[發明專利]用于檢測分泌型PD-L1拼接變體的RT-PCR引物、試劑盒及鑒定方法在審
| 申請號: | 201910536704.3 | 申請日: | 2019-06-20 |
| 公開(公告)號: | CN112111574A | 公開(公告)日: | 2020-12-22 |
| 發明(設計)人: | 周軍 | 申請(專利權)人: | 鋒宏生物醫藥科技(昆山)有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 昆山中際國創知識產權代理有限公司 32311 | 代理人: | 盛建德;陳寧 |
| 地址: | 215300 江蘇*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 檢測 分泌 pd l1 拼接 變體 rt pcr 引物 試劑盒 鑒定 方法 | ||
1.一種用于檢測分泌型PD-L1拼接變體的RT-PCR引物,其特征在于,由下列引物對組成:
針對肺癌腫瘤的引物對I:
正向引物:CCAAATGAAAGGACTCACTTG;
反向引物:CGTCTCCTCCAAATGTGTATCTT;
針對多發性骨髓瘤的引物對II:
正向引物:AAGTCCTGAGTGGAGATTAGATC;
反向引物:CATTCTCCCAAGTGAGTCC;和
針對淋巴瘤的引物對III:
正向引物:ACCAGCACACTGAGAATCAAC;
反向引物:CACATCCATCATTCTCCCAAG。
2.一種含權利要求1所述引物對的用于檢測分泌型PD-L1拼接變體的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括引物對和cDNA模板,其中所述引物對由所述引物對I、引物對II和引物對III組成,其中cDNA模板是由總RNA模板通過反轉錄酶反轉錄而成,且所述總RNA模板是通過總RNA提取試劑盒從腫瘤細胞AMO-1、JJN-3、MM.1S、H69、H526、SU-DHL-4和SU-DHL-6中提取所得。
3.根據權利要求2所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括雙蒸水、PCR反應緩沖液、dNTPs和熱啟動高效Taq酶。
4.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒包括2μM引物對I的正向引物1μL、2μM引物對I的反向引物1μL、2μM引物對II的正向引物1μL、2μM引物對II的反向引物1μL、2μM引物對III的正向引物1μL、2μM引物對III的反向引物1μL、經稀釋20倍的cDNA模板1μL、雙蒸水4.8μL、10×PCR反應緩沖液1μL、2mM each的dNTPs 1μL、2.5U/μL的熱啟動高效Taq酶0.1μL。
5.一種基于權利要求2至4中任一權利要求所述試劑盒的用于檢測分泌型PD-L1拼接變體的RT-PCR鑒定方法,其特征在于,包括下述步驟:
S1:從患者腫瘤細胞樣品中提取總RNA,采用反轉錄酶將該總RNA逆轉錄為cDNA,以該cDNA為模板利用所述引物對I、引物對II和引物對III進行PCR擴增實驗,反應結束后進行瓊脂糖凝膠電泳實驗,得到待測樣品結果圖;
S2:根據待測樣品結果圖上顯示的擴增出的DNA片段大小進行待測樣品結果判定。
6.根據權利要求5所述的鑒定方法,其特征在于,所述PCR擴增實驗中PCR反應程序為:依次進行95℃下預變性3min,94℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸45s,進行45次循環,72℃下延伸10min,最后在4℃下保持1min后結束。
7.根據權利要求5所述的鑒定方法,其特征在于,所述瓊脂糖凝膠電泳實驗結束后,分析樣品結果圖時,判定依據為所述引物對I、引物對II和引物對III分別擴增出的DNA片段大小;其中
針對肺癌腫瘤的PD-L1拼接變體PD-L1-1對應的引物對I擴增出的DNA片段大小為103bp;
針對多發性骨髓瘤的PD-L1拼接變體PD-L1-3對應的引物對II擴增出的DNA片段大小為104bp;
針對淋巴瘤的PD-L1拼接變體PD-L1-9對應的引物對III擴增出的DNA片段大小為161bp。
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