[發明專利]微生物組健康指數

在審

• 申請號: 201880066008.4
• 申請日: 2018-10-12
• 公開（公告）號: CN111247254A
• 公開（公告）日: 2020-06-05
• 發明（設計）人: 肯尼斯·F·布朗特;威廉姆·道格拉斯·香農;埃琳娜·戴池;考特尼·瓊斯;格雷戈里·J·弗盧特
• 申請（專利權）人: 雷柏奧提斯有限公司
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689
• 代理公司: 上海和躍知識產權代理事務所(普通合伙) 31239
• 代理人: 尹洪波

1.一種用于評估微生物群的方法，所述方法包含：

從患者獲取糞便樣品；

量化來自所述糞便樣品中的選定的綱類組的細菌的相對豐度；

根據來自所述選定的綱類組的細菌相對豐度，計算微生物組健康指數；以及

將所述微生物組健康指數與所述患者的身體狀況關聯。

2.如權利要求1所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自擬桿菌綱的細菌。

3.如權利要求1-2任一項所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自梭菌綱的細菌。

4.如權利要求1-3任一項所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自γ-變形菌綱的細菌。

5.如權利要求1-4任一項所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自芽孢桿菌綱的細菌。

6.如權利要求1-5任一項所述的方法，其中所述計算微生物組健康指數包括確定相對細菌豐度的第一總數，其等于第一綱細菌的第一相對豐度和第二綱細菌的第二相對豐度之和；

確定相對細菌豐度的第二總數，其等于第三綱細菌的第三相對豐度與第四綱細菌的第四相對豐度之和；以及

將所述相對細菌豐度的第一總數除以所述相對細菌豐度的第二總數。

7.如權利要求6所述的方法，其中細菌的所述第一相對豐度是來自所述糞便樣品中擬桿菌綱的細菌的相對豐度。

8.如權利要求6-7任一項所述的方法，其中細菌的所述第二相對豐度是來自所述糞便樣品中梭菌綱的細菌的相對豐度。

9.如權利要求6-8任一項所述的方法，其中細菌的所述第三相對豐度是來自所述糞便樣品中γ-變形菌綱的細菌的相對豐度。

10.如權利要求6-9任一項所述的方法，其中細菌的所述第四相對豐度是來自所述糞便樣品中芽孢桿菌綱的細菌的相對豐度。

11.一種用于評估治療的方法，所述方法包含：

治療患者的醫學疾病；

在治療所述患者的醫學疾病后的預設時間段，從所述患者獲取糞便樣品；

量化來自所述糞便樣品中的選定的綱類組的細菌相的對豐度；

根據來自所述選定的綱類組的細菌的相對豐度，計算微生物組健康指數；以及

確定治療所述患者的醫學疾病的成功與否。

12.如權利要求11所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自擬桿菌綱的細菌。

13.如權利要求11-12任一項所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自梭菌綱的細菌。

14.如權利要求11-13任一項所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自γ-變形菌綱的細菌。

15.如權利要求11-14任一項所述的方法，其中所述選定的綱類組包括來自芽孢桿菌綱的細菌。

16.如權利要求11-15任一項所述的方法，其中所述計算微生物組健康指數包括確定相對細菌豐度的第一總數，所其等于第一綱細菌的第一相對豐度和第二綱細菌的第二相對豐度之和；

確定所述相對細菌豐度的第二總數，其等于第三綱細菌的第三相對豐度與第四綱細菌的第四相對豐度之和；

將所述相對細菌豐度的第一總數除以所述相對細菌豐度的第二總數。

17.如權利要求16所述的方法，其中細菌的所述第一相對豐度是來自所述糞便樣品中擬桿菌綱的細菌的相對豐度。

18.如權利要求16-17任一項所述的方法，其中所述細菌的第二相對豐度是來自所述糞便樣品中梭菌綱的細菌的相對豐度。