[發(fā)明專利]用于檢測癌癥的非編碼RNA

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201880073234.5
• 申請(qǐng)日: 2018-11-09
• 公開（公告）號(hào): CN111344409A
• 公開（公告）日: 2020-06-26
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: H·古達(dá)茲
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 加利福尼亞大學(xué)董事會(huì)
• 主分類號(hào): C12N15/113
• 分類號(hào): C12N15/113;C12Q1/6886
• 代理公司: 上海專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 31100
• 代理人: 陶家蓉;楊昀

1.一種診斷受試者患有良性、惡性前或惡性過度增殖細(xì)胞的方法，其包含：

檢測樣品中至少一種非編碼RNA或其功能片段的存在、不存在和/或量。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述受試者是被診斷患有或疑似患有乳腺癌的人。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中在所述檢測步驟之前是從所述受試者獲取樣品的步驟。

4.根據(jù)權(quán)利要求1至3中任一項(xiàng)所述的方法，其進(jìn)一步包含將來自受試者的樣品暴露于與選自SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：201的非編碼RNA中的一種或組合互補(bǔ)的至少一種核酸分子或者與表1、表2和/或表3的任何核酸包含至少70％，80％，85％，90％，95％，96％，97％，98％，99％序列同源性的非編碼核酸序列中的一種或組合。

5.根據(jù)權(quán)利要求1至4中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述至少一種非編碼RNA是T3p或其功能片段。

6.根據(jù)權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述檢測步驟進(jìn)一步包含檢測BRCA基因表達(dá)的存在、不存在和/或量。

7.根據(jù)權(quán)利要求1至6中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述檢測樣品中至少一種非編碼RNA或其同源序列的存在、不存在和/或量的步驟包含將所述樣品與特異于所述至少一種非編碼RNA或其功能片段的一種或多種探針接觸，以及用得自對(duì)照樣品的測量值對(duì)樣品中的量進(jìn)行歸一化。

8.根據(jù)權(quán)利要求1至7中任一項(xiàng)所述的方法，其進(jìn)一步包含相對(duì)于對(duì)照樣品中至少一種非編碼RNA或其同源序列的量的測量，將所述樣品中至少一種非編碼RNA或其同源序列的量與所述受試者具有良性、惡性前或惡性生長的概率或可能性相關(guān)聯(lián)。

9.根據(jù)權(quán)利要求1至8中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述良性、惡性前或惡性過度增殖細(xì)胞來自乳腺組織。

10.根據(jù)權(quán)利要求1至9中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述樣品是來自受試者的血液或血清。

11.根據(jù)權(quán)利要求1至10中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述方法診斷所述受試者中選自一種或多種基底癌癥或管腔癌癥的惡性前或惡性過度增殖細(xì)胞的存在。

12.根據(jù)權(quán)利要求1至11中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述樣品取自用來自受試者的至少一種細(xì)胞接種(seeded)或接種(inoculated)的細(xì)胞培養(yǎng)物。

13.根據(jù)權(quán)利要求1至12中任一項(xiàng)所述的方法，其進(jìn)一步包含在足以使來自受試者乳腺組織的至少一種細(xì)胞生長的條件和時(shí)間段下用培養(yǎng)基培養(yǎng)來自所述受試者的至少一個(gè)活組織檢查物。

14.根據(jù)權(quán)利要求1至6中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述測量樣品中至少一種非編碼RNA或其功能片段的量的步驟包含以下的一種或組合：對(duì)樣品進(jìn)行數(shù)字成像；將樣品暴露于已知量的標(biāo)記抗體，所述標(biāo)記抗體對(duì)非編碼RNA或其功能片段的表位具有特異性；將樣品暴露于一種或多種染料，所述染料對(duì)非編碼RNA或其功能片段具有特異性；將樣品暴露于至少一種標(biāo)記探針，所述標(biāo)記探針與所述非編碼RNA或其功能片段的序列互補(bǔ)；將樣品暴露于色譜分析法；分離出樣品的總RNA；以及將所述總RNA暴露于測序分析和/或?qū)⑺鰳悠繁┞队谫|(zhì)譜分析法。

15.根據(jù)權(quán)利要求14所述的方法，其進(jìn)一步包含分析來自所述樣品的細(xì)胞的形態(tài)。

16.根據(jù)權(quán)利要求1至15中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述樣品是人類組織樣品，所述人類組織樣品包含來自受試者的血漿、血清或血液抽取物、刷洗物、活組織檢查物或外科手術(shù)切除的組織或液體樣品。