[發(fā)明專利]鑒定香菇申香215菌種及其實(shí)質(zhì)性派生品種的單核體交配型的引物組,鑒定方法和應(yīng)用有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201910475026.4 | 申請(qǐng)日: | 2019-05-31 |
| 公開(公告)號(hào): | CN110029191B | 公開(公告)日: | 2022-09-06 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 張美彥;章爐軍;尚曉冬;宋春艷;于海龍;徐珍;王瑞娟;劉建雨;楊慧;譚琦 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6895 | 分類號(hào): | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京超凡宏宇專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 劉蘭 |
| 地址: | 201100 *** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 鑒定 香菇 215 菌種 及其 實(shí)質(zhì)性 派生 品種 單核 交配 引物 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種鑒定香菇申香215菌種及其實(shí)質(zhì)性派生品種的單核體交配型的引物組,其特征在于,所述引物組包含第一引物對(duì)、第二引物對(duì)、第三引物對(duì)和第四引物對(duì);
其中,第一引物對(duì)具有如SEQ ID NO.1-2所示的引物;第二引物對(duì)具有如SEQ ID NO.3-4所示的引物;第三引物對(duì)具有如SEQ ID NO.5-6所示的引物;第四引物對(duì)具有如SEQ IDNO.7-8所示的引物;所述引物組對(duì)應(yīng)的單核體交配型的分析方法為:若第一引物對(duì)和第三引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第二引物對(duì)和第四引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A1B1;若第一引物對(duì)和第四引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第二引物對(duì)和第三引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A1B2;若第二引物對(duì)和第三引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第一引物對(duì)和第四引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A2B1;若第二引物對(duì)和第四引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第一引物對(duì)和第三引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A2B2;若第一至第四引物均有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A1A2B1B2的雙核體。
2.一種鑒定香菇申香215菌種的單核體交配型的方法,其特征在于,其包括:使用權(quán)利要求1所述的第一至第四引物對(duì)分別對(duì)待測(cè)樣品的DNA模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
所述方法還包括交配型的分析,所述交配型的分析方法為:若第一引物對(duì)和第三引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第二引物對(duì)和第四引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A1B1;若第一引物對(duì)和第四引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第二引物對(duì)和第三引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A1B2;若第二引物對(duì)和第三引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第一引物對(duì)和第四引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A2B1;若第二引物對(duì)和第四引物對(duì)均有擴(kuò)增產(chǎn)物,而第一引物對(duì)和第三引物對(duì)均沒有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A2B2;若第一至第四引物均有擴(kuò)增產(chǎn)物,則判斷交配型為A1A2B1B2的雙核體。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述待測(cè)樣品的DNA模板為待測(cè)樣品的基因組DNA。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:將擴(kuò)增后的產(chǎn)物進(jìn)行電泳鑒定;所述電泳鑒定具體包括在擴(kuò)增產(chǎn)物或凝膠中添加熒光染料進(jìn)行擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定。
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR擴(kuò)增的條件為:在94-98℃預(yù)變性1-6min,94-95℃變性1-1.5min,第一引物對(duì)和第二引物對(duì)的退火溫度均為61-61.5℃,第三引物對(duì)和第四引物對(duì)的退火溫度均為61-63℃,退火時(shí)間為20s-90s,70-72℃延伸20-90s,29-42個(gè)循環(huán),最后在70-72℃保溫0-10min。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法,其特征在于,所述PCR擴(kuò)增的條件為:在94℃預(yù)變性5min,94℃變性1min,第一引物對(duì)和第二引物對(duì)的退火溫度均為61℃,第三引物對(duì)和第四引物對(duì)的退火溫度均為63℃,退火時(shí)間為60s,72℃延伸60s,35個(gè)循環(huán),最后在72℃保溫5min。
7.一種使用權(quán)利要求1所述的引物組制得的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒中包括多個(gè)檢測(cè)試劑,多個(gè)所述檢測(cè)試劑中分別添加有第一至第四引物對(duì)。
8.一種使用權(quán)利要求1所述的引物組制得的試紙條,其特征在于,所述試紙條上包被有第一至第四引物對(duì)。
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