[發明專利]一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物及應用

有效

• 申請號: 201811298426.4
• 申請日: 2018-11-02
• 公開（公告）號: CN109576365B
• 公開（公告）日: 2022-05-17
• 發明（設計）人: 馬駿;陳雨沛;柳娜;王雅琴;呂佳蔚;黎映琴;孫穎;唐玲瓏;毛燕萍;陳磊;周冠群;郭蕊
• 申請（專利權）人: 中山大學腫瘤防治中心（中山大學附屬腫瘤醫院;中山大學腫瘤研究所）
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 胡輝

本發明公開了一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物及應用，其中113個基因組成的標志物可有效對患者分為免疫型與非免疫型，進一步結合由48個基因組成標志物，可將患者區分為免疫激活型，免疫耗竭型，與非免疫型三個亞組。通過實驗證實了免疫型，特別是免疫激活型患者可從免疫治療中獲益。進一步分析了不同免疫亞型的預后，發現免疫型患者預后較非免疫型患者更好，而將免疫型患者拆分為免疫激活與免疫耗竭型后，發現免疫激活型患者預后最好。

技術領域

本發明涉及一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物及應用。

背景技術

頭頸腫瘤是世界范圍內第六大常見惡性腫瘤，發病率/死亡率都位居所有腫瘤的前十位，頭頸部鱗癌是屬于頭頸部腫瘤中最常見的一種類型，約占頭頸部腫瘤的90％。根據不同的臨床分期，頭頸腫瘤的目前治療方式亦不相同，主要是以手術或放療為核心，輔以化療、靶向治療等多學科綜合治療。隨著治療方式的革新以及規范化治療的推行，早期頭頸腫瘤患者的生存率以及生活質量都獲得了提高，然而中晚期頭頸腫瘤患者的預后仍舊不佳。因此，延長頭頸腫瘤患者，特別是分期較嚴重的中晚期患者的生存時間，提高治療相關的生活質量，成為頭頸腫瘤治療研究的焦點之一。

近些年，腫瘤免疫治療取得飛速發展，引領了腫瘤治療領域的重大突破，特別以PD-1/PD-L1為代表的免疫檢查點抑制劑是目前腫瘤免疫治療較為成功的領域以及研究的熱點。相關免疫治療藥物，如抗PD-1單抗Nivolumab和Pembrolizumab等均在臨床試驗中證實可有效提高晚期頭頸部腫瘤患者的生存率，并已被美國FDA獲批用于頭頸部腫瘤患者的治療，使得頭頸部腫瘤患者在治療中獲得更大的獲益。然而免疫治療僅對部分患者有效，亟需特異性的生物標志物能夠篩選合適的頭頸腫瘤患者，接受免疫治療，提高治療獲益，避免過度治療，最終達到精準醫療。而目前仍然缺乏可有效預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物。

發明內容

本發明的目的在于提供一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物及應用。

本發明所采取的技術方案是：

一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物，包括如下113個基因：SCML4、TTC16、KIR2DL3、ART4、LINC00426、C15orf53、HEATR9、KIR2DL1、TRAT1、IL27、SLFN14、KEL、CXCR2P1、KIR3DL2、GBP7、BTN1A1、IFNG、CLEC6A、LINC00494、ITIH1、CLECL1、GHRL、C4orf50、WDR64、PLA2G2D、CR1L、OR52N4、TTLL6、FCRL6、PIK3CD-AS1、UPK3A、KIF25、LILRA4、RTP5、CLEC4C、KIR2DS4、C9orf139、DBH、FCER2、CCR9、CD40LG、NCR1、CCL25、RHOXF1、GPR174、TIMD4、IL26、AICDA、KCNJ10、FAM129C、WNT1、FAM180B、KLRC3、CNR2、LINC00158、XKR4、IDO2、FCRL2、FAM92B、ZFR2、PTCRA、DNAJC5B、DNAH8、OCM、GPR25、KLRC4、KIR3DL1、DNASE2B、TCL1A、LOC100240735、IL13、PSMA8、CLEC9A、NME8、BCORP1、NCR2、IL12B、LILRP2、KCNA2、CCKAR、CLNK、FCRL4、SLC18A1、CRYBA4、TNFRSF13B、SSTR3、CR2、LCNL1、TTC24、ITGAD、IL17REL、DAZL、ZNF80、CXorf65、BEND4、FCAMR、CD19、HSF5、FNDC9、TUSC5、ARRDC5、GTSF1L、ATP1A4、CCL1、BFSP2、FCRL1、IL5RA、AIRE、MS4A1、UNQ6494、FAM177B、NPHS1、ASCL4、FAM216B、FRMD1。

進一步地，通過檢測腫瘤組織中標志物的mRNA表達情況，并對其進行非負矩陣分解一致性聚類法二聚類可將頭頸部腫瘤患者分成免疫型患者與非免疫型患者。