[發明專利]一種推算金腰屬植物基因組大小的方法

有效

• 申請號: 201910542165.4
• 申請日: 2019-06-21
• 公開（公告）號: CN110274865B
• 公開（公告）日: 2021-09-17
• 發明（設計）人: 覃瑞;劉虹;吳智華;廖瑞;董翔
• 申請（專利權）人: 中南民族大學
• 主分類號: G01N15/14
• 分類號: G01N15/14;G01N1/30
• 代理公司: 北京市誠輝律師事務所 11430
• 代理人: 范盈

本發明公開一種推算金腰屬植物基因組大小的方法。該方法包括以新鮮金腰屬植物為材料、細胞核解離液配置、單細胞懸浮液制備、顯微鏡鏡檢、參照樣本的選擇，最終通過流式細胞儀推算出樣品基因組大小的過程。本發明細胞核解離液配置簡單，解離效率高，鏡檢效果明顯，適用于金腰屬各種植物的基因組大小的推算。為金腰的后續科學研究提供幫助，為金腰屬植物的分類及開發應用研究奠定基礎。

技術領域

本發明屬于細胞生物學領域，具體涉及一種推算金腰屬植物基因組大小的方法。

背景技術

金腰屬植物為多年生小草本，常具鱗莖或者鞭匐枝。單葉，基生葉有互生和對生兩種，具柄，無托葉。通常為聚傘花序，周圍苞葉；花小型，綠色、黃色、白色或帶紫色；托杯內壁通常多少與子房愈合；4萼片，在芽中呈瓦狀排列；無花瓣，花盤極不明顯或無，或明顯(4)8裂，有時其周圍具褐色乳頭狀突起；雄蕊8(10)或4；花絲鉆形，花藥2室，側裂，花粉粒微細，具3擬孔溝，并具華美網紋；2心皮通常中下部合生，子房近上位、半下位或近下位，1室，胚珠多數，具2側膜胎座，花柱2，離生，柱頭具斑點。蒴果的2果瓣分為近等大或明顯不等大兩種；種子較多，卵球形至橢圓球形，有時光滑無毛，有時具微乳頭狀突起、微柔毛或微瘤突，有時具縱肋，肋上具橫紋、乳頭狀突起或微瘤突等。染色體數目、基因組大小不明確。

金腰屬植物全球約70種，亞、歐、非、美四洲均有分布，以亞洲溫帶分布為主。中國目前發現金腰屬植物約40-45種(包括變種在內)，廣泛分布于云南、西藏、四川、貴州、湖北、湖南、東北等二十多個省份。

金腰屬植物藥用種類較多，《中國植物志》、《中國藥植圖鑒》、《全國中草藥匯編》以及各地中草藥典籍均有關于本屬藥用植物的記載。本屬藥用植物多用于清熱解毒、治療肝膽病等。其在中國傳統醫藥歷史發展中得到廣泛應用，藏藥中稱其為亞吉瑪，藏醫學者登增彭錯著作《晶珠本草》中載有“亞吉瑪生于高山石隙，味苦性涼，緩吐瀉，治膽疾。”此外金腰屬植物也在蒙醫學著作《無誤蒙藥鑒》中也有記載。近年來研究表明金腰屬植物普遍含有較高的黃酮類及三萜類化合物具良好抗腫瘤和抗病毒活性，其中從裸莖金腰C.nudicale中分離到的五環三萜對惡性褐色瘤(A375)、4種胃癌(ST-KM,KaTo-III,NKPS,KKLS)和膀胱癌(KK-47)都具較強抑制作用，且該屬植物中特有且普遍存在的金腰酮B和金腰酮C(Chrysosplenol B,Chrysosplenol C)都有顯著的抗病毒活性。以上生理活性表明金腰屬植物值得進一步研究和開發。

自從首次的雙螺旋結構被解析以來，測序技術已經成為了分子生物學領域的重要手段之一。對于每一個生物體，基因組作為遺傳信息的載體能真實的反映該物種進化、遺傳等各種信息，從而全面地揭示該物種基因組水平上的多樣性和復雜性。因此，要想對一個物種進行全基因組水平上的了解，對該物種的基因組的測定顯得十分必要。DNA測序技術經歷了三代的發展。以Sanger的雙脫氧鏈終止法和Maxam化學降解法為基礎的為第一代測序技術。在這第一代技術當中，最普及的是Sanger的雙脫氧鏈終止法，剛一上市備受歡迎，特點是技術原理簡單、精確度高，缺點是操作過程復雜，時間周期較長且成本很高。自2005年以來，第二代測序技術以高通量、低成本、周期短等特點而非常受歡迎，代表的平臺有Roche/454，Illumina/Hiseq，ABI/SOLID等，這讓科研工作者在短時間內就可獲得大量的數據成分可能，并使得數據庫的數據呈指數增長，為生物信息研究人員提供豐富的數據資源。在一代和二代技術的改進基礎上，以單分子測序技術為特點的第三代測序技術已經誕生，這種技術將具備更高的靈敏度和更長的讀長。但是三代測序技術成本較高，對于高等植物的測序而言，在測序前估算植物樣本的DNA含量是有效控制成本的重要手段。