[發明專利]一種提取鮑肝胰腺RNA的方法有效
| 申請號: | 201910633245.0 | 申請日: | 2019-07-15 |
| 公開(公告)號: | CN110295164B | 公開(公告)日: | 2022-02-22 |
| 發明(設計)人: | 姚托;盧潔;葉靈通;王江勇 | 申請(專利權)人: | 中國水產科學研究院南海水產研究所 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 廣州正明知識產權代理事務所(普通合伙) 44572 | 代理人: | 余敏 |
| 地址: | 510000 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 提取 胰腺 rna 方法 | ||
本發明涉及分子生物學技術領域,特別涉及一種提取鮑肝胰腺RNA的方法,具體為:鮑肝胰腺在液氮中磨碎后用Trizol進行組織裂解,加入氯仿乳化,用異丙醇和5M NaCl沉淀,后轉入RNA吸附柱中,經75%乙醇和5M NaCl溶液洗滌,再經75%乙醇洗滌后用RNase?free水溶解得到鮑肝胰腺總RNA,總RNA經75%乙醇和5M NaCl二次沉淀和后續再純化,最終得到高質量的鮑肝胰腺總RNA,本發明不僅可徹底消除鮑肝胰腺總RNA沉淀過程中產生的褐色沉淀,使得到的鮑肝胰腺總RNA質量好、濃度高、穩定性好,而且操作簡單、成本低廉;同時,對其它多糖和色素含量高的水產動物組織總RNA的提取有借鑒作用。
技術領域
本發明涉及分子生物學技術領域,特別涉及一種提取鮑肝胰腺RNA的方法。
背景技術
鮑被譽為海產“八珍之冠”,具有很高的營養和藥用價值。2017年全國鮑魚產量為14.85萬噸,較2016年增幅10.24%,為經濟貝類養殖中產量增幅最快的品種,具有重要的研究價值。肝胰腺為鮑的重要免疫組織,在對其進行免疫學研究時,肝胰腺RNA的提取是一個重要的環節。實時熒光定量、Northern雜交及轉錄組測序等分子生物學研究的開展都需要純度高、完整性好的總RNA。
由于鮑肝胰腺中含有大量的多糖及色素,在RNA的提取過程中容易與RNA一起形成褐色沉淀,使得提取得到的RNA純度不高、檢測的總RNA含量不準,嚴重影響定量結果及cDNA文庫的構建,使得后續實驗無法進行。目前,傳統的Trizol提取方法可高質量的提取鮑外套膜、鰓和足的總RNA,但在肝胰腺總RNA的提取過程中會產生褐色沉淀且無法去除,市售RNA提取試劑盒對提取得到的肝胰腺總RNA質量僅能起到改善作用,也無法從根本上去除褐色沉淀,且RNA提取質量不穩定。因此,有必要建立一種適用于鮑肝胰腺總RNA的提取方法,以滿足響應分子生物學實驗的需求。
發明內容
為了克服上述現有技術的不足,本發明提出了一種提取鮑肝胰腺RNA的方法,采用該方法得到的鮑肝胰腺總RNA質量好,濃度高,穩定性好。
為了實現上述目的,本發明所采用的技術方案是:
一種提取鮑肝胰腺RNA的方法,包括以下步驟:
S1、取鮑肝胰腺,在液氮中磨碎后,轉入含有Trizol的RNase-free EP(eppendorf)管中(該EP管一般為1.5 mL管),混勻后離心,取上清液轉入新的RNase-freeEP管中;
S2、往S1的上清液中加入1/5上清液體積的氯仿,通過震蕩等方式混勻充分乳化呈乳白色,室溫靜置2-5 min,離心后取上清液轉入新的RNase-free EP管中;
S3、往S2的上清液中分別加入與上清液等體積的異丙醇和5mol/L NaCl(即5 MNaCl),混勻,分兩次將得到的溶液和沉淀一起轉入RNA吸附柱中,離心后棄掉收集管中的液體;
S4、往S3的RNA吸附柱中加入75%體積分數的乙醇和5 M NaCl,室溫靜置2-5 min,離心后棄掉收集管中的液體;
S5、往S4的RNA吸附柱中加入75%體積分數的乙醇,室溫靜置2-5 min,離心后棄掉收集管中的液體;
S6、將S5的RNA吸附柱放入2 mL收集管中,離心2-4 min;
S7、將S6的RNA吸附柱充分晾干;
S8、將S7的RNA吸附柱轉入一個新的無RNase的1.5 mL離心管中,加入RNase-free水室溫放置2 min,離心后得到鮑肝胰腺總RNA;
S9、往S8的離心管中加入75%體積分數的乙醇和5 M NaCl進行二次沉淀,充分混合后靜置2-5 min,將混合物轉入RNA吸附柱中,離心(該離心時間一般為30s)后棄掉收集管中的液體;
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