[發明專利]一種鑒定雙季茭白早晚熟特性的分子標記及其應用、獲取方法

在審

• 申請號: 201811572101.0
• 申請日: 2018-12-21
• 公開（公告）號: CN109439793A
• 公開（公告）日: 2019-03-08
• 發明（設計）人: 張雅芬;葉子弘;葛鑫濤;夏文強;俞曉平;崔海峰
• 申請（專利權）人: 中國計量大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 杭州浙科專利事務所(普通合伙) 33213
• 代理人: 吳秉中

一種鑒定雙季茭白早晚熟特性的分子標記及其應用、獲取方法，屬于分子生物學技術領域。該鑒定雙季茭白早晚熟特性的分子標記包括分子標記UeS1、UeS2、UeS3、UeS4、UeS5、UeS6、UeS7和UeS8。本發明通過SNP標記篩選早熟或特晚熟品種，可以對優良雙季茭白品種提早選擇，減少工作量，提高篩選效率。

技術領域

本發明屬于分子生物學技術領域，具體涉及一種鑒定雙季茭白早晚熟特性的分子標記及其應用、獲取方法。

背景技術

茭白(Zizania latifolia Turcz.)為禾本科多年生宿根草本植物,原產于我國和東南亞地區，是我國的第二大水生蔬菜。茭白在我國早有栽培，西周之前，茭白的種子被作為糧食食用，后因發現其莖部被菰黑粉菌(Ustilago esculenta)感染而形成的菌癭不僅可以食用，而且肉質肥嫩、口感極佳，而被當成一種蔬菜食用，唐朝末期開始被作為一種蔬菜廣泛種植。除了作為蔬菜，茭白也可藥用，具有利尿止渴、清熱解毒之功效。雙季茭是目前廣泛種植于浙江、江蘇、福建等地的茭白，一年兩熟，相比于單季茭，具有較高的經濟效益。茭白在市場上的價格隨著時間波動較大，一般早熟和特晚熟的雙季茭白收益較高，因此孕育早熟或特晚熟的茭白是目前選育茭白品種的一個重要方向。鑒于茭白的無性繁殖特性，現有研究一直沒有找到合適的分子標記對茭白植株進行分析鑒定，即不同品種茭白植株間的差異化與其品種特性相關性較小。而有研究發現，菰黑粉菌的存在才是茭白形成的關鍵因素，對菰黑粉菌的生物學特性、培養條件、細胞學觀察及分子進化等方面進行研究發現：不同品種茭白中菰黑粉菌的表型差異明顯，且茭白品種中單雙季，雙季茭中的夏秋茭，其內生的菰黑粉菌屬于不同的進化分支，表明菰黑粉菌的差異性與茭白品種特性密切相關。而不同菌對溫度的適應性、與宿主的相互作用等特性都是該菌是否能順利入侵及其潛育時間長短的決定因素，對品種早晚熟的影響較大。因此，我們推測菰黑粉菌與茭白早晚熟特性的形成密切相關，因此有必要對不同品種中菰黑粉菌的遺傳多樣性及其與早晚熟特性的關系進行研究，從而達到茭白輔助選育的目的。

SNP標記的原理是：生物體內經常發生單核苷酸變異(缺失，插入，移碼)，這種變異的結果成為單核苷酸多態性。盡管SNPs大多位于非編碼區，但與生物體表型有非常密切的關系。隨著高通量測序技術的發展，大量的SNPs被解析出來，也極大地推動了基因組層面評估遺傳多樣性的研究。由于SNP數據量非常龐大，因此基于SNP開發的分子標記具有較高的精準度。

發明內容

針對現有技術存在的問題，本發明的目的在于設計提供一種鑒定雙季茭白早晚熟特性的分子標記及其應用、獲取方法的技術方案。本發明通過對茭白內生菰黑粉菌作SNP掃描，篩選出多個與雙季茭白早晚熟特性相關的分子標記，從而建立起雙季茭白早晚熟分子標記輔助選擇體系，提高早熟茭白品種和特晚熟茭白品種的選擇效率，為茭白高效選育奠定基礎。