[發明專利]一種葉綠體DNA的富集方法在審
| 申請號: | 201910876698.6 | 申請日: | 2019-09-17 |
| 公開(公告)號: | CN110734907A | 公開(公告)日: | 2020-01-31 |
| 發明(設計)人: | 林芹;龍歡;袁方;陶曄;曾亮;林愛婷 | 申請(專利權)人: | 上海凌恩生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 31260 上海晨皓知識產權代理事務所(普通合伙) | 代理人: | 成麗杰 |
| 地址: | 201800 上海市嘉*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 葉綠體DNA 測序 富集 細胞核DNA 分子生物學技術 植物基因組DNA 甲基化位點 測序數據 植物細胞 準確度 蛋白A 磁珠 修飾 媒介 | ||
1.一種葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,包括:
(1)提取植物基因組DNA;
(2)使蛋白A修飾的磁珠與MBD2-Fc蛋白結合,得到處理后的磁珠;
(3)將所述植物基因組DNA加入所述處理后的磁珠中,混勻,對混合物進行室溫下孵育;
(4)對孵育后的混合物離心,于磁力架上靜置,細胞核DNA通過與磁珠上的MBD2-Fc蛋白結合而附著到磁珠上,葉綠體DNA保留在上清液中,取上清液;
(5)使用磁珠對所述上清液中的葉綠體DNA進行回收,即得到富集后的葉綠體DNA。
2.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(1)中,在提取植物基因組DNA時,保證所述植物基因組DNA的完整性,并且完全去除植物蛋白。
3.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(1)中,提取植物基因組DNA的方法為:對待提取樣本使用蛋白酶K處理,然后用酚氯仿或酒精提取。
4.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(1)中,還包括對提取的植物基因組DNA進行質量檢測的步驟和/或對提取的植物基因組DNA進行純化的步驟。
5.根據權利要求4所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,所述對提取的植物基因組DNA進行質量檢測的步驟包括濃度檢測、有無降解檢測、雜質檢測中的一種或多種。
6.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(2)中,所述蛋白A為從A型金黃色葡萄球菌分離得到的細胞壁蛋白。
7.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(2)中,使蛋白A修飾的磁珠與MBD2-Fc蛋白結合的方法為:取蛋白A修飾的磁珠與MBD2-Fc蛋白混合,室溫中孵育10~15分鐘。
8.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(2)中還包括除去未結合的MBD2-Fc蛋白的步驟。
9.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(3)中,加入到所述處理后的磁珠中的植物基因組DNA的總量不超過1μg。
10.根據權利要求1所述的葉綠體DNA的富集方法,其特征在于,步驟(3)中,所述室溫下孵育的時間為15~20分鐘。
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