[發(fā)明專利]一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法及應用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910286999.3 | 申請日： | 2019-04-11 |
| 公開（公告）號： | CN109880931A | 公開（公告）日： | 2019-06-14 |
| 發(fā)明（設計）人： | 婁麗娜;蘇小俊;劉曉宏;劉哲 | 申請（專利權）人： | 江蘇省農業(yè)科學院 |
| 主分類號： | C12Q1/6895 | 分類號： | C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 常州佰業(yè)騰飛專利代理事務所(普通合伙) 32231 | 代理人： | 高姍 |
| 地址： | 210014 江*** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 絲瓜 黃瓜花葉病毒 構建 分子標記 連鎖標記 遺傳圖譜 主效QTL 性狀 分子生物學技術 高通量測序 分離群體 開發(fā)周期 抗性表型 抗性鑒定 遺傳分析 分布圖 高通量 基因 表型 測序 可用 群體 應用 繪制 分析 開發(fā) | ||
1.一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法，其特征在于，包括如下步驟：
步驟1：高密度絲瓜遺傳圖譜的構建
定位分離群體的構建、絲瓜群體的黃瓜花葉病毒抗性鑒定、絲瓜抗黃瓜花葉病毒基因的遺傳分析、DNA提取及高通量測序；
步驟2：絲瓜抗CMV的QTL定位
根據F2的抗黃瓜花葉病毒的表型數據，采用R/qtl進行QTL定位分析，繪制病級性狀QTL分布圖。
2.如權利要求1所述的一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法，其特征在于，定位分離群體的構建，包括：以感CMV的絲瓜高代自交系“P1-21”為母本，以抗CMV的絲瓜高代自交系“P2-16”為父本，雜交獲得F1代，F1單株自交獲得F2代遺傳分離群體。
3.如權利要求1所述的一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法，其特征在于，絲瓜群體的黃瓜花葉病毒抗性鑒定，包括：絲瓜的黃瓜花葉病毒接種體系和抗性鑒定。
4.如權利要求1所述的一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法，其特征在于，絲瓜抗黃瓜花葉病毒基因的遺傳分析，包括：對F2群體及部分F2和F3群體的病毒病抗性進行鑒定及分析，明確絲瓜抗CMV基因的遺傳方式。
5.如權利要求1所述的一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法，其特征在于，DNA提取及高通量測序，包括：
采用CTAB法提取雙親及分離群體F2各單株絲瓜葉片的基因組DNA進行SLAF-Seq測序；
利用SLAF-seq技術和HighMap軟件對絲瓜物種F2遺傳分離群體開發(fā)高密度分子標簽；
篩選父母本都為雜合且親本間具有多態(tài)性的位點，作為符合群體特征的有效標簽，經過標記篩選，最終繪制出絲瓜高密度遺傳連鎖圖譜。
6.如權利要求5所述的一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法，其特征在于，絲瓜物種F2遺傳分離群體包括2個親本和130個子代。
7.如權利要求1所述的一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記方法，其特征在于，絲瓜抗CMV的QTL定位，包括：根據F2的抗黃瓜花葉病毒的表型數據，采用R/qtl進行QTL定位分析，根據連鎖群的信息和標記與性狀的連鎖關系，繪制病級性狀QTL分布圖。
8.一種絲瓜抗黃瓜花葉病毒CMV主效QTL的SLAF-SNP分子標記的應用，其特征在于，根據連鎖群的信息，對絲瓜黃瓜花葉病毒病的抗性表型和標記的連鎖關系進行關聯分析，獲得與性狀緊密關聯的分子標簽和候選區(qū)域。
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