[發(fā)明專利]透明細胞腎細胞癌生物標志物

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201880071330.6
• 申請日: 2018-09-05
• 公開（公告）號: CN111630183A
• 公開（公告）日: 2020-09-04
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 姚曉賽;陳文煒;B·T·鄭;譚靜;邵慧琳;J·許
• 申請（專利權(quán)）人: 新加坡科技研究局;新加坡保健服務(wù)集團有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G01N33/574
• 代理公司: 北京世峰知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11713
• 代理人: 康健;王思琪

本文公開了透明細胞腎細胞癌(ccRCC)生物標志物組，所述生物標志物組包括選自由ZNF395、SMPDL3A、SLC28A1、SLC6A3、VEGFA、EGLN3組成的組的至少2種生物標志物，其中所述至少兩種生物標志物中的一種為SMPDL3A或SLC28A1。本文還公開了一種使用本文公開的生物標志物組的檢測系統(tǒng)、確定受試者是否患有透明細胞腎細胞癌或顯示透明細胞腎細胞癌復(fù)發(fā)的方法、確定腎腫塊樣品是良性還是惡性的方法、檢測受試者對全身治療的反應(yīng)的方法以及用于進行所述方法的試劑盒。

相關(guān)申請的交叉引用

本申請要求2017年9月5日提交的新加坡申請第10201707218R號的優(yōu)先權(quán)權(quán)益，其內(nèi)容通過引用整體并入本文用于所有目的。

發(fā)明領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子生物學，特別是生物標志物。特別地，本發(fā)明涉及與透明細胞腎細胞癌(ccRCC)相關(guān)的生物標志物及其方法和用途。

發(fā)明背景

腎細胞癌(RCC)由于經(jīng)常在晚期診斷出和差的治療選擇而成為最致命的癌癥之一。成功治愈該疾病取決于RCC的早期檢測和惡性細胞的完全切除。由于腎位于腹膜后間隙深處，因此腎細胞癌在早期主要是無癥狀的，并且一經(jīng)診斷出，腫瘤大和/或轉(zhuǎn)移。腎細胞癌的三種最常見的亞型是透明細胞腎細胞癌、乳頭狀腎細胞癌和嫌色性腎細胞癌。透明細胞腎細胞癌是最常見的亞型，占所有腎細胞癌的75-90％，并且在2012年，全球有338,000例新病例。

由于大多數(shù)透明細胞腎細胞癌耐受化學療法和放射療法，患有轉(zhuǎn)移性透明細胞腎細胞癌的患者表現(xiàn)出令人沮喪的8％的5年總生存期。甚至早期腫瘤在手術(shù)后仍處于轉(zhuǎn)移進展的風險，其中20-40％的患者具有復(fù)發(fā)。因此，鑒定這種高風險的腎細胞癌患者組仍是一個挑戰(zhàn)。此外，腎細胞癌的不同亞型具有不同的預(yù)后和治療反應(yīng)率。因此，至關(guān)重要的是能夠區(qū)分腎細胞癌的不同亞型。

先前用于診斷患有透明細胞腎細胞癌的患者的方法包括侵入性方法，包括腫瘤活組織檢查，或成像方法(包括超聲成像或磁共振成像)。然而，基于已知的方法，難以確定小于4cm的腎腫塊(mass)是否是腫瘤和/或難以基于單獨的成像研究確定腫瘤是良性還是惡性的。約50％至60％的腎腫塊小于4cm，其中25％至30％為良性腫瘤。小的腎腫塊的過度治療風險的范圍為從直徑小于1cm的病灶的40％到直徑為3至4cm的腫塊的17％。除初步診斷外，用于治療后隨訪或主動監(jiān)測的主要工具也僅包括成像研究。手術(shù)或消融會導(dǎo)致組織變化和瘢痕形成，導(dǎo)致局部復(fù)發(fā)的檢測具有挑戰(zhàn)性。最后，還缺乏評估晚期透明細胞腎細胞癌患者中全身治療的效率的方法。鑒于上述情況，對鑒定透明細胞腎細胞癌的方法、區(qū)分良性病灶與惡性腫瘤的方法、檢測局部治療后復(fù)發(fā)的方法以及評估全身治療的方法存在未被滿足的需求。

發(fā)明概述

在一方面，本發(fā)明涉及透明細胞腎細胞癌(ccRCC)生物標志物組，其中所述生物標志物組包括選自由ZNF395、SMPDL3A、SLC28A1、SLC6A3、VEGFA、EGLN3組成的組的至少兩種生物標志物，其中所述至少兩種生物標志物中的一種為SMPDL3A或SLC28A1；其中生物標志物是蛋白或編碼其的核酸或其變體。

在另一方面，本發(fā)明涉及檢測系統(tǒng)，所述檢測系統(tǒng)包括a)接收部分，所述接收部分接收來自被懷疑罹患透明細胞腎細胞癌的受試者的樣品，并且其中所述樣品被懷疑包含如本文公開的生物標志物組；和b)檢測部分，所述檢測部分包含能夠檢測如本文公開的生物標志物組的一種或更多種物質(zhì)。

在一方面，本發(fā)明涉及確定受試者是否患有透明細胞腎細胞癌或是否顯示出透明細胞腎細胞癌的復(fù)發(fā)的方法，其中所述方法包括獲得來自所述受試者的樣品；使用如本文公開的檢測系統(tǒng)檢測所述樣品中如本文公開的生物標志物組的存在，其中生物標志物組的存在確定所述受試者患有透明細胞腎細胞癌或顯示出透明細胞腎細胞癌的復(fù)發(fā)。