[發(fā)明專利]一種鑒別香豬與大白豬的結(jié)構(gòu)變異SMC1A基因中SV320分子標記及其檢測技術(shù)

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201910819953.3
• 申請日: 2019-08-31
• 公開（公告）號: CN110343772A
• 公開（公告）日: 2019-10-18
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 冉雪琴;王嘉福;李升;李大鵬
• 申請（專利權(quán)）人: 貴州大學(xué)
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 貴陽中新專利商標事務(wù)所 52100
• 代理人: 劉艷

1.一種鑒別香豬與大白豬的結(jié)構(gòu)變異SMC1A基因中SV320分子標記，其特征在于：SV320標記是指豬基因組中Sscrofa11.1的區(qū)域chrx：46186712-46187032，該區(qū)域缺失結(jié)構(gòu)變異320bp片段，或不缺失。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種鑒別香豬與大白豬的結(jié)構(gòu)變異SMC1A基因中SV320分子標記，其特征在于：所述的SV320分子標記的引物對為正向引物SV320F：CCAATCACCCATGAGAATAATGAC，反向引物SV320R：CAGCAGTATACAGGTTAAGAGTGCCA。

3.如權(quán)利要求1或2所述的SV320分子標記的檢測方法，其特征在于：包括以下步驟：(1)提取待測樣品的基因組DNA；(2)以基因組DNA為模板，利用引物R和F，進行PCR擴增；(3)0.7％瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物，凝膠成像系統(tǒng)記錄條帶并判斷基因型。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的SV320分子標記的檢測方法，其特征在于：步驟(2)中進行PCR所用的擴增體系，以20μL為例：

2×Taq PCR Master Mix	10.00μL
F-primer(0.10μg/μL)	0.40μL
R-primer(0.10μg/μL)	0.40μL
gDNA	1.00μL
2O]]>	8.20μL
TotalVolume	20.00μL

；

PCR反應(yīng)條件為：

5.如權(quán)利要求1或2所述的一種鑒別香豬與大白豬的結(jié)構(gòu)變異SMC1A基因中SV320分子標記的應(yīng)用方法，其特征在于：包括以下步驟：(1)采用普通PCR技術(shù)檢測該結(jié)構(gòu)變異在不同豬品種群體中的分布情況；

(2)計算各豬品種中3種基因型在群體中的頻率和等位基因的頻率，分析該結(jié)構(gòu)變異在香豬與大白豬品種之間的差異大小；

(3)根據(jù)結(jié)構(gòu)變異SV320是否為缺失基因型輔助區(qū)分大白豬和香豬品種。