[發明專利]SDS-PMA-qPCR法檢測乳中無乳鏈球菌活菌的方法在審
| 申請號: | 201811039260.4 | 申請日: | 2018-09-06 |
| 公開(公告)號: | CN109321666A | 公開(公告)日: | 2019-02-12 |
| 發明(設計)人: | 趙艷坤;陳賀;劉慧敏;蔡建星;李進;王成 | 申請(專利權)人: | 新疆農業科學院農業質量標準與檢測技術研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/689 | 分類號: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/10;C12R1/46 |
| 代理公司: | 烏魯木齊合縱專利商標事務所 65105 | 代理人: | 楊涵;湯建武 |
| 地址: | 830091 新疆維吾爾自*** | 國省代碼: | 新疆;65 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 無乳鏈球菌 待測乳樣 提取DNA 活菌 菌體 檢測 假陽性結果 致病菌檢測 技術技術 結果測定 擴增反應 有效促進 準確檢測 含菌量 活細胞 靈敏性 滲透性 死細胞 按下 | ||
1.一種SDS-PMA-qPCR法檢測乳中無乳鏈球菌活菌的方法,其特征在于按下述步驟進行:第一步,待測乳樣處理:將待測乳樣搖勻,取2mL乳樣于EP管中,然后向其中加入SDS母液104μg/mL4μL、加入終濃度為10mg/mL的PMA 2μL得到混合物A,接著將混合物A于40℃恒溫培養箱中避光培養20min,避光培養完成后,繼續將混合物A放入冰水混合鐵桶內浮漂開蓋、用500W鎢絲燈照射10min,照射完成后,將混合物A于1000rpm離心10min得到沉淀A,用1mL生理鹽水洗滌沉淀A,再次離心5min得到沉淀B,用1.9mL TE buffer對沉淀B進行重懸得到懸浮液A,向懸浮液A中加入100μL終濃度為10mg/mL的溶菌酶,置于37℃恒溫培養箱培養30min至60min后,于1000rpm離心10min得到沉淀C;
第二步,DNA提?。合虺恋鞢中加入1mL 2%CTAB裂解液后用移液槍輕吹重懸得到懸浮液B,向懸浮液B加入200mg玻璃珠后密封,進行研磨兩次,然后向其中加入20μL蛋白酶K得到混合物B,將混合物B放入55℃水浴30min,每隔5min混勻一次,再70℃水浴20min,每隔5min混勻一次,接著將水浴后的混合物B于14000rpm離心5min,移取上清液、棄掉沉淀,得到上清液A,向上清液A中加入等體積的DNA提取液得到混合物C,將混合物C于14000rpm離心5min,移取上清液、棄掉沉淀,得到上清液B,向上清液B中加入等體積的DNA提取液得到混合物D,將混合物D于14000rpm離心5min,移取上清液、棄掉沉淀,得到上清液C,向上清液C中加入體積為上清液C0.8倍體積的異丙醇,顛倒混勻得到混合物E,將混合物E于14000rpm離心5min,棄去上清液,留取沉淀,得到沉淀D,用1mL 70%乙醇洗滌沉淀D,并于14000rpm離心10min,棄去上清,留取沉淀,得到沉淀E,將沉淀E于濾紙上干燥20min至30min,揮發乙醇,最后向沉淀E中加入100μL TE buffer重懸溶解DNA得到模板DNA;
第三步,qPCR擴增反應:首先準備引物序列,然后配制qPCR總反應體系,qPCR總反應體系的體積為25μL,qPCR總反應體系包括12.5μL Master Mix、模板DNA 2μL、引物序列中上游引物1μL、引物序列中下游引物1μL、二次蒸餾水8.5μL,配制好qPCR總反應體系后用Nanodrop 1000分光光度計測其中DNA濃度,接著將qPCR總反應體系在如下反應程序下進行30個循環反應:94℃預變性2min,94℃變性30s,50℃退火1min,72℃延伸1min;
第四步,結果測定:用CFX Manager 3.1計算得到標準曲線,將Cq值換算稱logCFU值得到乳中無乳鏈球菌含量,達到定量結果。
2.根據權利要求1所述的SDS-PMA-qPCR法檢測乳中無乳鏈球菌活菌的方法,其特征在于CTAB包括100nM pH為8的Tris-HCL、1.4M Nacl和20nM EDTA。
3.根據權利要求1或2所述的SDS-PMA-qPCR法檢測乳中無乳鏈球菌活菌的方法,其特征在于DNA提取液為酚、氯仿、異丙醇配制而成,其中,按體積比酚:氯仿:異丙醇=25:24:1。
4.根據權利要求1或2所述的SDS-PMA-qPCR法檢測乳中無乳鏈球菌活菌的方法,其特征在于引物序列為:上游引物5'-ATGGGATTTGGGATAACTAAGCTAG-3'、下游引物5'-AGCGTGTATTCCAGATTTCCTTAT-3'。
5.根據權利要求3所述的SDS-PMA-qPCR法檢測乳中無乳鏈球菌活菌的方法,其特征在于引物序列為:上游引物5'-ATGGGATTTGGGATAACTAAGCTAG-3'、下游引物5'-AGCGTGTATTCCAGATTTCCTTAT-3'。
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