[發明專利]一種基于多基因組合交互作用預測二代抗精神病藥物治療精神分裂癥致體重增加分析方法

有效

• 申請號: 201910747810.6
• 申請日: 2019-08-09
• 公開（公告）號: CN110317868B
• 公開（公告）日: 2020-05-19
• 發明（設計）人: 王帆;李慧;劉彥隆;康毅敏
• 申請（專利權）人: 新疆醫科大學第二附屬醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;G16B20/00
• 代理公司: 北京華仁聯合知識產權代理有限公司 11588
• 代理人: 周明新

本發明公開了一種基于多基因組合交互作用預測二代抗精神病藥物治療精神分裂癥致體重增加分析方法，樣品制備收集二代抗精神病藥物治療精神分裂癥致體重增加患者的外周血；使用低滲鹽析法提取基因組DNA樣本；MODLI?TOF飛行質譜檢測法進行5?羥色胺2C受體(5?HT2CR)基因、組胺l受體基因、催產素基因、NPY/R基因、Leptin基因和脂聯素基因、FGF21和FGF23基因基因分型；數據分析提取并對齊儀器原始數據,獲得無噪音干擾、可用于統計分析的數據,通過廣義多因子降維法開展數量性狀的基因?基因交互作用，再進一步應用交叉驗證，使用基因交互作用預測體重增加。本發明采用廣義多因子降維法處理連續型結局變量，并且納入協變量，具有使其應用范圍和預測準確率得到大幅度提高的優點。

技術領域

本發明涉及醫學技術領域，具體為一種基于多基因組合交互作用預測二代抗精神病藥物治療精神分裂癥致體重增加分析方法。

背景技術

二代抗精神分裂癥藥物治療精神分裂癥常易致糖脂代謝異常，出現肥胖甚至其他雌激素樣副作用，如泌乳、喉結變小、勃起功能障礙，因而降低患者的用藥依從性和生活質量，過度的體重增加可能增加心血管疾病和糖尿病相關的致病率和死亡率，增加精神分裂癥罹患代謝綜合征的風險。

目前國內外已經發現多個基因遺傳多態性與二代抗精神病藥致體重增加相關，而針對二代抗精神病藥物治療慢性精神分裂癥過程中體重增加的預測，通常使用單個基因或單個基因遺傳多態性，但這個過程中的體重增加屬于復雜疾病，是多基因疊加、相互作用的結果。

發明內容

本發明的目的在于提供一種基于多基因組合交互作用預測二代抗精神病藥物治療精神分裂癥致體重增加分析方法，采用廣義多因子降維法處理連續型結局變量，并且納入協變量，具備使其應用范圍和預測準確率得到大幅度提高的優點，從而解決模型不能真實有效地反映遺傳多態性信息,對標記物的篩選出現偏差的問題。

為實現上述目的，本發明提供如下技術方案：一種基于多基因組合交互作用預測二代抗精神病藥物治療精神分裂癥致體重增加分析方法，包括以下步驟：

S1：樣品制備收集二代抗精神病藥物治療精神分裂癥致體重增加患者的外周血；

S2：使用低滲鹽析法提取基因組DNA樣本；

S3：MODLI-TOF飛行質譜檢測法進行5-羥色胺2C受體(5-HT2CR)基因、組胺l受體(H1R)基因、催產素(Oxytocin,OT)基因、NPY/R基因、Leptin基因和脂聯素(Adiponectin)基因、FGF21和FGF23基因基因分型；

S4：數據分析提取并對齊儀器原始數據,獲得無噪音干擾、可用于統計分析的數據,通過廣義多因子降維法(GMDR)開展數量性狀的基因-基因交互作用，再進一步應用交叉驗證，使用基因交互作用預測體重增加；

步驟1:采用病例匹配對照研究，收集二代抗精神病藥物治療精神分裂癥患者的相關臨床資料，服用二代抗精神病藥物治療1年內體重增加＞7％的精神分裂癥患者為研究組，其余患者為疾病對照組，測量全部患者治療前后的體重、腰圍、臀圍、身高，計算BMI(Body Mass Index)、WHR(Waist/hip—ratio)臨床表型，因吸煙在一定程度上影響食欲與體重，故完成Russell吸煙原因問卷和尼古丁依賴嚴重程度量表(FNTD)；

步驟2：抽取上述樣本外周血3ml，用于提取基因組DNA，通過genbank和hapmap使用MODLI-TOF飛行質譜檢測法對5-HT2C、H1R與NPY/R及Oxytocin、Leptin和Adiponectin候選基因的SNP、結構突變和插入缺失遺傳變異進行基因分型，找出統計學上二代抗精神病藥物致體重增加的特異性基因遺傳多態性；