[發明專利]一種基于G-四鏈體探針結構解旋的可視化識別microRNA的檢測方法有效
| 申請號: | 201910514343.2 | 申請日: | 2019-06-14 |
| 公開(公告)號: | CN110229872B | 公開(公告)日: | 2020-11-10 |
| 發明(設計)人: | 程靚;蘭玲;劉利 | 申請(專利權)人: | 中國科學院化學研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6816 | 分類號: | C12Q1/6816 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人: | 秦夢楠 |
| 地址: | 100190 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 四鏈體 探針 結構 可視化 識別 microrna 檢測 方法 | ||
1.一種檢測microRNA的方法,包括如下步驟:合成探針;所述探針由結合區段和信號區段組成;所述結合區段為與目標microRNA的全長序列反向互補的DNA片段;所述信號區段為可形成G-四鏈體結構的DNA片段;
如果所述探針與待測樣本進行DNA/RNA雜化反應后可以招募DNA聚合酶對探針的G-四鏈體結構進行解旋復制使其轉變為雙鏈結構,則待測樣本中含有目標microRNA;反之,待測樣本中不含有目標microRNA;
所述方法為非疾病診斷的方法。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于:
所述方法包括如下步驟:
(1)合成權利要求1中所述的探針;
(2)取步驟(1)所述探針,經過退火使所述探針的信號區段形成G-四鏈體結構;
(3)將步驟(2)的探針與待測樣本進行DNA/RNA雜化反應;
(4)完成步驟(3)后,向反應體系中加入DNA聚合酶進行解旋擴增反應;
(5)完成步驟(4)后,向反應體系中加入血紅素進行反應;血紅素可與未解旋的G-四鏈體結構結合形成具有催化功能的復合物;
(6)完成步驟(5)后,向反應體系中加入ABTS和H2O2進行催化反應后檢測420nm處吸收值;
所述方法設置空白對照;所述空白對照采用水替代待測樣本;將待測樣本在420nm處吸收值記為A,將空白對照在420nm處吸收值記為A0;A0-A的數值越大,待測樣本中目標miRNA的含量越多。
3.如權利要求1或2所述的方法,其特征在于:
當選用的DNA聚合酶的復制方向是3′→5′時,所述探針自5’端至3’端依次為信號區段和結合區段;當選用的DNA聚合酶的復制方向是5′→3′時,所述探針自5’端至3’端依次為結合區段和信號區段。
4.如權利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述探針的信號區段的長度小于30bp;所述信號區段形成G-四鏈體結構時,四聯體層數小于等于3。
5.如權利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述信號區段如序列表的序列1自5’端第1至19位所示。
6.如權利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述DNA聚合酶為Klenow Fragment聚合酶。
7.如權利要求2所述的方法,其特征在于:
所述步驟(3)中,所述探針在DNA/RNA雜化反應體系中的濃度為0.5-1μmol/L;
和/或,所述雜化反應溫度為20℃-37℃;
和/或,所述雜化反應時間為60-120min;
所述步驟(4)中,所述DNA聚合酶在解旋擴增反應體系中的濃度為0.1-0.3unit/μL;
和/或,所述解旋擴增反應時間為40-60min;
所述步驟(5)中,所述血紅素在反應體系中的濃度為2-4μmol/L;
和/或,所述反應時間為1-2h;
和/或,所述反應溫度為20℃-37℃。
8.權利要求1至5中任一所述方法中的所述探針在制備試劑盒中的應用;所述試劑盒的用途為檢測目標microRNA。
9.一種檢測microRNA的試劑盒,含有權利要求1至5中任一所述方法中的所述探針。
10.如權利要求9所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒還含有記載權利要求1至7任一所述方法的說明書。
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