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[發(fā)明專利]一種小片段stat1a/stat1b基因雙突變?nèi)笔桶唏R魚在審

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 201910275901.4 申請(qǐng)日: 2019-04-08
公開(公告)號(hào): CN110172481A 公開(公告)日: 2019-08-27
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 陳湘定;萬(wàn)思瑤;王焱;鄧云;鄧紅文;譚麗君;廖美 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 湖南師范大學(xué)
主分類號(hào): C12N15/90 分類號(hào): C12N15/90;C12N15/85;A01K67/027
代理公司: 長(zhǎng)沙新裕知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 43210 代理人: 周躍仁
地址: 410081 湖*** 國(guó)省代碼: 湖南;43
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 斑馬魚 突變?nèi)笔?/a> 靶位點(diǎn) 突變體 小片段 基因 遺傳 構(gòu)建表達(dá)載體 斑馬魚胚胎 基因缺失型 篩選 基因敲除 基因突變 體外合成 顯微注射 純合子 純合 純系 剪尾 質(zhì)粒 品系 注射 檢測(cè)
【說明書】:

一種小片段stat1a/stat1b基因雙突變?nèi)笔桶唏R魚,該斑馬魚獲得方法包括如下步驟:CRISPR/Cas9基因敲除靶位點(diǎn)設(shè)計(jì)構(gòu)建表達(dá)載體以及體外合成;斑馬魚胚胎的顯微注射;T7E1法和Sanger測(cè)序檢測(cè)靶位點(diǎn)的有效性;注射兩個(gè)月之后,進(jìn)行剪尾鑒定;目的序列的TA克隆;質(zhì)粒的Sanger測(cè)序;獲得可遺傳的斑馬魚突變體的F1代;獲得斑馬魚突變體的F2代純合子;依據(jù)步驟九方法進(jìn)行stat1a基因缺失型斑馬魚的F3代純系遺傳,得到stat1a?17的斑馬魚純合品系;篩選stat1b基因突變?nèi)笔桶唏R魚;篩選stat1a/stat1b基因雙突變?nèi)笔桶唏R魚。

技術(shù)領(lǐng)域

發(fā)明涉及CRISPR/Cas9基因打靶領(lǐng)域,特別涉及一種小片段 stat1a/stat1b基因雙突變?nèi)笔桶唏R魚。

背景技術(shù)

STAT1(signal transducer and activator of transcription 1)基因位于人類2q32.3,是編碼750個(gè)氨基酸的轉(zhuǎn)錄因子。一般認(rèn)為該基因介導(dǎo)干擾素信號(hào)通路,可直接調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄,并參與細(xì)胞增殖與分化等過程。通過基因差異表達(dá)譜分析和基因組關(guān)聯(lián)分析等,發(fā)現(xiàn)STAT1 基因與骨質(zhì)疏松密切相關(guān)。

斑馬魚與人類在骨骼發(fā)育過程中的基因、信號(hào)通路有高度同源性,且STAT1基因進(jìn)化上較為保守,人類STAT1基因的兩個(gè)不同剪接體 STAT1-alpha和STAT1-beta對(duì)應(yīng)于斑馬魚兩個(gè)不同基因stat1a和 stat1b,研究發(fā)現(xiàn)stat1b和stat1b在斑馬魚胚胎早期表達(dá)量特別高。而且,與其他動(dòng)物模型相比,斑馬魚個(gè)體小、幼魚通體透明,利于骨骼發(fā)育的觀察。

通過CRISPR/Cas9基因打靶技術(shù),分別在斑馬魚stat1a和stat1b 基因上設(shè)計(jì)合適的打靶位點(diǎn),將體外合成的特異性sgRNA(終濃度 20ng/μL)和Cas9-mRNA(終濃度300ng/μL)顯微共注射進(jìn)斑馬魚一細(xì)胞內(nèi),并通過活性檢測(cè)證實(shí)了所選位點(diǎn)的有效性。

發(fā)明內(nèi)容

為解決上述現(xiàn)有技術(shù)存在的問題,本發(fā)明的目的在于提供一種小片段stat1a/stat1b基因雙突變?nèi)笔桶唏R魚。

為達(dá)到上述目的,本發(fā)明的技術(shù)方案為:

一種小片段stat1a/stat1b基因雙突變?nèi)笔桶唏R魚,該斑馬魚獲得方法包括如下步驟:

步驟一、CRISPR/Cas9基因敲除靶位點(diǎn)設(shè)計(jì)

在NCBI上查詢斑馬魚stat1a基因的基因組DNA序列及其功能結(jié)構(gòu)域,根據(jù)CRISPR/Cas9敲除原理,設(shè)計(jì)一對(duì)stat1a基因的靶位點(diǎn),靶點(diǎn)的選擇遵循此標(biāo)準(zhǔn):5'-GG-(N)18-NGG-3':其中5'端的二核普酸是T7啟動(dòng)子的一部分,靶位點(diǎn)的3'端是NGG;

步驟二、構(gòu)建表達(dá)載體以及體外合成

步驟三、斑馬魚胚胎的顯微注射

在受精30min后之內(nèi),用吸管吸取胚胎轉(zhuǎn)移至用瓊脂糖制作的顯微注射專用培養(yǎng)皿中;在進(jìn)行顯微注射之前,將Cas9 mRNA和gRNA 配成混合液,充分混勻,使Cas9 mRNA的終濃度為300ng/μL,gRNA 的終濃度為20ng/μL,注射1.8nLCas9 mRNA和gRNA混合液于一細(xì)胞期的受精卵內(nèi),注射過的受精卵放置于置于5mmol/L NaCl、 0.33mmol/L CaCl2、0.33mmol/L MgSO4、0.17mmol/L KCl的E3水中,28℃孵化,在體視顯微鏡下觀察胚胎表型,篩選正常發(fā)育的胚胎用于靶位點(diǎn)突變分析;

步驟四、T7E1法和Sanger測(cè)序檢測(cè)靶位點(diǎn)的有效性

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