[發明專利]KCNQ1基因突變體及其應用

在審

• 申請號: 201910812833.0
• 申請日: 2019-08-30
• 公開（公告）號: CN112442503A
• 公開（公告）日: 2021-03-05
• 發明（設計）人: 彭智宇;孫宇;向嘉樂;陳森;謝文;李丹;許振朋
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因股份有限公司;華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/6883;G01N33/68;A61K45/00;A61P27/16
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 張立

本發明提供了一種綜合征型耳聾相關的基因突變、核酸及其應用，具體提供了一種KCNQ1基因突變體及其應用。所提供的基因突變與野生型KCNQ1基因相比，具有c.1741AT突變。本發明所提供的基因突變是綜合征型耳聾的一種新的相關的致病突變，通過檢測該基因突變在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否患綜合征型耳聾。該致病突變位點的發現，進一步拓展和完善了遺傳性聽力損失的檢測和研究，為該疾病的診斷或治療提供了新的檢測穩點，以及新的檢測方法和途徑。

技術領域

本發明涉及生物領域，具體涉及KCNQ1基因突變體及其應用，更具體地，本發明涉及基因突變、核酸、多肽、生物模型、用于綜合征型耳聾的藥物、用于檢測綜合征型耳聾的試劑盒、構建體及重組細胞。

背景技術

耳聾(hearing loss,HL)是最常見的感官功能障礙類疾病，相當一部分的耳聾患者的發病與遺傳因素有關。通過基因檢測手段確定耳聾發病的分子機制，從而進一步采取產前基因診斷和干預措施，是降低耳聾發生率的有效手段，也是耳聾防治的根本途徑之一。根據是否有并發的其他臨床表型，遺傳性耳聾可分為綜合征型耳聾(syndromic hearingloss,SHL)和非綜合征型耳聾(non-syndromic hearing loss,NSHL)。

綜合征型耳聾是指耳聾癥狀伴隨其他遺傳性病癥。綜合征型耳聾在先天性遺傳性耳聾中占30％左右，呈現高度的遺傳異質性，已知有超過700種綜合征包含耳聾癥狀。由不同致病基因導致的綜合征型耳聾在發病年齡、聽力損失程度、進行性等方面存在明顯差異。同時，對于多種常見綜合征，耳聾的發病時間通常早于其他臨床癥狀。及早地通過基因診斷方法確定綜合征型耳聾發病的致病基因有助于為患者選取合適的干預手段，指導后續的治療過程，從而提高患者的生活質量。

隨著測序技術的發展，越來越多的遺傳性耳聾相關基因得到鑒定，為遺傳性耳聾的分子學診斷提供了基礎，使得更多的遺傳性耳聾得到診斷與治療。然而，由于遺傳性耳聾具有很強的遺傳異質性，目前仍有大量的致病基因未被鑒定，所以這方面的研究還有很大的空間，仍需要加強基因鑒定方面的研究。

發明內容

本發明旨在至少在一定程度上解決相關技術中的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出一種KCNQ1基因突變體及其應用。

多基因捕獲測序Panel技術具有多種優點，其檢測范圍廣，單位成本低，能夠一次性全面排查大范圍的目標區域。發明人針對自行收集的一例常染色體隱性耳聾Trio家系(父母+先證者)，通過多基因捕獲測序Panel檢測、家系分析聯合Sanger測序驗證的方法進行致病突變檢測和驗證。并確定了常染色體隱性型耳聾的一個新的致病突變位點——KCNQ1基因的c.1741AT突變。該突變會導致終止密碼子的提前出現，在多個公共數據庫中均無記錄，會導致了常染色體隱性耳聾的發生，并提示遺傳性心律失常的風險。

本發明所發現的常染色體隱性耳聾致病基因KCNQ1的一個新的致病位點，該突變位點可以用于篩查常染色體隱性耳聾致病突變攜帶者，并提示遺傳性心律失常的風險；也可用于常染色體隱性耳聾患者的分子診斷及與相關疾病的鑒別診斷，并且快速、準確、高效、簡便、早期診斷率高，其檢測結果可以為常染色體隱性耳聾及遺傳性心律失常的早期診斷、鑒別診斷及藥物治療提供科學依據。

在本發明的第一方面，本發明提供了一種基因突變，其與野生型KCNQ1基因相比，具有c.1741AT突變。發明人發現KCNQ1基因的c.1741AT突變與綜合征型耳聾的發病密切相關，從而可以通過檢測該基因突變在生物樣品中是否發生，有效地檢測生物樣品是否患綜合征型耳聾。

在本發明的第二方面，本發明提供了一種核酸，與野生型KCNQ1基因相比，所述核酸具有c.1741AT突變。發明人發現KCNQ1基因的c.1741AT突變與綜合征型耳聾的發病密切相關，從而可以通過檢測該核酸在生物樣品中是否存在，有效地檢測生物樣品是否患綜合征型耳聾。