[發明專利]一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物及應用

有效

• 申請號: 201811298426.4
• 申請日: 2018-11-02
• 公開（公告）號: CN109576365B
• 公開（公告）日: 2022-05-17
• 發明（設計）人: 馬駿;陳雨沛;柳娜;王雅琴;呂佳蔚;黎映琴;孫穎;唐玲瓏;毛燕萍;陳磊;周冠群;郭蕊
• 申請（專利權）人: 中山大學腫瘤防治中心（中山大學附屬腫瘤醫院;中山大學腫瘤研究所）
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 胡輝

1.一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物，其特征在于：由如下115個基因組成：SCML4、TTC16、KIR2DL3、ART4、LINC00426、C15orf53、HEATR9、KIR2DL1、TRAT1、IL27、SLFN14、KEL、CXCR2P1、KIR3DL2、GBP7、BTN1A1、IFNG、CLEC6A、LINC00494、ITIH1、CLECL1、GHRL、C4orf50、WDR64、PLA2G2D、CR1L、OR52N4、TTLL6、FCRL6、PIK3CD-AS1、UPK3A、KIF25、LILRA4、RTP5、CLEC4C、KIR2DS4、C9orf139、DBH、FCER2、CCR9、CD40LG、NCR1、CCL25、RHOXF1、GPR174、TIMD4、IL26、AICDA、KCNJ10、FAM129C、WNT1、FAM180B、KLRC3、CNR2、LINC00158、XKR4、IDO2、FCRL2、FAM92B、ZFR2、PTCRA、DNAJC5B、DNAH8、OCM、GPR25、KLRC4、KIR3DL1、DNASE2B、TCL1A、LOC100240735、IL13、PSMA8、CLEC9A、NME8、BCORP1、NCR2、IL12B、LILRP2、KCNA2、CCKAR、CLNK、FCRL4、SLC18A1、CRYBA4、TNFRSF13B、SSTR3、CR2、LCNL1、TTC24、ITGAD、IL17REL、DAZL、ZNF80、CXorf65、BEND4、FCAMR、CD19、HSF5、FNDC9、TUSC5、ARRDC5、GTSF1L、ATP1A4、CCL1、BFSP2、FCRL1、IL5RA、AIRE、MS4A1、UNQ6494、FAM177B、NPHS1、ASCL4、FAM216B、FRMD1；所述頭頸部腫瘤為頭頸部鱗癌；通過檢測腫瘤組織中標志物將頭頸部腫瘤患者分成免疫型患者與非免疫型患者；所述免疫型為可有更大可能從免疫治療中獲益；所述非免疫治療為較低可能從免疫治療中獲益。

2.根據權利要求1所述的預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物，其特征在于：通過檢測腫瘤組織中標志物的mRNA表達情況，并對其進行非負矩陣分解一致性聚類法二聚類可將頭頸部腫瘤患者分成免疫型患者與非免疫型患者。

3.一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物，其特征在于：由權利要求1所述的標志物和如下48個基因組成，其中48個基因為：CTHRC1、POSTN、FAP、COL10A1、COL1A2、COL1A1、ITGA11、GREM1、FN1、SFRP2、COL11A1、MMP11、INHBA、VCAN、LUM、COL3A1、COMP、FNDC1、THBS2、SPARC、COL5A2、COL5A1、SULF1、CDH11、ZNF469、ABCA8、ACTG2、ADAMTS1、ANGPTL7、CDH19、DES、FABP4、GPM6B、ID4、IGF1、LMOD1、MEOX2、MYH11、OGN、PLP1、PTX3、RBPMS2、RERGL、RSPO3、SCRG1、SYNM、VIT、LPHN3；所述頭頸部腫瘤為頭頸部鱗癌；通過檢測腫瘤組織中權利要求1所述的標志物將頭頸部腫瘤患者分成免疫型患者與非免疫型患者；所述免疫型為可有更大可能從免疫治療中獲益；所述非免疫治療為較低可能從免疫治療中獲益；再通過檢測48個基因將免疫型患者分成免疫耗竭型患者和免疫激活型患者；所述免疫耗竭型為間質激活；所述免疫激活型為間質非激活。

4.根據權利要求3所述的預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的標志物，其特征在于：通過檢測腫瘤組織中權利要求1所述的標志物的mRNA表達情況，并對其進行非負矩陣分解一致性聚類法二聚類可將頭頸部腫瘤患者分成免疫型患者與非免疫型患者；再通過檢測權利要求3中的48個基因在腫瘤組織中的mRNA表達情況，使用最近模板預測法可進一步將免疫型患者分成免疫耗竭型患者和免疫激活型患者。

5.一種預測頭頸部腫瘤免疫治療療效的試劑盒，其特征在于：該試劑盒中含有用于檢測權利要求1所述的預測腫瘤免疫治療療效的標志物的mRNA表達情況的試劑；所述頭頸部腫瘤為頭頸部鱗癌。