[發(fā)明專利]一種快速檢測遺傳性皮膚敏感基因的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201811078422.5 | 申請日: | 2018-09-10 |
| 公開(公告)號: | CN109182476A | 公開(公告)日: | 2019-01-11 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 王亮;趙紹軍;蔣桂瑾 | 申請(專利權(quán))人: | 廣州益養(yǎng)生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6858 | 分類號: | C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 510000 廣東省廣州市國際生物島螺旋*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 快速檢測 敏感基因 遺傳性 檢測 分子生物學(xué)領(lǐng)域 皮膚 熔解曲線分析 標準基因型 待檢測樣本 待檢測樣品 特異性引物 高分辨率 基因型 突變型 野生型 雜合型 位點 突變 分析 基因 | ||
本發(fā)明為一種快速檢測遺傳性皮膚敏感基因的方法,涉及分子生物學(xué)領(lǐng)域。本發(fā)明涉及檢測三個基因、四個SNP位點,提供四個待檢測位點的檢測用特異性引物(詳見表1)。本發(fā)明采用高分辨率熔解曲線分析技術(shù)(High Resolution Melting,HRM)以分析待檢測樣本的各SNP位點基因型。為輔助分析待檢測樣品的基因型,本發(fā)明還將提供各SNP位點對應(yīng)標準基因型模板(含野生型、突變雜合型及突變型)。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明為一種快速檢測遺傳性皮膚敏感基因的方法,涉及分子生物學(xué)領(lǐng)域,尤其針對美膚行業(yè)膚質(zhì)評測。
背景技術(shù)
目前,常用的基因檢測方法為測序法、基因芯片法、飛行質(zhì)譜法,這些方法都需要在完成PCR擴增后進行后續(xù)實驗分析,實驗周期相對較長,適用于中、高通量的SNP檢測。使用支持高分辨率熔解曲線分析技術(shù)(High Resolution Melting,HRM)的儀器僅需要一次PCR擴增后即可根據(jù)擴增產(chǎn)物直接進行分析報告得出樣品的基因型,極大的縮短了實驗時長。
HRM是一種基于單核苷酸熔解溫度不同而形成不同形態(tài)熔解曲線的基因分析新技術(shù),具有極高的敏感性,可以檢測出單個堿基的差異,并且成本低、通量高、速度快、結(jié)果準確、不受檢測位點的局限,實現(xiàn)了真正的閉管操作。
HRM無需使用序列特異性探針,而是利用一種飽和染料對PCR反應(yīng)產(chǎn)物進行分析。基本原理:雙鏈核苷酸(double strand DNA,dsDNA)的熱穩(wěn)定性受具長度和堿基組成的影響,序列變化會導(dǎo)致升溫過程中dsDNA解鏈行為的改變。因為所用的熒光染料只能嵌入并結(jié)合到dsDNA上,因此利用實時PCR技術(shù),通過實時檢測dsDNA熔解過程中熒光信號值的變化,就能以生成不同形狀熔解曲線的方式將PCR產(chǎn)物中存在的差異直觀地展示出來。同時,借助于專業(yè)性的分析軟件就可以對測試群體實現(xiàn)基于不同形狀熔解曲線的基因分型或歸類。
皮膚敏感性主要由皮膚物理屏障作用能力決定的,同時受皮膚免疫屏障作用能力、身體解毒能力影響。皮膚物理屏障作用能力通常由皮脂膜、角質(zhì)層角蛋白、脂質(zhì)、磚墻結(jié)構(gòu)、真皮粘多糖類、粘多糖類等共同構(gòu)成,抵御外界有害、刺激物、日光進入,同時具有保濕及調(diào)節(jié)抗炎作用;皮膚免疫屏障作用能力則由相關(guān)酶調(diào)節(jié)控制免疫細胞,達到抗炎癥效果;身體解毒能力是相關(guān)水解酶參與轉(zhuǎn)化有害物質(zhì)的過程,身體必須及時處理進入皮膚的有害物質(zhì),防止皮膚過敏反應(yīng)。
絲氨酸蛋白酶抑制因子5基因(erine peptidase inhibitor,Kazal type 5,SPINK5)該基因編碼多結(jié)構(gòu)域絲氨酸蛋白酶抑制劑,其含有15個潛在的抑制結(jié)構(gòu)域,對編碼的前體蛋白進行蛋白水解加工以產(chǎn)生多種蛋白質(zhì)產(chǎn)物。這些蛋白質(zhì)多存在皮膚、毛發(fā)以及粘液中保護作用,主要作用為上皮細胞的抗炎和抗微生物。該基因的突變可能導(dǎo)致Netherton綜合征,這是一種以魚鱗病、有缺陷的角質(zhì)化和特應(yīng)性為特征的疾病。
中間絲相關(guān)蛋白(filaggrin,F(xiàn)LG)基因編碼中間絲相關(guān)蛋白,主要的蛋白成分為角蛋白和中間絲相關(guān)蛋白,大約占到80%-90%。中間絲相關(guān)蛋白在皮膚屏障功能中起重要作用,它將最外層皮膚細胞中的結(jié)構(gòu)蛋白結(jié)合在一起,形成緊密的束狀物,使細胞平坦化和強化,形成強大的屏障,在維持表皮屏障的通透性,調(diào)節(jié)皮膚正常pH值,防御微生物對皮膚的侵犯等都起重要作用。
微粒體環(huán)氧化物水解酶(epoxide hydrolase 1,EPHX1)基因編碼合成環(huán)氧化水解酶,環(huán)氧化物水解酶是一種關(guān)鍵的生物轉(zhuǎn)化酶,可將環(huán)氧化物(環(huán)氧化物是高活性的親電子化合物,與DNA和蛋白質(zhì)形成加合物,并且還會導(dǎo)致DHA中的鏈斷裂;因此,環(huán)氧化物可導(dǎo)致基因突變,癌癥和關(guān)鍵蛋白的失活)從芳香族化合物的降解轉(zhuǎn)化為反式二氫二醇(通常沒有毒性或毒性遠低于它們的環(huán)氧化物前體),反式二氫二醇可從體內(nèi)結(jié)合并排出體外。環(huán)氧化物水解酶在環(huán)氧化物的活化和解毒中起作用。
發(fā)明內(nèi)容
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