[發(fā)明專利]轉(zhuǎn)基因玉米品系DAS40278-9檢測方法和試劑在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910266719.2 | 申請日: | 2019-04-03 |
| 公開(公告)號: | CN109825632A | 公開(公告)日: | 2019-05-31 |
| 發(fā)明(設計)人: | 潘廣;凌杏園;章桂明;劉新嬌;向才玉;盧小雨;李芳榮;楊帆 | 申請(專利權)人: | 深圳出入境檢驗檢疫局食品檢驗檢疫技術中心 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權代理有限公司 44281 | 代理人: | 李小焦;彭家恩 |
| 地址: | 518045 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 轉(zhuǎn)基因玉米品系 外源基因 探針 微滴 品系 檢測 拷貝數(shù) 申請 讀取 特異性引物 玉米基因組 玉米轉(zhuǎn)基因 礦物油 成分研究 定量檢測 擴增信號 內(nèi)源基因 雙通道法 特異引物 玉米產(chǎn)品 玉米品系 重要意義 基因 轉(zhuǎn)基因 混勻 | ||
1.一種轉(zhuǎn)基因玉米品系DAS40278-9的檢測方法,其特征在于:包括以下步驟,
PCR擴增體系配制步驟,包括將品系DAS40278-9特異引物組、品系DAS40278-9特異探針、HMG基因特異引物組、HMG基因特異探針和待測樣品的DNA加入到PCR反應液中,制成雙重PCR反應體系;
微滴生成步驟,包括在雙重PCR反應體系中加入微滴生成油,混勻后,將其轉(zhuǎn)移到微滴生成儀上,震蕩生成微滴;
PCR反應和微滴分析步驟,包括將微滴轉(zhuǎn)移到反應管中進行PCR反應,PCR反應結束后,采用微滴分析儀讀取每個微滴的擴增信號;
定量檢測步驟,根據(jù)讀取的擴增信號,采用軟件分析品系DAS40278-9的特異擴增拷貝數(shù)占內(nèi)源參考基因HMG基因特異擴增拷貝數(shù)的百分比,以此表示轉(zhuǎn)基因玉米品系DAS40278-9的含量;
所述品系DAS40278-9特異引物組的正向引物為Seq ID No.1所示序列,品系DAS40278-9特異引物組的反向引物為Seq ID No.2所示序列,所述品系DAS40278-9特異探針為Seq IDNo.3所示序列,所述HMG基因特異引物組的正向引物為Seq ID No.4所示序列,HMG基因特異引物組的反向引物為Seq ID No.5所示序列,所述HMG基因特異探針為Seq ID No.6所示序列;
Seq ID No.1:5’-CACGAACCATTGAGTTACAATC-3’
Seq ID No.2:5’-TGGTTCATTGTATTCTGGCTTTG-3’
Seq ID No.3:5’-CGTAGCTAACCTTCATTGTATTCCG-3’
Seq ID No.4:5’-TTGGACTAGAAATCTCGTGCTGA-3’
Seq ID No.5:5’-GCTACATAGGGAGCCTTGTCCT-3’
Seq ID No.6:5’-CAATCCACACAAACGCACGCGTA-3’
其中,Seq ID No.3所示序列的品系DAS40278-9特異探針中,5’末端具有熒光基團,3’末端具有淬滅基團;Seq ID No.6所示序列的HMG基因特異探針中,5’末端具有熒光基團,3’末端具有淬滅基團。
2.根據(jù)權利要求1所述的檢測方法,其特征在于:所述品系DAS40278-9特異探針中,5’末端的熒光基團為FAM,3’末端的淬滅基團為BHQ-1;所述HMG基因特異探針中,5’末端的熒光基團為HEX,3’末端的淬滅基團為BHQ-1。
3.一種轉(zhuǎn)基因玉米品系DAS40278-9定量檢測的試劑,其特征在于:所述試劑包括第一引物探針組合和第二引物探針組合,所述第一引物探針組合用于轉(zhuǎn)基因玉米品系DAS40278-9特異性檢測,所述第二引物探針組合用于HMG基因特異性檢測;
所述第一引物探針組合中,正向引物為Seq ID No.1所示序列,反向引物為Seq IDNo.2所示序列,探針為Seq ID No.3所示序列,并且探針的5’末端具有熒光基團,3’末端具有淬滅基團;
所述第二引物探針組合中,正向引物為Seq ID No.4所示序列,反向引物為Seq IDNo.5所示序列,探針為Seq ID No.6所示序列,并且探針的5’末端具有熒光基團,3’末端具有淬滅基團。
4.根據(jù)權利要求3所述的試劑,其特征在于:Seq ID No.3所示序列的探針中,5’末端的熒光基團為FAM,3’末端的淬滅基團為BHQ-1;Seq ID No.6所示序列的探針中,5’末端的熒光基團為HEX,3’末端的淬滅基團為BHQ-1。
5.根據(jù)權利要求3或4所述的試劑在制備轉(zhuǎn)基因玉米檢測試劑盒或檢測設備中的應用。
6.一種轉(zhuǎn)基因玉米檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑盒中含有權利要求3或4所述的試劑。
7.根據(jù)權利要求6所述的轉(zhuǎn)基因玉米檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑盒采用權利要求1或2所述的檢測方法對轉(zhuǎn)基因玉米品系DAS40278-9進行定量檢測。
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