[發明專利]一種用于檢測鼠痘病毒的RPA試劑盒、引物、探針及方法在審
| 申請號: | 201910338683.4 | 申請日: | 2019-04-25 |
| 公開(公告)號: | CN111850099A | 公開(公告)日: | 2020-10-30 |
| 發明(設計)人: | 熊煒;薛俊欣;魏曉鋒;林穎崢;李健 | 申請(專利權)人: | 上海出入境檢驗檢疫局動植物與食品檢驗檢疫技術中心;上海實驗動物研究中心 |
| 主分類號: | C12Q1/6844 | 分類號: | C12Q1/6844;C12Q1/70;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海元一成知識產權代理事務所(普通合伙) 31268 | 代理人: | 吳桂琴 |
| 地址: | 200135 上*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 檢測 痘病毒 rpa 試劑盒 引物 探針 方法 | ||
1.一種用于檢測鼠痘病毒核酸的試劑盒,其包括RPA反應體系,其特征在于,所述的RPA反應體系包括RPA引物探針混合液,所述RPA引物探針混合液包括一引物對和探針,所述引物對的核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示,所述探針如SEQ ID NO.3+FAM-dt+THF+BHQ1-dt+SEQ ID NO.4+C3所示。
2.如權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述的RPA反應體系的引物的濃度均為5~20μM,較佳地為10μM;所述探針的濃度為5~10μM,較佳地為10μM。
3.如權利要求2所述的試劑盒,其特征在于,所述的RPA反應體系還包括核心反應液、反應緩沖液、Exo反應液、探針酶混合物、醋酸鎂和dNTP;較佳地:所述醋酸鎂的濃度為260~300μM,優選280μM;
和/或,所述dNTP的濃度為20~220μM,優選200μM。
4.如權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述的引物探針混合液由所述引物對和所述探針組成,所述引物對中各引物的量為2.1μL、濃度為10μM,所述探針的量為0.6μL、濃度為10μM;所述核心反應液的量為2.5μL,所述反應緩沖液的量為25μL,所述探針酶混合物的量為5μL,以及所述Exo反應液的量為1μL;所述醋酸鎂的量為2.5μL、濃度為280μM;所述dNTP的量為7.2μL、濃度為11mM;較佳地:所述的核心反應液為20倍核心反應液;
和/或,所述的反應緩沖液為2倍反應緩沖液;
和/或,所述的探針酶混合物為10倍探針酶混合物;
和/或,所述的Exo反應液為50倍Exo反應液。
5.如權利要求1~4任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒還包括陰性對照,所述的陰性對照優選ddH2O。
6.一種檢測鼠痘病毒核酸的引物對,其特征在于,所述的引物對的核苷酸序列分別如序列SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示;較佳地,所述的檢測為RPA檢測。
7.一種檢測鼠痘病毒核酸的探針,其特征在于,所述的探針如SEQ ID NO.3+FAM-dt+THF+BHQ1-dt+SEQ ID NO.4+C3所示;較佳地,所述的檢測為RPA檢測。
8.一種檢測鼠痘病毒核酸的組合,所述的組合包括引物對和探針,其特征在于,所述引物對的核苷酸序列分別如序列SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示;所述探針如SEQ ID NO.3+FAM-dt+THF+BHQ1-dt+SEQ ID NO.4+C3所示;較佳地,所述的檢測為RPA檢測。
9.如權利要求6所述的引物對和/或如權利要求7所述的探針,或權利要求8所述的組合在制備檢測鼠痘病毒的試劑盒中的應用。
10.一種非診斷目的的檢測鼠痘病毒的方法,其特征在于,其包括步驟:
(1)使用DNA提取試劑提取待檢樣品中的總DNA;
(2)以步驟(1)提取的總DNA為模板,用權利要求1~5任一項所述試劑盒中的RPA反應體系進行RPA反應,所述RPA反應中擴增反應的時間優選25min、溫度優選39℃;
(3)分析檢測結果。
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