[發(fā)明專利]一種免疫組化病理圖像CD3陽性細(xì)胞核分割方法及系統(tǒng)有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201910517113.1 | 申請(qǐng)日: | 2019-06-14 |
| 公開(公告)號(hào): | CN110415255B | 公開(公告)日: | 2021-08-20 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 劉再毅;梁長(zhǎng)虹;覃杰;趙可;王瑛;陳鑫;黃燕琪;姚溯;李振輝 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 廣東省人民醫(yī)院(廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院) |
| 主分類號(hào): | G06T7/11 | 分類號(hào): | G06T7/11;G06T7/136;G06T7/194 |
| 代理公司: | 廣州市華學(xué)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44245 | 代理人: | 李斌 |
| 地址: | 510080 廣東*** | 國(guó)省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 免疫 病理 圖像 cd3 陽性 細(xì)胞核 分割 方法 系統(tǒng) | ||
本發(fā)明公開了一種免疫組化病理圖像CD3陽性細(xì)胞核分割方法及系統(tǒng),該方法的步驟為:對(duì)免疫組化病理圖像進(jìn)行顏色反卷積,分離染色通道;圖像采用超像素分割成不規(guī)則像素塊,進(jìn)行kmeans聚類區(qū)分出圖像背景并去除;基于形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行圖像分割,得到初步分割好的細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1以及待處理的第一圖像C1;將待處理的第一圖像C1進(jìn)行局部閾值bernsen分割及形態(tài)學(xué)特征分割,得到分割好的細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2和待處理的第二圖像C2;將待處理的第二圖像C2進(jìn)行前景標(biāo)記,并采用分水嶺算法分割出細(xì)胞核第三區(qū)域圖像L3;將細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1、細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2、細(xì)胞核第三區(qū)域圖像L3構(gòu)成細(xì)胞核分割圖像。本發(fā)明魯棒性高,分割精準(zhǔn),可以滿足實(shí)際應(yīng)用需求。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及圖像處理的技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種免疫組化病理圖像CD3陽性細(xì)胞核分割方法及系統(tǒng)。
背景技術(shù)
CD3是一種重要的白細(xì)胞分化抗原,幾乎所有的T細(xì)胞表面均存在,是構(gòu)成T細(xì)胞抗原受體(TCR)的膜抗原。在抗原與TCR結(jié)合時(shí),參與其信號(hào)向細(xì)胞內(nèi)的傳達(dá),是與發(fā)現(xiàn)各種各樣的T細(xì)胞機(jī)能有關(guān)的重要的膜抗原。目前醫(yī)護(hù)人員對(duì)病理圖像進(jìn)行CD3細(xì)胞的分割、標(biāo)記和計(jì)數(shù)要花費(fèi)大量的時(shí)間和精力,因此,需要一種較為精確的病理圖細(xì)胞分割手段來減輕醫(yī)護(hù)人員的壓力。
發(fā)明內(nèi)容
為了減輕醫(yī)護(hù)人員的負(fù)擔(dān),實(shí)現(xiàn)針對(duì)病理圖像進(jìn)行CD3細(xì)胞的自動(dòng)分割,本發(fā)明提供一種免疫組化病理圖像CD3陽性細(xì)胞核分割方法及系統(tǒng),本發(fā)明魯棒性高,分割精準(zhǔn),可以滿足實(shí)際應(yīng)用需求。
為了達(dá)到上述目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:
本發(fā)明提供一種免疫組化病理圖像CD3陽性細(xì)胞核分割方法,包括下述步驟:
S1:對(duì)免疫組化病理圖像進(jìn)行顏色反卷積,分離染色通道;
S2:將原始免疫組化病理圖像從RGB顏色空間轉(zhuǎn)換到Lab顏色空間,采用超像素分割成不規(guī)則像素塊,所述不規(guī)則像素塊進(jìn)行kmeans聚類區(qū)分出圖像背景,并將圖像背景去除;
S3:基于形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行圖像分割,得到初步分割好的細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1以及待處理的第一圖像C1;
S4:將待處理的第一圖像C1進(jìn)行局部閾值bernsen分割及形態(tài)學(xué)特征分割,得到分割好的細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2和待處理的第二圖像C2;
S5:將待處理的第二圖像C2進(jìn)行前景標(biāo)記,并采用分水嶺算法分割出細(xì)胞核第三區(qū)域圖像L3;
S6:將細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1、細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2、細(xì)胞核第三區(qū)域圖像L3與免疫組化病理圖像原圖進(jìn)行掩膜處理,得到細(xì)胞核分割圖像。
作為優(yōu)選的技術(shù)方案,步驟S1中所述對(duì)免疫組化病理圖像進(jìn)行顏色反卷積,計(jì)算公式為:
C=M-1[y]
其中,C表示分離的H和DAB染色通道,M表示不同染色參數(shù)矩陣,參數(shù)矩陣的行分別表示H、曙紅和DAB染色,參數(shù)矩陣的列表示RGB染色方案參數(shù)大小,y表示每一個(gè)像素的光密度。
作為優(yōu)選的技術(shù)方案,步驟S2中所述不規(guī)則像素塊進(jìn)行kmeans聚類區(qū)分出圖像背景,將不規(guī)則像素塊的Lab顏色空間中L層作為kmeans聚類的對(duì)象,具體的計(jì)算公式如下所述:
其中,E表示最小平方誤差,x表示每一個(gè)不規(guī)則像素塊,u表示質(zhì)心,g表示分類的簇,當(dāng)E最小時(shí)則kmeans聚類完成。
作為優(yōu)選的技術(shù)方案,步驟S3所述的基于形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行圖像分割,具體步驟為:
該專利技術(shù)資料僅供研究查看技術(shù)是否侵權(quán)等信息,商用須獲得專利權(quán)人授權(quán)。該專利全部權(quán)利屬于廣東省人民醫(yī)院(廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院),未經(jīng)廣東省人民醫(yī)院(廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院)許可,擅自商用是侵權(quán)行為。如果您想購(gòu)買此專利、獲得商業(yè)授權(quán)和技術(shù)合作,請(qǐng)聯(lián)系【客服】
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