[發明專利]基于甲基化修飾的腫瘤標記物STAMP-EP6

有效

• 申請號: 201811634947.2
• 申請日: 2018-12-29
• 公開（公告）號: CN109652541B
• 公開（公告）日: 2022-09-06
• 發明（設計）人: 李振艷;羅懷兵
• 申請（專利權）人: 上海奕譜生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 陳靜

1.檢測分離的多核苷酸的CpG位點甲基化水平的試劑在制備檢測腫瘤的試劑或試劑盒中的用途，所述分離的多核苷酸選自(a)-(d)：

(a) SEQ ID NO: 1所示核苷酸序列的多核苷酸；

(b) SEQ ID NO: 1中第226～250位所示的多核苷酸片段；

(c) 與(a)的多核苷酸完全互補的多核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO: 3所示；

(d) 與(b)的多核苷酸片段完全互補的多核苷酸片段；

所述腫瘤為肝癌、乳腺癌、白血病、結直腸癌、肺癌、胰腺癌或食管癌。

2.如權利要求1所述的用途，其特征在于，所述檢測分離的多核苷酸的CpG位點甲基化水平的試劑是引物或探針。

3. 如權利要求2所述的用途，其特征在于，所述引物是核苷酸序列如SEQ ID NO: 7和SEQ ID NO: 8的引物。

4. 如權利要求2所述的用途，其特征在于，所述引物是核苷酸序列如SEQ ID NO: 5和SEQ ID NO: 6的引物。

5.如權利要求1所述的用途，其特征在于，將選自(a)-(d)的多核苷酸進行轉變，使其修飾的CpG位點的胞嘧啶C不變、非修飾的胞嘧啶轉為T或U；之后進行檢測。

6. 如權利要求5所述的用途，其特征在于，將(a)的多核苷酸進行轉變后，獲得SEQ IDNO: 2所示核苷酸序列的多核苷酸。

7. 如權利要求5所述的用途，其特征在于，將(c)中的多核苷酸進行轉變后，獲得SEQID NO: 4所示核苷酸序列的多核苷酸。

8. 如權利要求1所述的用途，其特征在于，所述腫瘤的樣本包括：石蠟包埋樣本、血液樣本、胸腔積液樣本以及肺泡灌洗液樣本、腹水及 灌洗液樣本、膽汁樣本、糞便樣本、尿液樣本、唾液樣本、痰液樣本、腦脊液樣本、細胞涂片樣本、宮頸刮片或刷片樣本、組織及細胞活檢樣本。

9.一種制備腫瘤檢測試劑的方法，其特征在于，所述方法包括：提供選自(a)-(d)的分離的多核苷酸：

(a) SEQ ID NO: 1所示核苷酸序列的多核苷酸；

(b) SEQ ID NO: 1中第226～250位所示的多核苷酸片段；

(c) 與(a)的多核苷酸完全互補的多核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO: 3所示；

(d) 與(b)的多核苷酸片段完全互補的多核苷酸片段；

以所述多核苷酸作為靶序列，設計特異性檢測該靶序列的CpG位點修飾情況的檢測試劑；

所述腫瘤為肝癌、乳腺癌、白血病、結直腸癌、肺癌、胰腺癌或食管癌。

10.如權利要求9所述的方法，其特征在于，所述的檢測試劑包括：引物或探針。

11. 如權利要求10所述的方法，其特征在于，所述檢測試劑為是核苷酸序列如SEQ IDNO: 5和6所示的引物。

12. 如權利要求10所述的方法，其特征在于，所述檢測試劑為是核苷酸序列如SEQ IDNO: 7和8所示的引物。

13.一種體外檢測樣品的甲基化譜式的方法，所述的方法不是診斷性的方法，其特征在于，包括：

(i) 提供樣品，提取核酸；

(ii) 檢測(i)的核酸中靶序列的CpG位點修飾情況，所述的靶序列是選自(a)-(d)的分離的多核苷酸：

(a) SEQ ID NO: 1所示核苷酸序列的多核苷酸；

(b) SEQ ID NO: 1中第226～250位所示的多核苷酸片段；

(c) 與(a)的多核苷酸完全互補的多核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO: 3所示；

(d) 與(b)的多核苷酸片段完全互補的多核苷酸片段。