[發明專利]一種與香豬產仔數相關的FSTL5基因中SV477標記及其檢測方法在審
| 申請號: | 201910819710.X | 申請日: | 2019-08-31 |
| 公開(公告)號: | CN110452996A | 公開(公告)日: | 2019-11-15 |
| 發明(設計)人: | 冉雪琴;王嘉福;牛熙;盧圣菲 | 申請(專利權)人: | 貴州大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 52100 貴陽中新專利商標事務所 | 代理人: | 吳無懼<國際申請>=<國際公布>=<進入 |
| 地址: | 550025貴州省貴*** | 國省代碼: | 貴州;52 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 產仔數 香豬 關聯分析 結構變異 基因組 內含子 性狀 葉酸 繁殖 參考 基因 檢測 | ||
1.一種與香豬產仔數相關的FSTL5基因中結構變異SV477分子標記,其特征在于:所述的SV477結構變異為豬參考基因組缺失477bp,位于類葉酸5基因內含子2中,SV477結構變異片段為chr8:50916421-50916897。
2.根據權利要求1所述的一種與香豬產仔數相關的結構變異SV477分子標記,其特征在于:所述的SV477分子標記的引物為:正向引物FSTL5-F:TGGCCATCTTCCTTATCTTATGAG,反向引物FSTL5-R:AACACCTTCTGCAGCTTAATAACAA。
3.如權利要求1或2所述的SV477分子標記在鑒定香豬產仔數中的檢測方法,其特征在于:包括以下步驟:(1)提取香豬的血液/組織基因組DNA;(2)以上述香豬基因組DNA為模板,利用所述引物FSTL5-F和FSTL5-R,進行PCR擴增,檢測豬基因組SV477的基因型;(3)根據上述檢測結果,如果目的片斷純合不缺失,則待測豬有產仔數較高的可能性;如果此片斷缺失,則待測個體有低產仔數傾向。
4.根據權利要求3所述的SV477分子標記在鑒定香豬產仔數中的檢測方法,其特征在于:步驟(2)中進行PCR所用的擴增體系,10μL。
10×PCR Mix 5.00μL FSTL5-F(0.10μg/μL) 0.10μL FSTL5-R(0.10μg/μL) 0.10μL DNA 1.00μL 2O]]> 3.80μL
PCR反應條件為:
5.如權利要求1或2所述的SV477分子標記在香豬產仔數相關的分子標記輔助選擇方法中的應用,其特征在于:包括以下步驟:(1)采用PCR技術檢測該SV477位點在香豬群體中的基因型分布情況(2)應用SPSS v20.0中的卡方檢驗進行雙側檢驗,分析高產仔數香豬群體與低產仔豬香豬群體SV477的基因型分布頻率。(3)根據結構變異SV477進行有高產仔數優勢母豬的選育。
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