[發明專利]抗稻瘟病基因Pid3-A4的InDel分子標記物、檢測方法及應用有效
| 申請號： | 201811115351.1 | 申請日： | 2018-09-25 |
| 公開（公告）號： | CN108913809B | 公開（公告）日： | 2020-12-25 |
| 發明（設計）人： | 呂啟明;黃志遠;唐麗;辛業蕓;朱立煌 | 申請（專利權）人： | 湖南雜交水稻研究中心 |
| 主分類號： | C12Q1/6895 | 分類號： | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04 |
| 代理公司： | 長沙智嶸專利代理事務所(普通合伙) 43211 | 代理人： | 劉宏 |
| 地址： | 410125 湖南省*** | 國省代碼： | 湖南;43 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 稻瘟病 基因 pid3 a4 indel 分子 標記 檢測 方法 應用 | ||
1.一種抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的InDel分子標記物，其特征在于，
包括InDel分子標記物PA4-C，所述InDel分子標記物PA4-C用于從水稻材料中鑒定并篩選出在編碼區前1815位堿基處存在一段9bp缺失的功能基因Pid3-A4的水稻材料；
所述9bp缺失序列為：CCCTGAAGA；
所述InDel分子標記物PA4-C包括引物PA4-CF和引物PA4-CR，其序列分別為：
引物PA4-CF：CACATGTGCTAATGGTGGATTAAAC，
引物PA4-CR：AGCCGTGTAATTAGGTAGGTCA。
2.一種檢測抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的方法，其特征在于，利用權利要求1所述抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的InDel分子標記物對抗稻瘟病功能基因Pid3-A4進行檢測。
3.根據權利要求2所述的檢測抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的方法，其特征在于，包括以下步驟：
提取水稻樣品基因組DNA；
利用InDel分子標記物PA4-C對水稻樣品基因組DNA進行PCR擴增，所述PCR擴增產物進行電泳檢測，所述PCR擴增產物為一條212bp標記片段，標志所述水稻樣品基因組存在抗稻瘟病功能基因Pid3-A4，其它不含Pid3-A4功能基因的水稻樣品擴增出一條221bp標記片段。
4.一種權利要求1所述的抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的InDel分子標記物的應用，其特征在于，所述InDel分子標記物的用于鑒定水稻植株染色體中的Pid3-A4基因是純合型還是雜合型。
5.根據權利要求4所述的抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的InDel分子標記物的的應用，其特征在于，包括以下步驟：
提取水稻植株的基因組DNA，用InDel分子標記物PA4-C對所述水稻植株的基因組DNA進行PCR擴增，所述PCR擴增產物進行電泳檢測；
所述PCR擴增產物是212bp的單一標記片段，標志著水稻植株染色體中的Pid3-A4基因為純合型；
所述PCR擴增產物是包含一個212bp片段和一個221bp片段，標志著水稻植株染色體中的Pid3-A4基因為雜合型。
6.一種權利要求1所述的抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的InDel分子標記物在特定親本選育抗稻瘟病水稻中的應用，其特征在于，包括以下步驟：
將攜帶稻瘟病功能基因Pid3-A4的水稻抗稻瘟病品種或其衍生系與其他水稻品種雜交或回交并繁衍后代群體；
提取獲得群體中單個植株的基因組DNA，用InDel分子標記物PA4-C進行PCR擴增，所述PCR擴增出一個212bp的標記片段，標志檢測水稻植株存在抗稻瘟病功能基因Pid3-A4。
7.一種權利要求1所述的抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的InDel分子標記物在種質資源選育抗稻瘟病水稻中的應用，其特征在于，包括以下步驟：
將供試水稻材料的單個植株提取基因組DNA，用InDel分子標記物PA4-C進行PCR擴增，所述PCR擴增出一個212bp的標記片段，標志檢測水稻植株存在抗稻瘟病功能基因Pid3-A4。
8.一種權利要求1所述的抗稻瘟病功能基因Pid3-A4的InDel分子標記物的應用，其特征在于，InDel分子標記物用于水稻聚合多抗病基因材料育種。
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