[發明專利]一種檢測CYP2C19基因多態性的檢測位點、引物組合物及其應用有效
| 申請號: | 201811645770.6 | 申請日: | 2018-12-30 |
| 公開(公告)號: | CN111378739B | 公開(公告)日: | 2021-01-22 |
| 發明(設計)人: | 邵鳳;周素鳳;朱佑民;鄧文杰;孫健;王璐;楊平 | 申請(專利權)人: | 南京醫科大學第一附屬醫院;蘇州泓迅生物科技股份有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京品源專利代理有限公司 11332 | 代理人: | 鞏克棟 |
| 地址: | 210029 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 cyp2c19 基因 多態性 引物 組合 及其 應用 | ||
1.一種檢測CYP2C19基因多態性的引物組合物,其特征在于,所述引物組合物為針對CYP2C19*2的12662 AG的特異性上下游引物、針對CYP2C19*3的87313 AC的特異性上下游引物和針對CYP2C19*17的3402 CT的特異性上下游引物的組合;
其中,所述針對CYP2C19*2的12662 AG的特異性上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.1-2所示,所述針對CYP2C19*3的87313 AC的特異性上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.3-4所示,所述針對CYP2C19*17的3402 CT的特異性上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.5-6所示。
2.一種如權利要求1所述的引物組合物用于制備藥物和/或試劑盒的應用。
3.一種基因多態性檢測試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求1所述的引物組合物。
4.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括添加了Mg2+的PCR緩沖液、模板、dNTPs、Taq酶和去離子水。
5.根據權利要求4所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括陽性對照和陰性對照;
其中,所述陰性對照為去離子水,所述陽性對照為同時含有CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17多態性的突變體Mutant質粒和野生型Wild type質粒;
其中,所述野生型Wild type的序列如SEQ ID NO.7所示,所述同時含有CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17多態性的突變體Mutant的序列為SEQ ID NO.8。
6.一種檢測體系,其特征在于,所述檢測體系包括權利要求1所述的引物組合物。
7.根據權利要求6所述的檢測體系,其特征在于,所述檢測體系還包括添加了Mg2+的PCR緩沖液、模板、dNTPs、Taq酶和去離子水;
所述dNTPs的濃度為0.8-1.2 mM;
所述引物組合物的每條引物的濃度為0.8-1.2pmol/μL;
所述Taq酶的濃度為0.1-0.3 U/μL;
所述模板的濃度為1.4-1.8ng/μL。
8.根據權利要求7所述的檢測體系,其特征在于,所述檢測體系還包括陽性對照和陰性對照;
其中,所述陰性對照為去離子水,所述陽性對照為同時含有CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17多態性的突變體Mutant質粒和野生型Wild type質粒;
其中,所述野生型Wild type的序列如SEQ ID NO.7所示,所述同時含有CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17多態性的突變體Mutant的序列為SEQ ID NO.8。
9.根據權利要求6-8中任一項所述的檢測體系,其特征在于,所述檢測體系的檢測方法包括多重PCR法。
10.一種檢測CYP2C19基因多態性的非診斷目的的方法,其特征在于,所述方法采用權利要求1所述的引物組合物、權利要求3-5中任一項所述的試劑盒或權利要求6-9中任一項所述的檢測體系。
11.根據權利要求10所述的方法,其特征在于,所述方法的PCR條件為:96℃ 2min 預變性;96℃ 15s,58℃ 15s,72℃ 40s,30個循環;72℃ 5min,1個循環;4℃保藏。
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