[發明專利]探針組合物、包含其的試劑、試劑盒、檢測方法及應用

在審

• 申請號: 201910407763.0
• 申請日: 2019-05-16
• 公開（公告）號: CN110184337A
• 公開（公告）日: 2019-08-30
• 發明（設計）人: 林志偉;李琳;呼錦濤;徐其隆;王遠;李瑞強
• 申請（專利權）人: 南京諾禾致源生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 北京康信知識產權代理有限責任公司 11240
• 代理人: 路秀麗

1.一種探針組合物，其特征在于，所述探針組合物包括檢測如下表1所示的任意多個或全部基因的探針的組合：

表1:

。

2.根據權利要求1所述的探針組合物，其特征在于，所述探針組合物包括檢測所述HBA1基因、HBA2基因和HBB基因的探針的組合，檢測所述HBA1基因、HBA2基因和HBB基因的探針組合物為覆蓋所述HBA1、HBA2和HBB基因全長的探針的組合；

優選地，檢測所述HBA1基因的探針包括SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:37所示探針；

檢測所述HBA2基因的探針包括SEQ ID NO:38至SEQ ID NO:45所示探針；

檢測所述HBB基因的探針包括SEQ ID NO:46至SEQ ID NO:61所示的探針。

3.根據權利要求1或2所述的探針組合物，其特征在于，所述探針組合物中，檢測編號為1至38及42至55的任一基因的探針的組合為覆蓋相應基因的外顯子區域和剪接位點區域的探針的組合；

優選地，每個所述探針的長度為100～150nt，更優選120nt；

優選地，每個所述探針的Tm值為40～70℃。

4.一種同時檢測多種疾病相關的基因的試劑，所述試劑包括探針，其特征在于，所述探針為權利要求1至3中任一項所述的探針組合物。

5.一種同時檢測多種疾病相關的基因的試劑盒，所述試劑盒包括探針，其特征在于，所述探針為權利要求1至3中任一項所述的探針組合物。

6.權利要求1至3中任一項所述的探針組合物在制備同時檢測多種疾病相關的基因的試劑盒中的應用。

7.根據權利要求6所述的應用，其特征在于，所述多種疾病包括如下疾病中的多種：原發性卟啉癥、高胰島素性低血糖血癥、黏多糖貯積癥、高苯丙氨酸血癥、生物素酶缺乏癥、瓜氨酸血癥I型、瓜氨酸血癥II型、甲基丙二酸血癥、鳥氨酸氨甲?；D移酶缺乏癥、戊二酸血癥、酰基輔酶A脫氫酶缺乏癥、長鏈3-羥?；o酶A脫氫酶缺乏癥、苯丙酮尿癥、糖原累積病、葡萄糖6-磷酸脫氫酶缺乏癥、肝豆狀核變性、原發性肉堿缺乏癥、非綜合征耳聾、地中海貧血、先天性甲狀腺功能減退癥、Noonan綜合征、X-連鎖腎上腺腦白質營養不良、長QT綜合征以及肥厚型心肌病。

8.一種同時檢測對多種疾病相關的基因的方法，其特征在于，所述方法包括：

構建待測樣本的DNA文庫；

利用捕獲探針對所構建的文庫進行雜交捕獲，得到雜交文庫；

對所述雜交文庫進行測序分析，獲得所述多種疾病相關的基因的信息；

其中，所述捕獲探針為權利要求1至3中任一項所述的探針組合物。

9.根據權利要求8所述的方法，其特征在于，所述構建待測樣本的DNA文庫的步驟包括：

提取所述待測樣本的DNA，所述待測樣本為濾紙片干血斑樣本；

利用40～60ng所述DNA構建所述DNA文庫；

優選地，提取所述濾紙片干血斑樣本的DNA的步驟包括：

將所述濾紙片干血斑樣本置于全自動液體處理工作站中進行DNA提取；

更優選地，將所述濾紙片干血斑樣本置于孔板中進行裂解；

將所述孔板置于所述全自動液體處理工作站中進行DNA提取。

10.根據權利要求9所述的方法，其特征在于，將所述濾紙片干血斑樣本置于孔板中進行裂解之前，所述方法還包括：

利用打孔器對所述濾紙片干血斑樣本進行打孔，獲取打孔樣本；

將所述打孔樣本置于所述孔板中；

向所述孔板中添加裂解液進行所述裂解；

優選地，所述打孔器的直徑為6～12mm；優選所述孔板為96孔板；優選所述裂解是在50～60℃孵育15～45min。