴;岳潤清;趙志杰;劉璐;陳娜;徐心志;盧董華 | 申請（專利權）人： | 河南省農業科學院 |
| 主分類號： | C12Q1/70 | 分類號： | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12R1/94 |
| 代理公司： | 41123 河南科技通律師事務所 | 代理人： | 樊羿;張曉輝 |
| 地址： | 450002 河*** | 國省代碼： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 遺傳變異分析 可信 總RNA為模板 玉米粗縮病 葉片總RNA 比對分析 分析比對 堿基突變 樣本提取 遺傳變異 病原物 反轉錄 同源性 氨基酸 測序 侵染 葉片 病害 樣本 病毒 回收 研究 | ||
【權利要求書】：
1.一種不同地區玉米粗縮病病原物的遺傳變異分析方法，其特征在于，包括以下步驟：
（1）取待測玉米粗縮病染病植物的葉片樣本，分別提取葉片總RNA；
（2）以所述總RNA為模板，分別利用核苷酸序列如SEQ ID NO.2的引物進行反轉錄，得cDNA；
（3）以所述cDNA為模板，分別利用核苷酸序列如SEQ ID NO.1的引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.2的引物進行RT-PCR；
（4）將各RT-PCR擴增產物純化回收后測序，分析比對出可信序列；
（5）將各可信序列與RBSDV的S9序列進行比對分析樣本的同源性、堿基突變、氨基酸的改變情況。
2.依據權利要求1所述的不同地區玉米粗縮病病原物的遺傳變異分析方法，其特征在于，在所述步驟（3）中，RT-PCR的反應程序為：
94℃ 5min；94℃ 1min；60℃ 1min；72℃ 70s 35個循環；72℃10min；4℃保存。
3.根據權利要求1所述的不同地區玉米粗縮病病原物的遺傳變異分析方法，其特征在于，在所述步驟（4）中，采用 Clustal W 2.1分析比對可信序列。
4.根據權利要求1所述的不同地區玉米粗縮病病原物的遺傳變異分析方法，其特征在于，在所述步驟（5）中，采用DNA man或Clustal W 2.1比對分析。
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