[發(fā)明專利]一種與大豆植株分枝數(shù)顯著相關(guān)的InDel標(biāo)記及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201910529784.X
• 申請日: 2019-06-19
• 公開（公告）號: CN110117674B
• 公開（公告）日: 2022-07-19
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 王曉波;萬明月;張陰;王偉;邵文韜;程安東;李佳佳;付廣輝;張玉坤;邱麗娟
• 申請（專利權(quán)）人: 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 安徽匯樸律師事務(wù)所 34116
• 代理人: 劉海涵

本發(fā)明公開了一種與大豆植株分枝數(shù)顯著相關(guān)的InDel標(biāo)記及其應(yīng)用，涉及遺傳育種技術(shù)領(lǐng)域，通過SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5所述的序列為引物對大豆基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，并對擴(kuò)增產(chǎn)物判斷，若擴(kuò)增產(chǎn)物僅含1條主帶，則對應(yīng)待測大豆DNA沒問題且植株分枝數(shù)多；若擴(kuò)增產(chǎn)物包含兩條主帶，則對應(yīng)待測大豆DNA沒問題且植株分枝數(shù)少；本發(fā)明提供的方法能夠有效、快速的刷選出大豆植株為分枝數(shù)多或少的品種，實現(xiàn)了篩選優(yōu)異大豆植株材料的第一步，為深入開展基因功能研究和大豆分枝數(shù)分子改良提供了方法基礎(chǔ)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及遺傳育種技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種與大豆植株分枝數(shù)顯著相關(guān)的InDel標(biāo)記以及鑒定大豆植株分枝數(shù)多少的方法。

背景技術(shù)

大豆是世界上最重要的一種油料經(jīng)濟(jì)作物，同時也是最大的食用油和蛋白的來源。隨著對大豆需求的增長，利用大豆品種的遺傳改良來提高大豆產(chǎn)量將變得越來越重要。優(yōu)化植株形態(tài)結(jié)構(gòu)、培育具有最優(yōu)分枝的大豆品種是植物育種家一直追求的育種目標(biāo)。

常規(guī)育種年限長、效率低且成本高，而分子標(biāo)記反映生物個體基因組DNA片段的差異，直接反應(yīng)種質(zhì)資源本質(zhì)，具有高效、準(zhǔn)確以及經(jīng)濟(jì)等優(yōu)點(diǎn)，大幅縮短育種周期，是傳統(tǒng)育種技術(shù)的有力補(bǔ)充SNP分子標(biāo)記具有數(shù)量多、遺傳穩(wěn)定等優(yōu)點(diǎn)，基于酶切擴(kuò)增多態(tài)性序列標(biāo)記技術(shù)(CAPS)的SNP分子標(biāo)記檢測方法，主要是將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中含SNP位點(diǎn)的DNA片段進(jìn)行限制性酶切分析，是SNP分子標(biāo)記的檢測方法之一。InDel標(biāo)記是由插入/缺失位點(diǎn)兩側(cè)的基因序列所設(shè)計的特異性引物，根據(jù)PCR產(chǎn)物片段大小可直接快速的進(jìn)行檢測，具有準(zhǔn)確性高、穩(wěn)定性好以及成本低等優(yōu)勢。InDel標(biāo)記相比較與CAPS標(biāo)記來說，耗時短、成本低及操作簡便。目前已廣泛應(yīng)用于植物種質(zhì)資源分析及分子標(biāo)記輔助育種。

大豆植株分枝數(shù)是影響大豆品質(zhì)的重要組分因素，而現(xiàn)有技術(shù)中并未見報道可對大豆植株分枝數(shù)多少進(jìn)行有效判斷的分子生物學(xué)方法；而現(xiàn)有技術(shù)中，雖然存在對大豆植株其它性狀進(jìn)行分子篩選的方法，但是多數(shù)存在篩選技術(shù)不穩(wěn)定、時間長、技術(shù)繁瑣等問題。

因此，如何避免上述風(fēng)險，是急需解決的技術(shù)問題。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足，提供了一種與大豆植株分枝數(shù)顯著相關(guān)的InDel標(biāo)記及其應(yīng)用，以解決現(xiàn)有技術(shù)中不存在對大豆植株分枝數(shù)多少有效篩選、篩選技術(shù)時間長等技術(shù)問題。

本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案實現(xiàn)的：

本發(fā)明提供了一種與大豆植株分枝數(shù)顯著相關(guān)的InDel標(biāo)記，所述InDel標(biāo)記的核苷酸序列具體如SEQ ID NO.1：TGTCTGTGAAGT。

本發(fā)明還提供一種上述的InDel標(biāo)記在鑒定大豆植株分枝數(shù)中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供一種用于擴(kuò)增上述InDel標(biāo)記的引物對，所述引物對的序列具體為：

1F：GCAAATCTGTCTGTGAAGTACG SEQ ID NO.2

1R：TATCCGAATTGCAAAAGCGCA SEQ ID NO.3。

本發(fā)明還提供一種上述的引物對在鑒定大豆植株分枝數(shù)中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供一種雙引物對快速鑒定大豆植株分枝數(shù)多少的方法，該方法包括以下步驟：

步驟1、設(shè)計鑒定待測大豆基因組DNA是否有缺陷的引物對

2F：GTGTCATTCCTGGCATACAAAAGT SEQ ID NO.4

2R：TAATGCCTCCTGCCCTGTTG SEQ ID NO.5

步驟2、提取待測大豆基因組DNA