[發(fā)明專(zhuān)利]微生物組健康指數(shù)

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201880066008.4
• 申請(qǐng)日: 2018-10-12
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN111247254A
• 公開(kāi)（公告）日: 2020-06-05
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 肯尼斯·F·布朗特;威廉姆·道格拉斯·香農(nóng);埃琳娜·戴池;考特尼·瓊斯;格雷戈里·J·弗盧特
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 雷柏奧提斯有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/689
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/689
• 代理公司: 上海和躍知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 31239
• 代理人: 尹洪波

公開(kāi)了用于評(píng)估微生物群的方法。用于評(píng)估微生物群的示例方法可以包括從患者獲取糞便樣品；量化來(lái)自糞便樣品中的選定的綱類(lèi)組的細(xì)菌的相對(duì)豐度；根據(jù)來(lái)自選定的綱類(lèi)組的細(xì)菌的相對(duì)豐度，計(jì)算微生物組健康指數(shù)，以及將微生物組健康指數(shù)與患者的身體狀況相關(guān)聯(lián)。

優(yōu)先權(quán)要求

本申請(qǐng)根據(jù)35U.S.C.§119主張于2017年10月13日提交的美國(guó)臨時(shí)專(zhuān)利申請(qǐng)No.62/571,907的優(yōu)先權(quán)，其公開(kāi)內(nèi)容以引用方式全文并入于此。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及腸道微生物組。更具體地，本發(fā)明涉及平衡微生物組、治療微生物組、通過(guò)檢查微生物組來(lái)評(píng)估醫(yī)學(xué)疾病和/或通過(guò)檢查微生物組來(lái)評(píng)估醫(yī)學(xué)治療。

發(fā)明背景

多種醫(yī)學(xué)疾病和/或身體狀況可能與腸道微生物組有關(guān)。

發(fā)明內(nèi)容

公開(kāi)了一種用于評(píng)估微生物群的方法。該方法包含：獲取糞便樣品；以及量化來(lái)自糞便樣品中的選定的綱類(lèi)組的細(xì)菌相對(duì)豐度；根據(jù)來(lái)自選定的綱類(lèi)組的細(xì)菌相對(duì)豐度，計(jì)算微生物組健康指數(shù)；以及考慮計(jì)算出的微生物組健康指數(shù)來(lái)評(píng)估糞便樣品的微生物群。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，糞便樣品可以來(lái)自一個(gè)人或來(lái)自多個(gè)人。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，選定的綱類(lèi)組包括來(lái)自擬桿菌綱的細(xì)菌。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，選定的綱類(lèi)組包括來(lái)自梭菌綱的細(xì)菌。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，選定的綱類(lèi)組包括來(lái)自γ-變形菌綱的細(xì)菌。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，選定的綱類(lèi)組包括來(lái)自芽孢桿菌綱的細(xì)菌。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，計(jì)算微生物組健康指數(shù)包括確定相對(duì)細(xì)菌豐度的第一總數(shù)，細(xì)菌豐度的第一總數(shù)等于細(xì)菌的第一綱類(lèi)的第一相對(duì)豐度和細(xì)菌的第二綱類(lèi)的第二相對(duì)豐度之和；確定相對(duì)細(xì)菌豐度的第二總數(shù)，細(xì)菌豐度的第二總數(shù)等于細(xì)菌的第三綱類(lèi)的第三相對(duì)豐度與細(xì)菌的第四綱類(lèi)的第四相對(duì)豐度之和；以及將相對(duì)細(xì)菌豐度的第一總數(shù)除以相對(duì)細(xì)菌豐度的第二總數(shù)。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，細(xì)菌的第一相對(duì)豐度是來(lái)自糞便樣品中擬桿菌綱類(lèi)的細(xì)菌相對(duì)豐度。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，細(xì)菌的第二相對(duì)豐度是來(lái)自糞便樣品中梭菌綱類(lèi)的細(xì)菌相對(duì)豐度。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，細(xì)菌的第三相對(duì)豐度是來(lái)自糞便樣品中γ-變形菌綱類(lèi)的細(xì)菌相對(duì)豐度。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，細(xì)菌的第四相對(duì)豐度是來(lái)自糞便樣品中芽孢桿菌綱類(lèi)的細(xì)菌相對(duì)豐度。

公開(kāi)了一種用于評(píng)估治療的方法。該方法包含：治療患者的醫(yī)學(xué)疾病；在治療后從治療后的患者那里獲取糞便樣品；根據(jù)來(lái)自治療后糞便樣品中選定的綱類(lèi)組的細(xì)菌相對(duì)豐度，計(jì)算微生物組健康指數(shù)；以及考慮微生物組健康指數(shù)來(lái)評(píng)估治療該患者醫(yī)學(xué)疾病的效果。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，用于評(píng)估治療的方法進(jìn)一步包含量化來(lái)自糞便樣品中的選定的綱類(lèi)組的細(xì)菌相對(duì)豐度。

對(duì)于上述實(shí)施例中的任一個(gè)來(lái)說(shuō)替代地或額外地，用于評(píng)估治療的方法進(jìn)一步包括在治療之前從患者那里獲取治療前的糞便樣品，并根據(jù)來(lái)自治療前的糞便樣品中選定的綱類(lèi)組的細(xì)菌相對(duì)豐度，計(jì)算另一個(gè)微生物組健康指數(shù)。并且進(jìn)一步地在一些實(shí)施方案中，該方法進(jìn)一步包含將治療前的糞便樣品的微生物組健康指數(shù)與治療后的糞便樣品的微生物組健康指數(shù)進(jìn)行比較以評(píng)估治療的效果。