[發明專利]具有熱穩定性增加的突變型逆轉錄酶以及涉及其的產物、方法和用途有效
| 申請號: | 201880038440.2 | 申請日: | 2018-04-10 |
| 公開(公告)號: | CN110709513B | 公開(公告)日: | 2023-10-03 |
| 發明(設計)人: | C.H.貝爾;H.佐貝克;H.瓦爾希;K.安川;M.馬場 | 申請(專利權)人: | 豪夫邁·羅氏有限公司 |
| 主分類號: | C12N9/12 | 分類號: | C12N9/12 |
| 代理公司: | 中國專利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 甘霖;黃希貴 |
| 地址: | 瑞士*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 具有 熱穩定性 增加 突變型 逆轉錄 以及 涉及 產物 方法 用途 | ||
1.一種相對于SEQ ID NO:1的野生型逆轉錄酶(RT)具有增加的熱穩定性的突變型RT,所述突變型RT包含
i)相對于SEQ ID NO:1的野生型RT具有六個氨基酸取代的氨基酸序列,其中
- 在位置32處的Ala被Val取代(A32V);
- 在位置72處的Leu被Arg取代(L72R);
- 在位置286處的Glu被Arg取代(E286R);
- 在位置302處的Glu被Lys取代(E302K);
- 在位置388處的Trp被Arg取代(W388R);和
- 在位置435處的Leu被Arg取代(L435R),或
ii)與i)的氨基酸序列至少95%相同,且具有如i)中定義的六個氨基酸取代的氨基酸序列,
其中所述突變型RT顯示出逆轉錄酶活性。
2.權利要求1的突變型RT,其中所述突變型RT與SEQ ID NO:1的氨基酸序列另外相差在SEQ ID NO:1的N末端處的至多五個氨基酸的缺失、和/或在SEQ ID NO:1的C末端處的至多五個氨基酸的缺失。
3.權利要求1或2的突變型RT,其中所述突變型RT包含氨基酸序列或由氨基酸序列組成,所述氨基酸序列與SEQ ID NO:2的氨基酸序列至少96%、97%、98%或99%,特別是100%相同。
4.權利要求1至3中任一項的突變型RT,其中所述突變型RT具有相對于突變型MM3增加的熱穩定性,其中MM3具有與SEQ ID NO:1的氨基酸序列僅相差三個氨基酸取代的氨基酸序列,其中在位置286處的Glu被Arg取代(E286R),在位置302處的Glu被Lys取代(E302K),并且在位置435處的Leu被Arg取代(L435R)。
5.權利要求1-4中任一項的突變型,其中通過測量在熱處理后,特別是在60℃下溫育10分鐘后測量的突變型的逆轉錄酶活性來測定熱穩定性,和/或其中相對于野生型或突變型MM3,熱穩定性增加至少10%、20%、30%或40%,優選至少50%。
6.權利要求1-5中任一項的突變型,其中所述突變型RT的逆轉錄酶活性是野生型的逆轉錄酶活性的至少50%,特別是至少60%,更特別是至少70%,尤其是至少80%,和/或其中所述逆轉錄酶活性通過在37℃下RT介導的dTTP摻入來確定。
7.權利要求1至6中任一項的突變型RT,其與另外的蛋白質融合。
8.一種核酸,其編碼權利要求1至7中任一項的突變型RT。
9.一種細胞,其包含權利要求1至7中任一項的突變型RT或權利要求8的核酸。
10.一種用于執行逆轉錄的試劑盒,其包含權利要求1至7中任一項的突變型RT。
11.權利要求1至7中任一項的突變型RT用于cDNA合成的用途。
12.一種用于RNA逆轉錄的方法,所述方法包括使用權利要求1至7中任一項的突變型RT,從RNA合成cDNA。
13.一種用于檢測樣品中的RNA標記物的方法,
a)在有助于突變型RT活性的條件下,使樣品與權利要求1至7中任一項的突變型RT接觸;
b)使用所述突變型RT,從所述RNA標記物合成cDNA;和
c)檢測步驟b)中合成的cDNA的存在,從而檢測所述樣品中的RNA標記物。
14.權利要求13的方法,其中所述樣品選自體液、血液、血漿、血清、尿、膽汁、腦脊髓液、拭子、臨床樣本、器官樣品和組織樣品,和/或其中所述樣品已得自細胞培養物、懷疑被污染的來源或受試者,特別地其中所述受試者選自人、動物和植物,尤其是人。
15.權利要求13或14的方法,其中所述RNA標記物指示微生物、細胞、病毒、細菌、真菌、哺乳動物物種、遺傳狀況或疾病。
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