[發明專利]水稻轉錄因子BTF3在鑒別粳稻和秈稻中的應用以及一種鑒別粳稻和秈稻的方法

在審

• 申請號: 201910073594.1
• 申請日: 2019-01-25
• 公開（公告）號: CN111485030A
• 公開（公告）日: 2020-08-04
• 發明（設計）人: 王曼;陳杰湖;張群宇;劉偉;林銳松
• 申請（專利權）人: 華南農業大學;廣州瑞科基因科技有限公司;廣州美斛健生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895
• 代理公司: 北京高沃律師事務所 11569
• 代理人: 劉奇

1.水稻轉錄因子BTF3在鑒別粳稻和秈稻中的應用。

2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述轉錄因子BTF3包括位于水稻基因組3號染色體、BTF3序列完整cds序列第409位堿基的多態性為C/T的核苷酸序列。

3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，粳稻的轉錄因子BTF3中包括位于水稻基因組3號染色體、BTF3序列完整cds序列第409位堿基的多態性為T的核苷酸序列。

4.根據權利要求3所述的轉錄因子BTF3，其特征在于，所述粳稻的轉錄因子BTF3的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

5.根據權利要求2所述的水稻轉錄因子BTF3，其特征在于，秈稻的轉錄因子BTF3中包括水稻基因組3號染色體、BTF3序列完整cds序列第409位堿基的多態性為C的核苷酸序列。

6.根據權利要求5所述的水稻轉錄因子BTF3，其特征在于，所述秈稻的轉錄因子BTF3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

7.一種鑒別粳稻和秈稻的方法，包括以下步驟：

1)提取待測水稻的基因組DNA；

2)設計權利要求1～6所述應用中的轉錄因子BTF3的PCR引物對；

3)利用步驟2)所述引物對擴增步驟1)所述基因組DNA，得到目的序列；

4)采用能夠區分位于水稻基因組3號染色體、BTF3序列完整cds序列第409位堿基的多態性位點C/T、并且在所述轉錄因子BTF3中有且只有一個酶切位點的限制性內切酶對步驟3)得到的目的產物酶切，若酶切產物中存在兩個片段，則判斷待測水稻為粳稻；若酶切產物中僅存在一個片段，則判斷待測水稻為秈稻。

8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，步驟2)設計得到的引物對中，上游序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，下游序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。

9.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，步驟4)所述的限制性內切酶為Alu I。