[發明專利]一種多鱗鯔鰕虎魚線粒體基因組全序列引物及設計、系統進化分析全序列擴增方法有效
| 申請號: | 201811296202.X | 申請日: | 2018-11-01 |
| 公開(公告)號: | CN109321664B | 公開(公告)日: | 2022-03-25 |
| 發明(設計)人: | 龔理;姜輝;劉炳艦;呂振明;劉立芹 | 申請(專利權)人: | 浙江海洋大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12N15/11;C12N15/10;G16B30/10 |
| 代理公司: | 杭州杭誠專利事務所有限公司 33109 | 代理人: | 尉偉敏 |
| 地址: | 316100 浙江省舟山市普陀區普*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 多鱗鯔鰕虎魚 線粒體 基因組 序列 引物 設計 系統 進化 分析 擴增 方法 | ||
1.一種多鱗鯔鰕虎魚線粒體基因組全序列引物,其特征在于,所述的多鱗鯔鰕虎魚線粒體基因組全序列引物包括十二對引物:其中
第一對引物:
正向引物如SEQ ID NO.1所示:5’- TAAAGCATAACHCTGAAGATGTTAA - 3’
反向引物如SEQ ID NO.2所示:5’- GATAGAAACTGACCTGGATTACT - 3’
第二對引物:
正向引物如SEQ ID NO.3所示:5’- AACHCTGAAGATGTTAAGAT - 3’
反向引物如SEQ ID NO.4所示:5’- TAAGAATGCAACAGCTAGCAGA - 3’
第三對引物:
正向引物如SEQ ID NO.5所示:5’- TACGACCTCGATGTTGGATCAGG - 3’
反向引物如SEQ ID NO.6所示:5’-GCGGTGGATTGTAGACCCATARACAGAGGT- 3’
第四對引物:
正向引物如SEQ ID NO.7所示:5’- TTAAGGTGGCAGAGCCCGGTA - 3’
反向引物如SEQ ID NO.8所示:5’- CAGCTAGCCCTAGGAAGTGTTG - 3’
第五對引物:
正向引物如SEQ ID NO.9所示:5’- RCGCCCAAAGCTAGDATTC - 3’
反向引物如SEQ ID NO.10所示:5’- GGCCCATCTTAACATCTTC - 3’
第六對引物:
正向引物如SEQ ID NO.11所示:5’- CTAAGCCATCCTACCTGTG - 3’
反向引物如SEQ ID NO.12所示:5’- TCAACTCCTCCCTTTCTCG - 3’
第七對引物:
正向引物如SEQ ID NO.13所示:5’- GGCCCATCTTAACATCTTC - 3’
反向引物如SEQ ID NO.14所示:5’- TTTAACCAAGACCRGGTGATTGGAAGTC - 3’
第八對引物:
正向引物如SEQ ID NO.15所示:5’- YGAAGCAGCCGCMTGATACTGACA - 3’
反向引物如SEQ ID NO.16所示:5’- TAGCTGCTACTCGGATTTGCACCAAGAGT - 3’
第九對引物:
正向引物如SEQ ID NO.17所示:5’- TGAATCGACTGGCAATGTCC - 3’
反向引物如SEQ ID NO.18所示:5’- GGAGGWATACCTGTAGAAGA - 3’
第十對引物:
正向引物如SEQ ID NO.19所示:5’-AAGGATAACAGCTCATCCGTTGGTCTTAGG - 3’
反向引物如SEQ ID NO.20所示:5’- AAACTGCAGCCCCTCAGAATGATATTTGTCCTCA - 3’
第十一對引物:
正向引物如SEQ ID NO.21所示:5’- GATAACAGCTCATCCGTTGGTC - 3’
反向引物如SEQ ID NO.22所示:5’- ACAGAACTGCTTGGAGGG - 3’
第十二對引物:
正向引物如SEQ ID NO.23所示:5’- CGAAGCTTGATATGAAAAACCATCGTTG - 3’
反向引物如SEQ ID NO.24所示:5’- GTAAAGTCAGGACCAAGCCTT - 3’;
其中H=A/C/T、R=A/G、D=A/G/T、Y=C/T、M=A/C、W=A/T;
采用上述多鱗鯔鰕虎魚線粒體基因組全序列引物,以多鱗鯔鰕虎魚線粒體基因組DNA為模板 ,進行PCR擴增,擴增條件為:90℃預變性5min,隨后95℃變性40s,56℃退火30s,73℃延伸1~4min,共進行35個循環,最后進行73℃延伸10min,4℃條件下保存。
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