[發明專利]一種雙sgRNA位點敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系統與應用在審
| 申請號: | 201910242004.3 | 申請日: | 2019-03-28 |
| 公開(公告)號: | CN109929845A | 公開(公告)日: | 2019-06-25 |
| 發明(設計)人: | 趙恩峰;賀小宏;王延賓;任江濤;韓露 | 申請(專利權)人: | 南京北恒生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/113 | 分類號: | C12N15/113;C12N15/90;C12N9/22;C12N15/66;C12N5/10;C12Q1/686 |
| 代理公司: | 南京眾聯專利代理有限公司 32206 | 代理人: | 盧倩 |
| 地址: | 210046 江蘇省南京市*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 敲除 基因 外顯子 位點 生物工程技術領域 電泳 鑒定成本 相關基因 腫瘤發生 轉染細胞 突變型 細胞株 除法 個位 雙位 切割 應用 成功 | ||
1.一種敲除RSPH6A基因的sgRNA,其特征在于,包括RSPH6A sgRNA-1和RSPH6A sgRNA-2;
所述RSPH6A sgRNA-1的序列如下:
RSPH6A sgRNA-1:TCTTTCGGGCGTTCACGATC;
RSPH6A sgRNA-1 oligo1:5’-caccgTCTTTCGGGCGTTCACGATC-3’;
RSPH6A sgRNA-1 oligo2:5’-aaacGATCGTGAACGCCCGAAAGAc-3’;
所述RSPH6A sgRNA-2的序列如下:
RSPH6A sgRNA-2:GGCCCAGATAGCCCGCATCT;
RSPH6A sgRNA-2 oligo1:5’-caccgGGCCCAGATAGCCCGCATCT-3’;
RSPH6A sgRNA-2 oligo2:5’-aaacAGATGCGGGCTATCTGGGCCc-3’。
2.一種雙sgRNA位點靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系統,其特征在于,包括權利要求1所述RSPH6A sgRNA-1和RSPH6A sgRNA-2的DNA序列。
3.如權利要求2所述的雙sgRNA位點靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系統的構建方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟1,使用BsmbI酶切CRISPR/Cas9載體LentiCRISPR V2,得到酶切后的載體;
步驟2,將所述靶向敲除RSPH6A基因的sgRNA的DNA序列磷酸化后與酶切后的LentiCRISPR-V2載體連接,得到得到靶向敲除RSPH6A基因的LentiCRISPR V2-RSPH6AsgRNA-1&LentiCRISPR V2-RSPH6A sgRNA-2,構建靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系統。
4.如權利要求2或3所述靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系統在制備敲除RSPH6A基因的細胞株中的應用。
5.一種敲除RSPH6A基因的細胞株,其特征在于,所述細胞株是運用權利要求2所述雙sgRNA位點靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系統進行靶向敲除得到的細胞中的RSPH6A基因缺失的細胞株。
6.如權利要求5所述敲除RSPH6A基因的細胞株,其特征在于,所述細胞株為A549細胞株。
7.如權利要求5所述敲除RSPH6A基因的細胞株,其特征在于,所述RSPH6A基因的具體靶向敲除位點為:
AGGATGTGCTGTGTGTGATGCACCCAGTTGGCCATGGAGTCGACCAGCTCCAGCACGGGGATGCCCTCGAAGTCCGGGTTCTCCTCGTAGGAGTCGCGCCCAGCACCACCTTCCTCCTCCTCGTCGCCCTCCTCCTCACTAAACTGGTAGAAGCCCAGCGGGCTGACCTGCGTGGCGGCCAGAT-------------------------------------------------------TCTCGGGCTGGAGTGACGTGGGGCAGCCGCGTCCATGGCAGGCCCGGCTCGTTGCACACAAAGTACAGGTACTTGTTGGCGCCTGAGCGGCTCTCCTCCTTGGGGATCACGGGCGGCGGCTTCCATACGGACTTAGGGACGATGTCCACGGCCTTCTCCTCGTCCTCCTCGCCCTCCTCCTCGCCGTGCGCCTCCATGACCTCGCCACCTTCCGTCATCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCTCGCCCTCCCGGAATTCCACCTCGGCCACCAGGTAGCTGCGTTTGATTCCCAGGAT。
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