[發(fā)明專利]探針組合物、包含其的試劑、試劑盒、檢測方法及應用

在審

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• 申請日: 2019-05-16
• 公開（公告）號: CN110184337A
• 公開（公告）日: 2019-08-30
• 發(fā)明（設計）人: 林志偉;李琳;呼錦濤;徐其隆;王遠;李瑞強
• 申請（專利權）人: 南京諾禾致源生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 北京康信知識產(chǎn)權代理有限責任公司 11240
• 代理人: 路秀麗

本發(fā)明提供了一種探針組合物、包含其的試劑、試劑盒、檢測方法及應用。該探針組合物包括檢測23種疾病的55個基因中的任意多個或全部基因的探針的組合。最多涵蓋了23種疾病的55個基因的相關突變位點，針對如此眾多的基因位點的探針組合物便于在一次同時檢測多種疾病相關的基因突變相關信息，最多時可同時檢測55個基因的所有突變信息。將本申請的探針組合物用于相關疾病檢測時，檢測效率高、成本低，適合用于對批量樣本進行篩查的場景中。

技術領域

本發(fā)明涉及基因檢測領域，具體而言，涉及一種探針組合物、包含其的試劑、試劑盒、檢測方法及應用。

背景技術

現(xiàn)階段遺傳代謝病的篩查還是以串聯(lián)質(zhì)譜為代表的傳統(tǒng)技術，但由于串聯(lián)質(zhì)譜檢測單一，只能在遺傳代謝病方面發(fā)揮優(yōu)勢，其具有假陽性率和假陰性率相對較高，存在對其他類型的單基因遺傳病無法進行檢測的局限性；絕大部份的疾病診斷和后期優(yōu)生優(yōu)育指導更依賴于基因數(shù)據(jù)進行診斷，主要由于一種代謝物可對應多種疾病，很難對某些疾病亞型做出準確判斷，還需要做基因診斷，所以在一些基因可以直接篩查診斷的疾病上，質(zhì)譜臨床路徑偏長，時間成本高，臨床效率偏低。此外大多數(shù)單基因遺傳病的基因檢測還是以低通量為主，研究某個基因的相關遺傳變異。而高通量測序技術在生命科學及醫(yī)學領域方面的研究和應用，可以高效的分析與挖掘測序得到的基因組大數(shù)據(jù)，提煉出與疾病相關的遺傳變異信息，并為疾病的篩查、治療和預防提供科學依據(jù)。

目標序列捕獲是通過將基因組特定區(qū)域進行富集后建庫測序，目前主流的方法為多重PCR法和液相雜交捕獲法。由于多重PCR法由于引物設計的局限性，因此適用于捕獲較小的區(qū)域，且試劑成本相對較高，不適合批量樣本的篩查工作。

基于液相雜交捕獲法的高通量測序，適合捕獲較大的區(qū)域，適合基因的全外顯子以及全長的檢測。

但目前已公開的對與遺傳疾病相關基因進行檢測的報道中，有對單一疾病進行檢測的，也有同時對單基因遺傳病突變位點、染色體疾病以及連鎖分析進行檢測的，但后者是通過對全基因組擴增以及目的基因突變位點擴增得到的產(chǎn)物同時進行建庫測序才能得到的，其主要應用在三代試管嬰兒領域，且檢測成本以及應用場景不適用于大批量樣本篩查工作。此外，還有對22種常見新生兒遺傳病相關的基因進行檢測的報道，但該方法采用多重PCR捕獲技術，成本較高，不適合在批量樣本篩查工作中應用。

因此，對批量樣本篩查而言，現(xiàn)有技術中還沒有成本較低的檢測方案。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的主要目的在于提供一種探針組合物、包含其的試劑、試劑盒、檢測方法及應用，以解決現(xiàn)有技術中難以低成本地對批量樣本進行多種遺傳病相關基因同時檢測的問題。

為了實現(xiàn)上述目的，根據(jù)本發(fā)明的一個方面，提供了一種探針組合物，探針組合物包括檢測如下表1所示的任意多個或全部基因的探針的組合：

表1:

。

進一步地，探針組合物包括檢測HBA1基因、HBA2基因和HBB基因的探針的組

合，檢測HBA1基因、HBA2基因和HBB基因的探針組合物為覆蓋HBA1、HBA2和

HBB基因全長的探針的組合；優(yōu)選地，檢測HBA1基因的探針包括SEQ ID NO:1至SEQ

ID NO:37所示探針；檢測HBA2基因的探針包括SEQ ID NO:38至SEQ ID NO:45所示

探針；檢測HBB基因的探針包括SEQ ID NO:46至SEQ ID NO:61所示的探針。