[發(fā)明專利]一種免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法及系統(tǒng)有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201910517113.1 | 申請(qǐng)日: | 2019-06-14 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN110415255B | 公開(kāi)(公告)日: | 2021-08-20 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 劉再毅;梁長(zhǎng)虹;覃杰;趙可;王瑛;陳鑫;黃燕琪;姚溯;李振輝 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 廣東省人民醫(yī)院(廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院) |
| 主分類號(hào): | G06T7/11 | 分類號(hào): | G06T7/11;G06T7/136;G06T7/194 |
| 代理公司: | 廣州市華學(xué)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44245 | 代理人: | 李斌 |
| 地址: | 510080 廣東*** | 國(guó)省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 免疫 病理 圖像 cd3 陽(yáng)性 細(xì)胞核 分割 方法 系統(tǒng) | ||
1.一種免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法,其特征在于,包括下述步驟:
S1:對(duì)免疫組化病理圖像進(jìn)行顏色反卷積,分離染色通道;
S2:將原始免疫組化病理圖像從RGB顏色空間轉(zhuǎn)換到Lab顏色空間,采用超像素分割成不規(guī)則像素塊,所述不規(guī)則像素塊進(jìn)行kmeans聚類區(qū)分出圖像背景,并將圖像背景去除;
S3:基于形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行圖像分割,得到初步分割好的細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1以及待處理的第一圖像C1;
S4:將待處理的第一圖像C1進(jìn)行局部閾值bernsen分割及形態(tài)學(xué)特征分割,得到分割好的細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2和待處理的第二圖像C2;
S5:將待處理的第二圖像C2進(jìn)行前景標(biāo)記,并采用分水嶺算法分割出細(xì)胞核第三區(qū)域圖像L3;
S6:將細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1、細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2、細(xì)胞核第三區(qū)域圖像L3與免疫組化病理圖像原圖進(jìn)行掩膜處理,得到細(xì)胞核分割圖像。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法,其特征在于,步驟S1中所述對(duì)免疫組化病理圖像進(jìn)行顏色反卷積,計(jì)算公式為:
C=M-1[y]
其中,C表示分離的H和DAB染色通道,M表示不同染色參數(shù)矩陣,參數(shù)矩陣的行分別表示H、曙紅和DAB染色,參數(shù)矩陣的列表示RGB染色方案參數(shù)大小,y表示每一個(gè)像素的光密度。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法,其特征在于,步驟S2中所述不規(guī)則像素塊進(jìn)行kmeans聚類區(qū)分出圖像背景,將不規(guī)則像素塊的Lab顏色空間中L層作為kmeans聚類的對(duì)象,具體的計(jì)算公式如下所述:
其中,E表示最小平方誤差,x表示每一個(gè)不規(guī)則像素塊,u表示質(zhì)心,g表示分類的簇,當(dāng)E最小時(shí)則kmeans聚類完成。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法,其特征在于,步驟S3所述的基于形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行圖像分割,具體步驟為:
S31:將去除背景后的圖像與DAB染色通道進(jìn)行掩膜處理,獲得去除背景的DAB染色通道圖像,并采用分水嶺算法分割圖像;
S32:提取經(jīng)分水嶺算法分割后的圖像特征,去掉疑似灰塵的區(qū)域,保留細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1和待處理的第一圖像C1。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法,其特征在于,所述圖像特征包括灰度均值,對(duì)比度,緊湊度和像素面積,所述疑似灰塵的區(qū)域設(shè)為對(duì)比度小于0.04或者灰度均值大于200的圖像區(qū)域,所述細(xì)胞核第一區(qū)域圖像L1設(shè)為40X放大倍數(shù)的像素面積小于2000且密度大于0.93的圖像區(qū)域,所述待處理的第一圖像C1設(shè)為40X放大倍數(shù)的像素面積大于2000的圖像區(qū)域。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法,其特征在于,步驟S4所述將待處理的第一圖像C1進(jìn)行局部閾值bernsen分割及形態(tài)學(xué)特征分割,具體步驟為:
S41:局部閾值bernsen分割的活動(dòng)窗口設(shè)為77*77像素大小,局部閾值bernsen分割后得到待處理第一圖像C1的二值化圖像,并與DAB染色通道進(jìn)行掩膜,得到DAB染色通道的待處理第一圖像C1細(xì)胞核區(qū)域圖像,執(zhí)行開(kāi)運(yùn)算后再進(jìn)行分水嶺分割;
S42:經(jīng)過(guò)局部閾值和分水嶺分割處理的圖像,進(jìn)行基于形態(tài)學(xué)特征的圖像分割,提取圖像特征,保留細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2和待處理的第二圖像C2。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的免疫組化病理圖像CD3陽(yáng)性細(xì)胞核分割方法,其特征在于,所述細(xì)胞核第二區(qū)域圖像L2設(shè)為40X放大倍數(shù)的像素面積小于2000且密度大于0.93的圖像區(qū)域,所述待處理的第二圖像C2設(shè)為40X放大倍數(shù)的像素面積大于2000的圖像區(qū)域。
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