[發(fā)明專(zhuān)利]植物乳桿菌菌株的鑒定方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201811427912.1 | 申請(qǐng)日: | 2018-11-27 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN109266771A | 公開(kāi)(公告)日: | 2019-01-25 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 張紅發(fā);劉振民;游春蘋(píng);扶曉菲 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 光明乳業(yè)股份有限公司 |
| 主分類(lèi)號(hào): | C12Q1/689 | 分類(lèi)號(hào): | C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/25 |
| 代理公司: | 北京東正專(zhuān)利代理事務(wù)所(普通合伙) 11312 | 代理人: | 蔡仲德 |
| 地址: | 201103 *** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書(shū): | 查看更多 | 說(shuō)明書(shū): | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 酶切 植物乳桿菌菌株 乳桿菌菌株 基因組DNA 待測(cè)菌株 基因片段 雙酶切 菌株 質(zhì)粒 植物乳桿菌 鑒定植物 特異性強(qiáng) 同源性 種植物 測(cè)序 克隆 轉(zhuǎn)化 應(yīng)用 分析 | ||
1.一種植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,該方法包括以下步驟:
(1)提取待測(cè)菌株基因組DNA,雙酶切基因組DNA,得到酶切后的基因片段;
(2)選取pMD18-T質(zhì)粒載體,雙酶切后,得到酶切后的質(zhì)粒;
(3)將酶切后的基因片段與酶切后的質(zhì)粒連接,轉(zhuǎn)化,克隆,測(cè)序,獲得至少7條序列;
(4)將獲得的序列進(jìn)行BLAST比對(duì)分析,每條序列對(duì)應(yīng)多個(gè)同源性高的菌株,如果任意7條序列對(duì)應(yīng)的共有菌株僅為植物乳桿菌,就鑒定待測(cè)菌株為植物乳桿菌菌株。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(1)中,將待測(cè)菌株劃線培養(yǎng)后獲得單菌落,挑取單菌落經(jīng)純培養(yǎng)離心收集菌體,液氮粉碎菌體后提取基因組DNA。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(1)中,雙酶切所用的酶為PstI內(nèi)切酶和BamH內(nèi)切酶。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(1)中,雙酶切后,將酶滅活,然后過(guò)柱純化。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(2)中,在氨芐抗性LB平板上,挑取載體pMD18-T自連質(zhì)粒,然后進(jìn)行液體擴(kuò)培。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(2)中,使用依賴于ATP的線性DNA分解酶純化質(zhì)粒。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(3)中,酶切后的基因片段與酶切后的質(zhì)粒使用T4DNA連接酶進(jìn)行連接。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(3)中,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入大腸桿菌DH5a感受態(tài)細(xì)胞,使用氨芐青霉素進(jìn)行抗性篩選。
9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(3)中,將轉(zhuǎn)化子抽提質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定,將鑒定為陽(yáng)性的轉(zhuǎn)化子送樣測(cè)序。
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的植物乳桿菌菌株的鑒定方法,其特征在于,步驟(4)中,將獲得的序列在NCBI網(wǎng)站上進(jìn)行比對(duì)分析。
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