[發明專利]鑒定白菜與埃塞俄比亞芥種間雜種及后代材料A02和C02染色體分離情況的分子標記

有效

• 申請號: 201910822383.3
• 申請日: 2019-09-02
• 公開（公告）號: CN110499383B
• 公開（公告）日: 2022-05-31
• 發明（設計）人: 張曉輝;李錫香;宋江萍;王海平
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院蔬菜花卉研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 成都方圓聿聯專利代理事務所(普通合伙) 51241
• 代理人: 胡文莉

本發明公開了鑒定白菜與埃塞俄比亞芥種間雜種及追蹤其后代材料A02和C02染色體分離情況的分子標記和方法，屬于植物遺傳育種領域。該標記是一對共顯性分子標記，利用該標記鑒定白菜與埃塞俄比亞芥種間雜種的真偽，也可用于鑒定和追蹤遠緣雜種的自交后代、回交后代、染色體附加系、以及重組分離群體和植株的A02和C02染色體分離情況。

技術領域

本發明涉及遺傳育種領域，具體而言，涉及遠緣雜種植物鑒定和選育方法。

背景技術

遠緣雜交是創制植物新種質、拓展育種資源的重要手段。由于物種生殖隔離，遠緣雜交往往需要人工授粉和胚拯救等技術，耗時費力，且需要一定科學訓練。在遠緣雜交過程中，由于去雄不徹底、雌配子發育成植株，以及其他原因可能造成假雜種植株的產生。因而，遠緣雜交獲得的植株需要通過分子、細胞學等方法檢測是否為真雜種。遠緣雜種的自交、回交后代需要通過分子或細胞學方法追蹤染色體或染色體片段，用以創制異源多倍體、染色體附加系、導入系等遺傳材料。與細胞學方法相比，分子標記具有快速、操作簡單、對實驗操作者技術要求低、不需要昂貴儀器、可用于大群體篩查等優點。隨著測序技術的發展，高通量測序和生物芯片也可以用于遠緣雜種的分子檢測。但是，由于簡單快速和成本低廉等原因，分子標記仍然在遠緣雜種快速篩選和大規模群體初篩上具有使用價值。

白菜屬于起源于我國的十字花科蔬菜，具有種類多、品質優、產銷廣的優點。埃塞俄比亞芥是起源于非洲的油料作物，具有優良的抗病、抗逆特性。白菜屬于A基因組，埃塞俄比亞芥屬于BC基因組；通過遠緣雜交合成ABC基因組植物具有重要的農業應用前景。通過雜交后回交轉育，將A、B、C基因組間染色體重組，將提高白菜和油菜的遺傳多樣性和抗病、抗逆潛力。

白菜的A02和埃塞俄比亞芥的C02染色體是部分同源(homeologous)染色體。二者之間既含有部分同源區段，也含有大量物種分化后產生的特異基因。利用白菜的A02和埃塞俄比亞芥的C02染色體在雜交后代中的重組可以獲得新的農藝性狀，提高蔬菜和油料作物的抗病、抗逆、及營養品質。

發明內容

本發明所要解決的技術問題為：如何提供一種鑒定白菜與埃塞俄比亞芥種間雜種及追蹤其后代材料A02和C02染色體分離情況的分子標記、引物及方法。

本發明的技術方案為：

鑒定白菜和埃塞俄比亞芥種間雜種及追蹤其后代材料A02和C02染色體分離情況的SSR分子標記，該SSR分子標記由引物C02B擴增得到，引物C02B的前向引物序列為C02B-F:5’-GCTTTGTGGGTTTGAGCTTG-3’(SEQ ID No.1)，引物C02B的后向引物序列為C02B-R:5’-GCCATTTTGAACCATGAACC-3’(SEQ ID No.2)。

該SSR分子標記PCR片段預期長度：240-270bp。真實的，白菜(A)基因組中擴增片段的預期長度為247bp，埃塞俄比亞芥(C)基因組中的擴增片段預期長度為262bp。應當知道，不同品種間SSR重復數可能不同，擴增片段長度在不同品種間可以有差異。

該SSR分子標記在白菜和埃塞俄比亞芥的染色體位置：在白菜(A)基因組中位于A02染色體9.36Mb處(根據Chiifu白菜V1.0基因組；下載地址：http://brassicadb.org/brad/datasets/pub/BrassicaceaeGenome/Brassica_rapa/V1.0/)，在埃塞俄比亞芥(C)基因組中位于C02染色體1.44Mb處(根據甘藍Bol_Chromosome_V1.1基因組；下載地址：http://brassicadb.org/brad/datasets/pub/BrassicaceaeGenome/Brassica_oleracea/Bol_Chromosome_V1.1/)。應當知道，由于不同研究者對染色體的編號可能不同，不同基因組組裝版本中該標記位置也可能不同，本專利應當包括檢測編號不同但實質等同的染色體及位置。